| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,896,145 | 0 | G | T | 8.9% | 860.9 / 3.0 | 267 | S306Y (TCC→TAC) | bglB | cryptic phospho‑beta‑glucosidase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (142/81); new base T (3/36); total (145/122) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.54e-11 | |||||||||||
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Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
TTTTTGATAACGATCCCAAAGCGTATTTAACAGAACCCGTAATCCAACCGGATCAATTTGCCACCCCCACTCTGAACTTTTCAGATGCGGATTGGGGATCATATTCAGTATGTTGCCCTGCGCATTTTTATTAATGCTTTCGTCGTGGGAAACACAACCAGTCATGTAATAACTAAAAGAGATGAAATCGACGGTATGTTTTAAATCTTCTGCGTCACTTTCAGTCATCTCAATGGTGATATTGTGGTCGCGGAAGAAACGCTGCATATAGCCGGGATACTGGCCACGCGCCTGAA > CP009273/3895997‑3896292 | tttttGATAACGATCCCAAAGCGTATTTAACAGAACCCGTAATCCAACCGGATCAATTTGCCACCCCCACTCTGAACTTTTCAGATGCGGATTGGGGATCATATTCAGTATGTTGCCCTGCGCATTTTTATTAATGCTTTCGTCGTggg < 2:1996420/149‑1 (MQ=255) ttttGATAACGATCCCAAAGCGTATTTAACAGAACCCGTAATCCAACCGGATCAATTTGCCACCCCCACTCTGAACTTTTCAGATGCGGATTGGGGATCATATTCAGTATGTTGCCCTGCGCATTTTTATTAATGCTTTCGTCGTGGGa > 1:3074196/1‑149 (MQ=255) ttGATAACTATCCCAAAGCGTATTTAACAGAACCCGTAATCCAACCGGATCAATTTGCCACCCCCACTCTGAACTTTTCAGATGCGGATTGGGGATCATATTCAGTATGTTGCCCTGCGCATTTTTATTAATGCTTTCGTCGTGGGaaa < 2:3310581/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |