Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,587,029:1 | +G | 89.7% | coding (101/699 nt) | ypfH ← | palmitoyl‑CoA esterase activity, uncertain physiological substrate |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,587,029 | 1 | . | G | 89.7% | 771.5 / 94.9 | 233 | coding (101/699 nt) | ypfH | palmitoyl‑CoA esterase activity, uncertain physiological substrate |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (18/6); new base G (105/104); total (123/110) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.95e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
TGATCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACT > CP009273/2586880‑2587172 | gATCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTAtttg > 1:4548730/1‑149 (MQ=255) gCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTT‑gcccc > 1:3035554/1‑150 (MQ=255) cATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTT‑gccccc < 1:2909514/150‑2 (MQ=255) aTCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTT‑gccccca < 1:4879074/150‑3 (MQ=255) ccACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCAtt < 2:3017475/150‑1 (MQ=255) ccACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCAtt < 2:2320752/150‑1 (MQ=255) cacaCGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTg < 1:1105998/150‑1 (MQ=255) cacaCGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTg < 1:1007748/150‑1 (MQ=255) cacaCGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTg > 2:1635773/1‑150 (MQ=255) cacaCGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTg < 1:990449/150‑1 (MQ=255) acacGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGc > 2:4217257/1‑150 (MQ=255) acacGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGc > 2:3844862/1‑150 (MQ=255) acacGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGc > 1:622925/1‑150 (MQ=255) cgcCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCg > 1:2035829/1‑150 (MQ=255) tGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGtt > 1:3863109/1‑150 (MQ=255) tGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGtt < 1:1777320/150‑1 (MQ=255) tGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGtt > 2:2938975/1‑150 (MQ=255) ggCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTAt > 1:3040411/1‑150 (MQ=255) gCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTAt < 1:3920666/150‑1 (MQ=255) cGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATc < 1:1651128/150‑1 (MQ=255) gATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATcc > 2:1278554/1‑150 (MQ=255) gATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATcc > 2:4267560/1‑150 (MQ=255) gATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATcc > 1:4008498/1‑150 (MQ=255) aTTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATcccc > 1:2464630/1‑150 (MQ=255) tATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCg > 1:554972/1‑150 (MQ=255) aTCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGa > 2:917310/1‑150 (MQ=255) gTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTg > 1:1762438/1‑150 (MQ=255) gTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTg > 1:2342373/1‑150 (MQ=255) aTACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGaa < 1:3598010/150‑1 (MQ=255) tACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGaaa < 2:3910542/150‑1 (MQ=255) tGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAg < 1:5154674/150‑1 (MQ=255) tGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAg > 2:2295263/1‑150 (MQ=255) tGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAg < 1:2576964/150‑1 (MQ=255) gCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGt > 2:650137/1‑150 (MQ=255) gCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGt > 2:4446481/1‑150 (MQ=255) cACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTa > 2:2601366/1‑150 (MQ=255) cACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTa < 2:2292744/150‑1 (MQ=255) ccGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaac < 1:4533206/150‑1 (MQ=255) cGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaaca > 2:196359/1‑150 (MQ=255) gAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaacaa > 2:3526545/1‑150 (MQ=255) gAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaacaa > 2:2460161/1‑150 (MQ=255) aaaaCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTaacaac < 1:3272094/150‑1 (MQ=255) aCCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGt > 2:429576/1‑150 (MQ=255) ccACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGtt > 1:5006424/1‑150 (MQ=255) cACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTg < 2:1511307/150‑1 (MQ=255) aCTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTgcg > 2:1932536/1‑150 (MQ=255) cTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTgcg < 1:2404738/150‑1 (MQ=255) cGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAgg < 1:2997750/150‑1 (MQ=255) ccccGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGtt > 2:4700330/1‑150 (MQ=255) ccccGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGttt > 1:4249865/1‑150 (MQ=255) gccgGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATcc < 2:2151772/150‑1 (MQ=255) gccgGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATcc < 2:89378/150‑1 (MQ=255) cgGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCg > 1:730387/1‑150 (MQ=255) cgGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCgg > 1:3459538/1‑150 (MQ=255) gATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCggg > 2:1761941/1‑150 (MQ=255) aTTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGc < 1:1469409/150‑1 (MQ=255) ttACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCt > 1:3433021/1‑150 (MQ=255) tACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCtt > 2:4435675/1‑150 (MQ=255) tACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCtt < 1:505596/150‑1 (MQ=255) aCCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCttt < 1:1245954/150‑1 (MQ=255) aCCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCttt < 1:3843232/150‑1 (MQ=255) tCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGaaca > 1:3713800/1‑150 (MQ=255) cGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGaacaa > 2:2742186/1‑150 (MQ=255) gcgcCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATg < 1:1303771/150‑1 (MQ=255) cgcCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACACAATgg > 2:1421498/1‑150 (MQ=255) gcCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGt > 2:4940654/1‑150 (MQ=255) aCCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCAt < 2:1652797/150‑1 (MQ=255) cacTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTc < 2:4164716/150‑1 (MQ=255) acTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCa > 1:4413729/1‑150 (MQ=255) cTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCAt < 1:210814/150‑1 (MQ=255) cTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCAt > 2:1248102/1‑150 (MQ=255) tCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATg < 1:313990/150‑1 (MQ=255) accaccAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCTCCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGc > 2:5182402/1‑150 (MQ=255) accaccAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCTCCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGc > 1:4323036/1‑150 (MQ=255) accaccAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCTCCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGc > 2:5182450/1‑150 (MQ=255) ccaccaGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCg > 1:1488999/1‑150 (MQ=255) ccaccaGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCg < 2:730387/150‑1 (MQ=255) gcgcATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTcc < 1:64041/150‑1 (MQ=255) cgcATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCtt < 2:3040411/150‑1 (MQ=255) tCAGGAAACATCGGTGCAAACCTGTTGCCTATTTGCCCCAAGTGCCACCTGTTTATACCCGTCAACGTTGAAAAGCAGTATAAACTGTTGCGCAGTTTTATCCGGTCTTTGAACAACTAAATGGTCTTGTTTCATGGCGAACTCCTTAAc < 1:4180155/150‑1 (MQ=255) aGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTg > 2:5076199/1‑150 (MQ=255) aGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTg > 2:1133159/1‑150 (MQ=255) gAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGAt > 1:2234658/1‑150 (MQ=255) aaCAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGt < 2:3035554/150‑1 (MQ=255) aCAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTc < 1:1151581/150‑1 (MQ=255) aCAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTc > 1:2014259/1‑150 (MQ=255) cAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCa > 2:4804635/1‑150 (MQ=255) aGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCAt < 2:3712074/150‑1 (MQ=255) aGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCAt < 1:680001/150‑1 (MQ=255) cGGTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTa < 1:1889321/150‑1 (MQ=255) ggTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTaa < 1:402797/150‑1 (MQ=255) ggTGCAAACCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTaa > 1:781409/1‑150 (MQ=255) aaCCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTACCTGATGTCATTAATTTTAc < 2:5142042/150‑1 (MQ=255) aaCCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTAc < 2:3433021/150‑1 (MQ=255) aaCCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTAc < 2:3383421/150‑1 (MQ=255) aaCCAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTAc < 2:1840200/150‑1 (MQ=255) cAGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTAcgcc > 1:4948211/1‑150 (MQ=255) aGTTGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTAcgccg < 1:3172766/150‑1 (MQ=255) tGCCTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTg > 2:5099881/1‑150 (MQ=255) cTATTTGCCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACt > 2:2265039/1‑150 (MQ=255) | TGATCGCATCCACACGCGCCTGGCGATTATCTTCCGTAATACCCTGCACCGAAAACCACTGACGCCCCGCCGGATTACCGCTCGGCTCCGCGCCACCGACACTCACCACCAGCGCATCAGGAAACAGCGGTGCAAACCAGTTGCCTATTT‑CCCCCATTGCCACCGGGTTATCCCCGACACCGTGGAAAAGCAGTAACAACTGTTGCGCAGGTTTATCCGGGCTTTGAACAACAAAATGGTCATGTTTCATGGCGAACTCCTTAACTGATGTCATTAATTTTACGCCGCTGACT > CP009273/2586880‑2587172 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |