| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 380,508 | C→T | 6.1% | intergenic (‑436/‑180) | yaiS ← / → tauA | putative PIG‑L family deacetylase/taurine transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 380,508 | 0 | C | T | 6.1% | 863.0 / 29.6 | 244 | intergenic (‑436/‑180) | yaiS/tauA | putative PIG‑L family deacetylase/taurine transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (134/95); new base T (10/5); total (144/100) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.72e-01 | |||||||||||
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
TTTATATACATTATGTGAATGTAATATGCGAGTGATTGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATAC > CP009273/380362‑380654 | cATTATGTGAATGTAATATGCGAGTGATTGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGa < 2:4043661/149‑1 (MQ=255) cATTATGTGAATGTAATATGCGAGTGATTGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTAGTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGa > 2:1651104/1‑149 (MQ=255) ttATGTGAATGTAATATGCGAGTGATTGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAg > 2:873767/1‑149 (MQ=255) tATGTGAATGTAATATGCGAGTGATTGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAgt < 1:1417319/149‑1 (MQ=255) gtgAATGTAATATGCGAGTGATTGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTgta > 1:960347/1‑149 (MQ=255) tgAATGTAATATGCGAGTGATTGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTgtag > 1:508053/1‑149 (MQ=255) tGTAATATGCGAGTGATTGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAAt > 1:2674466/1‑149 (MQ=255) gTAATATGCGAGTGATTGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAAtt > 2:3478817/1‑149 (MQ=255) gTAATATGCGAGTGATTGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAAtt > 2:3478902/1‑149 (MQ=255) tatGCGAGTGATTGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTcc > 1:4370310/1‑149 (MQ=255) cGAGTGATTGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAAt > 2:3101839/1‑149 (MQ=255) gAGTGATTGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAAtt > 1:1448267/1‑149 (MQ=255) tGATTGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGtt < 1:2110728/149‑1 (MQ=255) tGATTGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGtt < 1:2213494/149‑1 (MQ=255) tGATTGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGtt < 2:4054164/149‑1 (MQ=255) gATTGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTa > 2:4154579/1‑149 (MQ=255) ttGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGa > 2:5195162/1‑149 (MQ=255) gagaATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAAc > 1:2913124/1‑149 (MQ=255) aTGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATTACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAg > 1:3200524/1‑149 (MQ=255) gATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTa < 2:471139/149‑1 (MQ=255) aTACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTaa > 2:329060/1‑149 (MQ=255) aCAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAAtt > 2:223469/1‑149 (MQ=255) aGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGc > 2:5225133/1‑149 (MQ=255) aGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGc > 2:2141769/1‑149 (MQ=255) aGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGc > 2:2602747/1‑149 (MQ=255) gTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCa > 2:1903267/1‑149 (MQ=255) gTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCa < 2:1670954/149‑1 (MQ=255) gTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCa < 1:1040708/149‑1 (MQ=255) gTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCa > 2:4791834/1‑149 (MQ=255) tGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTACTTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCat > 2:2987517/1‑149 (MQ=255) atatatACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCatat > 2:629366/1‑149 (MQ=255) cAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCt < 2:1871385/149‑1 (MQ=255) aaTGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCtt < 2:2766123/149‑1 (MQ=255) aaTGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCtt > 2:3614297/1‑149 (MQ=255) aaTGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGGTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCtt > 2:4852760/1‑149 (MQ=255) aTGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCttt > 2:2886374/1‑149 (MQ=255) aTGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCttt > 2:2453477/1‑149 (MQ=255) tGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTc < 2:2307998/149‑1 (MQ=255) tGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAAGTGTTAGAACGGAGTAAGTGCatctttcatctttc > 2:3046467/1‑149 (MQ=255) cGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCt < 2:3309862/149‑1 (MQ=255) gAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCtt > 1:2636609/1‑149 (MQ=255) aataGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGt > 2:180241/1‑149 (MQ=255) tttATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGttttttt > 2:2695923/1‑149 (MQ=255) ttttatTTGTATTGATTTTTTTAGAAATAATGACTTAATAATTCTCTTTATGTGGTTGTTTATGCTTCACTAACATGAAGTTTTGTAATTTTCCCTATTGTTTTATCGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGc < 1:440310/147‑1 (MQ=255) tattatATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGc < 2:1540338/149‑1 (MQ=255) attatATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATTACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCt < 2:508451/149‑1 (MQ=255) attatATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCt > 1:637495/1‑149 (MQ=255) attatATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATATTTCCTTAGCCGTTTTTTTgat > 1:4859059/1‑147 (MQ=255) atGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGaa < 1:1548953/149‑1 (MQ=255) tGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTTCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAAt > 1:874520/1‑149 (MQ=255) tGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGttttttt > 2:905747/1‑140 (MQ=255) gTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATa > 1:1691583/1‑149 (MQ=255) tattgatattgaTAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATaa < 1:3794993/149‑1 (MQ=255) tattgatattgaTAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATaa > 1:3815941/1‑149 (MQ=255) attgatattgatAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATaaa < 2:4370310/149‑1 (MQ=255) ttgatattgataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATaaaa > 1:193153/1‑149 (MQ=255) ttgataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCt > 1:3056578/1‑149 (MQ=255) ttgataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCt > 2:4104140/1‑149 (MQ=255) tgataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCtg > 2:4758601/1‑149 (MQ=255) ataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCtgtg > 2:2508214/1‑149 (MQ=255) ataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCtgtg > 2:4748127/1‑149 (MQ=255) ataGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCtgtg > 2:1153837/1‑149 (MQ=255) taGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGc < 2:3604088/149‑1 (MQ=255) taGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGc < 1:3176148/149‑1 (MQ=255) taGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGc < 1:4062822/149‑1 (MQ=255) aGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCg > 2:761135/1‑149 (MQ=255) taaaTAATGAATTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGTAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGa < 2:5015144/148‑1 (MQ=255) gAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGa > 1:2485241/1‑149 (MQ=255) gAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGa < 2:4337991/149‑1 (MQ=255) aaaTAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATTACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGAt < 2:5165628/149‑1 (MQ=255) aaaTAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGAt < 1:3576586/149‑1 (MQ=255) aaaTAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGAt > 1:4597301/1‑149 (MQ=255) ataatGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATTACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATaa > 1:1577608/1‑149 (MQ=255) taatGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAAc > 1:1683156/1‑149 (MQ=255) taatGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAAc < 2:2265907/149‑1 (MQ=255) aatGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAAct < 1:4519904/149‑2 (MQ=255) aatGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACg > 1:2011603/1‑149 (MQ=255) tGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGAc > 2:1232852/1‑149 (MQ=255) gAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACt > 1:1276235/1‑149 (MQ=255) aGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATTACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTaa > 1:3515940/1‑149 (MQ=255) gTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAAt < 1:4294271/149‑1 (MQ=255) aataaATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATTACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTc > 2:4041760/1‑149 (MQ=255) aataaATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATTACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTc > 1:2863689/1‑149 (MQ=255) aataaATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTc > 1:5114322/1‑149 (MQ=255) aaaTCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCttt > 1:3013942/1‑149 (MQ=255) aaTCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTAtttt > 1:4000571/1‑149 (MQ=255) ctcGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTaat < 1:329060/149‑1 (MQ=255) tcGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTaatg < 1:2168195/149‑1 (MQ=255) gtgGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGttt < 2:3465812/149‑1 (MQ=255) tgGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGtttt > 2:1202673/1‑149 (MQ=255) tgGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGtttt > 2:3820986/1‑149 (MQ=255) tgGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGtttt > 2:2544366/1‑149 (MQ=255) ggTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGttttt < 1:1125003/149‑1 (MQ=255) ttgttTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTAt < 2:3362796/149‑1 (MQ=255) ttgttTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTAt < 1:4139642/149‑1 (MQ=255) ttATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCt > 1:402098/1‑149 (MQ=255) aTGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGa > 1:1730524/1‑149 (MQ=255) aTGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGa < 1:5128165/149‑1 (MQ=255) tGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGaa < 2:4469728/149‑1 (MQ=255) gCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAAt > 1:1960018/1‑149 (MQ=255) | TTTATATACATTATGTGAATGTAATATGCGAGTGATTGAGAATGATACAGTGATATATACAATGCGAATATAATAGTTTTATTATATGTATTGATATTGATAGAAATAATGAAGTAATAAATCTCGTAATGTGGTTGTTTATGCATCACTAAAATGAAGTGTAGTAATTTTCCCAATTGTTAGAACGGAGTAATTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATAC > CP009273/380362‑380654 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |