| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 327,491 | G→A | 9.8% | intergenic (+284/‑591) | betT → / → yahA | choline transporter of high affinity/c‑di‑GMP‑specific phosphodiesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 327,491 | 0 | G | A | 9.8% | 737.4 / 50.2 | 225 | intergenic (+284/‑591) | betT/yahA | choline transporter of high affinity/c‑di‑GMP‑specific phosphodiesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (115/88); new base A (13/9); total (128/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.25e-01 | |||||||||||
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
CTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATG > CP009273/327343‑327638 | cTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTg > 2:4384469/1‑149 (MQ=255) tATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGt < 2:543956/149‑1 (MQ=255) aTTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGtt > 2:2945281/1‑149 (MQ=255) aGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTa > 1:2159358/1‑149 (MQ=255) ccAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTCTGTAAgg > 1:2022140/1‑149 (MQ=255) ccAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAgg < 2:4082683/149‑1 (MQ=255) ccAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAgg < 2:2856710/149‑1 (MQ=255) ccAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAgg < 2:231728/149‑1 (MQ=255) aaaCCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGttt < 2:1866219/149‑1 (MQ=255) aaCCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTa > 1:2637190/1‑149 (MQ=255) tACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTa > 1:179321/1‑149 (MQ=255) aCATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTac < 1:910504/149‑2 (MQ=255) aCATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTAt < 2:637723/149‑1 (MQ=255) cATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATc < 2:3752741/149‑1 (MQ=255) aTTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCt > 2:1965091/1‑149 (MQ=255) tttGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTATTATTTAAGGTTTAATTATCtg > 1:2228050/1‑149 (MQ=255) ttGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCtgt < 1:4145358/149‑1 (MQ=255) ttGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCtgt < 1:1528359/149‑1 (MQ=255) ttGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCtgt < 1:4549396/149‑1 (MQ=255) ggCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCtgtgtg > 2:101432/1‑149 (MQ=255) tGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGa < 1:3463353/149‑1 (MQ=255) tGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTATTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGatat < 2:4966448/149‑1 (MQ=255) gAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATAtttt > 2:4758517/1‑149 (MQ=255) aTGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTAt > 1:4597169/1‑149 (MQ=255) aTGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTAt > 1:1812660/1‑149 (MQ=255) tGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGTAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTAtt > 1:1841373/1‑149 (MQ=255) aaTAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATg < 2:544649/149‑1 (MQ=255) aaTAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATg > 2:1437711/1‑149 (MQ=255) aTAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGt > 2:4317909/1‑149 (MQ=255) tAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGtt > 2:3462647/1‑149 (MQ=255) tAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGtt < 1:2957634/149‑1 (MQ=255) tAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGtt < 2:4014130/149‑1 (MQ=255) aGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGtttt > 1:4429292/1‑149 (MQ=255) gTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTATTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTa > 2:3506090/1‑149 (MQ=255) tttAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTATTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTaa > 2:2249544/1‑149 (MQ=255) gTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTTAATGTTTTAAatat > 2:3588159/1‑149 (MQ=255) gTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAatat > 2:2688251/1‑149 (MQ=255) ttATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGt > 2:1130043/1‑149 (MQ=255) ttATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGt > 1:501323/1‑149 (MQ=255) ttATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGt > 1:4887482/1‑149 (MQ=255) aTTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGttt > 1:4202741/1‑149 (MQ=255) aTTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGttt < 1:3326588/149‑1 (MQ=255) tAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTa > 2:1263960/1‑149 (MQ=255) tAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATAGTTTATTGAATGTTTTAAATCTTGTTTTTa > 2:248318/1‑149 (MQ=255) aTGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTAtt < 2:1887221/149‑1 (MQ=255) aTGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTAtt > 1:3780304/1‑149 (MQ=255) aTGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTACTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTAtt > 1:2322547/1‑149 (MQ=255) gTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTgg < 1:1620716/149‑1 (MQ=255) aaaTATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTATTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCa > 1:3101015/1‑149 (MQ=255) atatTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCAtt > 1:5249891/1‑149 (MQ=255) atTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGc < 1:3159934/149‑1 (MQ=255) atTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGc > 1:695907/1‑149 (MQ=255) atTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGc > 2:1368452/1‑149 (MQ=255) ttGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCt < 1:4438471/149‑1 (MQ=255) ttGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCt < 1:4439054/149‑1 (MQ=255) tGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTctaa > 1:1009660/1‑149 (MQ=255) tGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTataa > 1:3627660/1‑149 (MQ=255) tGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTataa > 1:4224630/1‑149 (MQ=255) gATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTataat < 1:3876754/149‑1 (MQ=255) gATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTataat < 1:1258357/149‑1 (MQ=255) aTCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTataata > 1:2610711/1‑149 (MQ=255) aTCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTataata > 1:204604/1‑149 (MQ=255) aTTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTg < 2:1289619/149‑1 (MQ=255) tttGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAGATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTgg > 2:2205706/1‑149 (MQ=255) tttGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTgg < 2:30730/149‑1 (MQ=255) aaaTGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTAt < 1:4340284/149‑1 (MQ=255) gACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCAtt < 2:3230537/149‑1 (MQ=255) aCGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCAttt < 2:2331770/149‑1 (MQ=255) cATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTATTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCt > 1:1606360/1‑149 (MQ=255) ttattCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGa > 1:3233697/1‑149 (MQ=255) ttattCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGa < 1:2911158/149‑1 (MQ=255) tattCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGaa < 1:5073456/149‑1 (MQ=255) tattCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGaa > 2:2474252/1‑149 (MQ=255) cATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGa > 1:966317/1‑149 (MQ=255) tGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGAtt > 2:4223501/1‑149 (MQ=255) aaTGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTc > 1:2521284/1‑149 (MQ=255) tgtgTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCtt > 1:2850353/1‑149 (MQ=255) tATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATg > 1:5235969/1‑149 (MQ=255) aTCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGa > 1:1508721/1‑149 (MQ=255) gTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTg > 1:4765822/1‑149 (MQ=255) tAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTgg > 2:2761835/1‑149 (MQ=255) tAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTgg > 1:1368072/1‑149 (MQ=255) aaTCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGt > 1:401618/1‑149 (MQ=255) aaTCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGt > 1:401533/1‑149 (MQ=255) aTCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGtt < 2:179321/149‑1 (MQ=255) aaCTGAAATTAACGCAACCATTTATTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGttttt < 2:3044180/149‑1 (MQ=255) aaCTGAAATTAACGCAACCATTTATTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGttttt < 2:3044827/149‑1 (MQ=255) gAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAgg < 2:4321169/149‑1 (MQ=255) aaaTTAACGCAACCATTTATTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAggg > 1:3136141/1‑149 (MQ=255) aaTTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGa < 1:2761835/149‑1 (MQ=255) ttAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACa < 1:4384398/149‑1 (MQ=255) aCGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGc < 2:695907/149‑1 (MQ=255) gCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCAt < 2:2159358/149‑1 (MQ=255) ccAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCAt < 2:854186/148‑1 (MQ=255) aaCCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATag > 2:3856466/1‑149 (MQ=255) aaCCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATag > 2:3855958/1‑149 (MQ=255) aCCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATaga < 1:1089861/149‑1 (MQ=255) ccATTTATTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATagag < 2:789320/149‑1 (MQ=255) cATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGt > 1:262343/1‑149 (MQ=255) aTTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTa < 1:2032978/149‑1 (MQ=255) | CTATTGCAGCCCAAAACCTACATTTGGGCTGTTGCGAATGTTCAATAAGTTTAGTCTTATTTAATGTAAATATTGCTGATCATTTGAAATGACGCATTATTCATGAGAAATGTGTATCGTAAATCAACTGAAATTAACGCAACCATTTGTTATTTAAGGTTTAATTATCTGTGTGTGATATTTTATTGAATGTTTTAAATATTGTTTTTATTGGCATTGCTATAATATTGGTTATCATTTGCTGAATGGATTCAGTCTTAATGAGTGGGTTTTTAAGGGACAGGCATAGAGTAATG > CP009273/327343‑327638 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |