Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 4,562,043 | 0 | C | A | 88.0% | 714.0 / 91.4 | 248 | intergenic (+311/‑188) | yjiS/yjiT | DUF1127 family protein/pseudogene |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (15/15); new base A (98/120); total (113/135) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.97e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
ACTTGTGTTTTTTGACTGACTTTACAACTCTCATTATTCGCTATTGTGCAGTTTCTCTAATTGTTTTATACCCTGGAAAGTTAAATGTCAGCTACTGAATACTTTTTGATTGTTTGAGATTTATTTTCATTTGAAATTATAAAATCAGGTGATAAATGAGTTGTGATTAATAGATGGTTGATATCATTTTTATCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTG > CP009273/4561898‑4562188 | aCTTGTGTTTTTTGACTGACTTTACAACTCTCATTATTCGCTATTGTGCAGTTTCTCTAATTGTTTTATACCCTGGAAAGTTAAATGTCAGCTACTGAATACTTTTTGATTGTTTGAGATTTATTTTCATTTGAAATTATAAAATAAgg < 2:4298542/149‑1 (MQ=255) tgtTTTTTGACTGACTTTACAACTCTCATTATTCGCTATTGTGCAGTTTCTCTAATTGTTTTATACCCTGGAAAGTTAAATGTCAGCTACTGAATACTTTTTGATTGTTTGAGATTTATTTTCATTTGAAATTATAAAATAAGGTGATa < 1:145695/149‑1 (MQ=255) gtTTTTTGACTGACTTTACAACTCTCATTATTCGCTATTGTGCAGTTTCTCTAATTGTTTTATACCCTGGAAAGTTAAATGTCAGCTACTGAATACTTTTTGATTGTTTGAGATTTATTTTCATTTGAAATTATAAAATAAGGTGATaa > 1:3848413/1‑149 (MQ=255) ttttttGACTGACTTTACAACTCTCATTATTCGCTATTGTGCAGTTTCTCTAATTGTTTTATACCCTGGAAAGTTAAATGTCAGCTACTGAATACTTTTTGATTGTTTGAGATTTATTTTCATTTGAAATTATAAAATAAGGTGATaaa 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aaTAAGGTGATAAATGAGTTGTGATTAATAGATGGTTGATATCATTTTTATCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAAtgttg > 1:1833133/1‑149 (MQ=255) | ACTTGTGTTTTTTGACTGACTTTACAACTCTCATTATTCGCTATTGTGCAGTTTCTCTAATTGTTTTATACCCTGGAAAGTTAAATGTCAGCTACTGAATACTTTTTGATTGTTTGAGATTTATTTTCATTTGAAATTATAAAATCAGGTGATAAATGAGTTGTGATTAATAGATGGTTGATATCATTTTTATCTAAAATTGATTTATAGTATCGACCTGAAAAAATAGTTGTTGCCGCCTGAGTAACTATACAATATTCTGAAAGGTTTTCTTTCAAATTAGAAATGTTG > CP009273/4561898‑4562188 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |