| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 68,504 | T→G | 9.7% | L223V (TTG→GTG) | yabI → | DedA family inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 68,504 | 0 | T | G | 9.7% | 945.0 / 12.3 | 337 | L223V (TTG→GTG) | yabI | DedA family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (83/211); new base G (41/2); total (124/213) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.35e-18 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 340 total aligned reads displayed.
GAGCGGTGAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCA > CP009273/68356‑68652 | gagCGGTGAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGt < 2:2843533/149‑1 (MQ=255)gagCGGTGAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCGGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGt < 2:4675196/149‑1 (MQ=255) ggTGAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTTGCTGAAG‑CCGTTGAt > 1:3812295/1‑149 (MQ=255) tGAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGAttt < 1:1316464/149‑1 (MQ=255) aGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTGGGTTTTGTCTTAAC‑CCGTTTAtttgt > 1:3258908/1‑147 (MQ=255) tttAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGc < 2:3080133/149‑1 (MQ=255) tttAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTGTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGGTGATTTCTGc > 2:1960173/1‑149 (MQ=255) tAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTGTGTTGTGGGGGGCG‑CCGGTGTTTTATGCCa > 1:1874537/1‑149 (MQ=255) aTGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCg < 1:2373622/149‑1 (MQ=255) tgctgcTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCgtg < 1:776505/149‑1 (MQ=255) gctgctGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCgtgg < 1:3702183/149‑1 (MQ=255) ctgctgGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCgtggt < 2:4184711/149‑1 (MQ=255) ctgctgGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCgtggt < 2:461768/149‑1 (MQ=255) ctgctgGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTGATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCgtggt < 2:1466928/149‑1 (MQ=255) tgctgGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTGTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCgtggtg > 2:4743597/1‑149 (MQ=255) gctgGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGtggtgg < 2:1018993/149‑1 (MQ=255) gcgggCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTCTGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGGCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGtggtgg < 1:2704699/146‑1 (MQ=255) ctgGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGgc < 1:5013036/149‑1 (MQ=255) gCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTTTTGTTGCTGACG‑CCGTTGATTTATTCCATCGGCGTGGTGGCGCt > 1:2582144/1‑149 (MQ=255) aCAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCtggt < 1:4494313/149‑1 (MQ=255) aCAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCtggt < 2:4385137/149‑1 (MQ=255) aCAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTGTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCtggt > 2:568800/1‑149 (MQ=255) cAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCtggtg < 1:1127544/149‑1 (MQ=255) aGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCtggtgg < 1:4046792/149‑1 (MQ=255) gCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTggtggt < 1:2247258/149‑1 (MQ=255) gCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTggtggt < 1:4863813/149‑1 (MQ=255) gCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTGTGTTTTGGCTGAAG‑CCGGTGATTTATGCCAAAGGCGTGGTGGCGCTggtggt > 1:5165477/1‑149 (MQ=255) gtgtTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTGTGTTTTGGCTGACG‑CCGGTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGtt > 2:3868980/1‑149 (MQ=255) tgtTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTTTCTGACG‑CCGGTGATTTATTCCAAAGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGttt > 1:4636909/1‑148 (MQ=255) gtTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGAAG‑CCGTTGATTTATGCCCTCGGCGTGGTGGCGCGGGTGGTGTTaa > 2:520631/1‑149 (MQ=255) tgtgGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGc < 1:3480989/149‑1 (MQ=255) tgtgGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGc < 1:2145242/149‑1 (MQ=255) gtgGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGcc < 1:1988891/149‑1 (MQ=255) gTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTGTGGTGGGGGTGACG‑CCCGGGTTTTCTGCCCACGGCGGGGTGGCGCTGGGGGTGTTAATTCGCCAccc > 2:3519949/1‑149 (MQ=255) tggtggCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGt < 2:1586263/149‑1 (MQ=255) tggtggCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGt < 1:1051622/149‑1 (MQ=255) ggtggCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGtt < 2:4439910/149‑1 (MQ=255) ctggctgTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGc < 1:355891/149‑1 (MQ=255) tggctgTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGcc < 2:4151380/149‑1 (MQ=255) gctgTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCgg < 2:2999606/149‑1 (MQ=255) tGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTatat < 1:4279992/149‑1 (MQ=255) tGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTatat < 1:4206050/149‑1 (MQ=255) tGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTAGCCACCCGTTTATGCCGGTGTatat > 2:3688264/1‑149 (MQ=255) cGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGa < 1:4848314/149‑1 (MQ=255) cGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTGTGTTGTGGCTGTCG‑CCGGTGATTTCTTCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGGGGGAATTAGCCACCCGGTGCTGCCGGGGGATATCGa > 2:5005198/1‑149 (MQ=255) ttATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGGGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGGGTATATCGatat > 2:3311672/1‑149 (MQ=255) tATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATAtt < 1:3632296/149‑1 (MQ=255) gcAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGNGt < 1:2100539/149‑1 (MQ=255) gTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTGTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTAGCCCCCCCTTGATGCCGGTGTATATAGATATTTTGCGTAAAGTg > 2:2118738/1‑149 (MQ=255) tAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTTGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCAAAGGCGGGGTGGCGCTGGGGGTGTTAATTAGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATAGATATTTTTCGGAAAGTgg > 2:3553843/1‑149 (MQ=255) tAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTGGTTGTGGCTTACG‑CCGGTGATTTCTTCCATAGGCGTGGTGGCGCAGGTGGTGTTAATTAGCCACCCCGTGAAGCCCGGGGATATAGATAATTTTAGGAAAGTgg > 1:1738142/1‑149 (MQ=255) tAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTGGGTTGTGGCGGCCG‑CCGGTGATTTCTGCCCTCGGCGGGGTGGCGCGGGTGGTGTTTATTCGCCACCCCGTGATGCCCGTGTATATCGATATTTTTCGGAAAGTgg > 2:933258/1‑149 (MQ=255) aaGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGTTTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTAGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTTCGTAAATTGGtt > 2:2480896/1‑149 (MQ=255) aaGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGtt < 2:1853971/149‑1 (MQ=255) aaGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGtt < 2:1142543/149‑1 (MQ=255) aGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTg < 2:5117782/149‑1 (MQ=255) aGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTGTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTTCGTAAAGTGGTTg > 2:839060/1‑149 (MQ=255) gCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTgg < 1:4158307/149‑1 (MQ=255) gCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTGTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAAGTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTgg < 2:2845392/149‑1 (MQ=255) aCTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGt < 1:1480398/149‑1 (MQ=255) aCTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGt < 2:3626593/149‑1 (MQ=255) cTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGtt < 1:897890/149‑1 (MQ=255) aCCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAg < 1:3109200/149‑1 (MQ=255) tGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATa < 2:1348896/149‑1 (MQ=255) aGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCCGTTAATTATTCCCA‑CGGCCTGGTTGCGCTGGTGGTTTTAAATAGCCCCCCCTGGATGCCGGTGGATATCTATATTTTTCGAAAACTGGTTTGGGGTTATGAGATAGt > 2:2359762/1‑149 (MQ=255) aGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGt < 1:4051475/149‑1 (MQ=255) gTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGAAG‑CCGTTTATTTAAGCCATAGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTTTTAATTATCCACCCCTTTAATCCGGTGTATAAAGAAATTTTTCGTAAAGTTGTTGGGGTTTAGGAGATatta > 2:1968940/1‑146 (MQ=255) tCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTTACG‑CCGTTGAATTATGCCAACGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGGTAATTAGCCACCCCTTTATTCCGGGTTATATAGATATTTTTCGTTAATTGGTTTGGGTTTTTGAGATattat > 2:2284521/1‑145 (MQ=255) tCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCt < 2:3989150/149‑1 (MQ=255) cATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCtt < 2:4047231/149‑1 (MQ=255) cATTATTTGTCCCGCGGTCGTGTGTTTTGGCGGACC‑CCCGTGATTTATGCCAACCGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAAATAGCCACCCCGTGATGACCGGGTCAAAAGAAATTTTTCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGATATAGTCtt > 1:246383/1‑149 (MQ=255) attattTGTCCCGCGGTCGTTTTTTTTTGCTGACG‑CCGTTGATTTATTCCATACGCGTGGTGGCGCAGGTGGTGTTAATTAGCCAACCCGTGATGCCGGTGTATATAGATAATTTGCGTTAAGTGTTTTGGGGTTTGGAGATATTATtg > 2:4901917/1‑149 (MQ=255) attattTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTtg < 2:376511/149‑1 (MQ=255) tattTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCAACGGCGTGGTGGCGCTGGTGGGGTTAATTCGCCACCCGTTGATTCCGGTGTATATCGATATTTTTCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTtttg > 2:3502125/1‑149 (MQ=255) attTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGc < 1:2118738/149‑1 (MQ=255) gTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGt < 1:3525427/149‑1 (MQ=255) tCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGtt < 2:647806/149‑1 (MQ=255) ccGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGc < 1:471889/149‑1 (MQ=255) cgcgGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCTATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGcc < 2:2687296/149‑1 (MQ=255) gcgGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCt < 1:2591679/149‑1 (MQ=255) gTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCg > 2:2765324/1‑149 (MQ=255) tttGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGa < 1:3670029/149‑1 (MQ=255) tttGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGa < 2:3828610/149‑1 (MQ=255) tttGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGa < 2:2323608/149‑1 (MQ=255) tttGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGa > 1:291739/1‑149 (MQ=255) ttgtGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCt < 1:568800/149‑1 (MQ=255) tgtgGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCtt < 1:3359337/149‑1 (MQ=255) gtgGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTg < 2:2512089/149‑1 (MQ=255) tgGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGc > 2:4058189/1‑149 (MQ=255) tgGCCGCCG‑CCGGTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCGGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTGGGCGTAAAGTGGTTGGGGTGTAGGAGATAGTCTTGGGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGc < 2:4362153/149‑1 (MQ=255) ggCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGcc < 2:3473316/149‑1 (MQ=255) tGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGGTTAGGAGATCGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCcgcg > 1:1659001/1‑149 (MQ=255) gACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGTGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGt < 1:4007929/149‑1 (MQ=255) aCG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTc > 1:4417023/1‑149 (MQ=255) aCG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTc < 2:3235996/149‑1 (MQ=255) cG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCt < 1:706832/149‑1 (MQ=255) cG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCt < 2:4874281/149‑1 (MQ=255) g‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCtt < 1:3136837/149‑1 (MQ=255) cGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTAt > 1:1930632/1‑149 (MQ=255) gTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATc > 2:1428853/1‑149 (MQ=255) | GAGCGGTGAGTTTAAATGGTTGCTGCTGGCAACAGCGGTGTTTTTGTGGGTTGGTGGCTGGCTGTGCTGGCGGTTATGGCGCAGCGGTAAAGCGACTGACCGTTTGAGTCATTATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACG‑CCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCA > CP009273/68356‑68652 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |