| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 692,834 | A→T | 8.7% | intergenic (‑245/+135) | metT ← / ← asnB | tRNA‑Met/asparagine synthetase B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 692,834 | 0 | A | T | 8.7% | 723.0 / 44.5 | 215 | intergenic (‑245/+135) | metT/asnB | tRNA‑Met/asparagine synthetase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (87/109); new base T (8/11); total (95/120) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
AAGTGACTGTTTGGTTAGGTTGCGAACAGCGTGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCACCGGGGCTGTTTCGCATTTCTTACTTATACGCCGA > CP009273/692685‑692983 | aaGTGACTGTTTGGTTAGGTTGCGAACAGCGTGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGaa < 1:4896215/150‑1 (MQ=255) naCTGTTTGGTTAGGTTGCGAACAGCGTGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATAc > 1:1006403/2‑150 (MQ=255) gACTGTTTGTTTAGGTTGCGAACAGCGTGGCGATATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATAc < 2:3903868/150‑1 (MQ=255) gACTGTTTGGTTAGGTTGCGAACAGCGTGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATAc < 1:1034927/150‑1 (MQ=255) gACTGTTTGGTTAGGTTGCGAACAGCGTGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATAc < 1:1683275/150‑1 (MQ=255) aCTGTTTGGTTAGGTTGCGAACAGCGTGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGATATACt < 2:8593/150‑1 (MQ=255) tGTTTGGTTAGGTTGCGAACAGCGTGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGATATACTgg > 2:2990009/1‑150 (MQ=255) tGTTTGGTTAGGTTGCGAACAGCGTGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTgg > 1:1534480/1‑150 (MQ=255) gTTTGGTTAGGTTGCGAACAGCGTGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGAAAATTAATCTATGAAATACTGGc > 1:2576174/1‑150 (MQ=255) tGGTTAGGTTGCGAACAGCGTGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTa < 1:2697166/150‑1 (MQ=255) ggTTAGGTTGCGAACAGCGTGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTAc < 2:396368/150‑1 (MQ=255) ggtAGGTTGCGAACAGCGTGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTAGGAATTTAACAAGAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACGGGCCTACa > 1:2427505/3‑150 (MQ=255) gTTAGGTTGCGAACAGCGTGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACa > 2:3414749/1‑150 (MQ=255) gTTGCGAACAGCGTGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGtgat > 2:5101176/1‑150 (MQ=255) gTTGCGAACAGCGTGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTGTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGtgat < 2:4731093/150‑1 (MQ=255) tGCGAACAGCGTGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGtgatga > 1:5109006/1‑150 (MQ=255) aaCAGCGTGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTg < 2:3170166/150‑1 (MQ=255) cAGCGTGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTc > 1:1179375/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACa > 2:4589029/1‑150 (MQ=255) ggCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAg < 1:4951286/150‑1 (MQ=255) gcgcTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGt < 1:3244017/150‑1 (MQ=255) cgcTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAAAAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTg > 2:692458/1‑150 (MQ=255) gcTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGa > 1:2714054/1‑150 (MQ=255) cTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGAt < 2:4556542/150‑1 (MQ=255) tataTTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGAtg < 1:5101176/150‑1 (MQ=255) atatTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACCGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGAtgt < 2:757804/150‑1 (MQ=255) atatTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGTAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGAtgt < 2:27415/150‑1 (MQ=255) ttCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGATATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGc > 2:1350629/1‑150 (MQ=255) ttCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGc < 2:1591593/150‑1 (MQ=255) cGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTTGCaa < 2:2492532/150‑1 (MQ=255) tCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTCCAGCCAGTCTTTTGTCCTACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGTTGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAAc < 1:3463544/150‑1 (MQ=255) tCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAATTTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAAc < 1:3049047/150‑1 (MQ=255) tCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAAc > 2:3052915/1‑150 (MQ=255) cAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAAcc < 2:4681089/150‑1 (MQ=255) aaTTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAAccc < 2:2366600/150‑1 (MQ=255) attGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGaa > 1:4736981/1‑150 (MQ=255) ttGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAAc < 1:435746/150‑1 (MQ=255) tGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACa > 2:1774704/1‑150 (MQ=255) gTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACAt > 2:3328346/1‑150 (MQ=255) tttACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCAATCATATGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGACGGAAATTAATCAATGAAATACTAGCCTACAGTGATGAGTAGTCAAACAGTGAAGTGCCAAACACGGAACAta > 2:3473724/1‑149 (MQ=255) ttACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACAttt < 1:2924964/150‑1 (MQ=255) aCTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTcc < 1:2618428/150‑1 (MQ=255) cTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCt > 1:423566/1‑150 (MQ=255) tgtgTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTAc < 2:94860/150‑1 (MQ=255) tgtgTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTAc > 2:4177191/1‑150 (MQ=255) tgtgTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTAc < 1:2135032/150‑1 (MQ=255) gtTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGc < 2:626401/150‑1 (MQ=255) ttttttCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCa > 1:3788230/1‑150 (MQ=255) tttttCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCat < 1:3303094/150‑1 (MQ=255) tttgtCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCat < 2:4872859/150‑1 (MQ=255) ttCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGATATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATc > 1:4303140/1‑150 (MQ=255) ttCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATc > 2:1972968/1‑150 (MQ=255) ccACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGa > 1:3929009/1‑150 (MQ=255) ccACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGa > 1:71819/1‑150 (MQ=255) cccTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGTACATTTCCTTACTGCATATCAGAATc > 2:1436588/1‑150 (MQ=255) cccTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGACCATTTCCTTACTGCATATCAGAATc > 2:2284850/1‑150 (MQ=255) cccTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATc > 2:1436580/1‑150 (MQ=255) cccTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGAAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATc < 2:2135571/150‑1 (MQ=255) ccTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATca > 2:1827307/1‑150 (MQ=255) cAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATcaacaa > 1:1930807/1‑150 (MQ=255) aGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAg < 2:2587888/150‑1 (MQ=255) cATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCAc < 2:1692720/150‑1 (MQ=255) cATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCAc < 2:4286928/150‑1 (MQ=255) cTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGATATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCa < 1:1110814/150‑1 (MQ=255) cTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCa > 2:1267221/1‑150 (MQ=255) tttGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAAt < 1:135705/150‑1 (MQ=255) ttGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATa > 1:1115122/1‑150 (MQ=255) tGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATaa > 1:710912/1‑150 (MQ=255) cATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTg < 1:808412/150‑1 (MQ=255) cATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTg > 2:3704187/1‑150 (MQ=255) cAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAAc > 1:4403647/1‑150 (MQ=255) aGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGATATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACa > 1:2191511/1‑150 (MQ=255) gATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCTGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGc > 2:205204/1‑150 (MQ=255) aNGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGcc > 1:3177051/1‑150 (MQ=255) tGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGccc < 1:3249510/150‑1 (MQ=255) aaaTTTGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGTAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGATACAGcccca < 2:2690259/150‑2 (MQ=255) aaaTTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCg < 2:2067384/150‑1 (MQ=255) ttCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGAt > 2:2189435/1‑150 (MQ=255) ttCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGAt > 2:2630635/1‑150 (MQ=255) ttCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGAt > 2:175584/1‑150 (MQ=255) cGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGAtgt > 2:2306655/1‑148 (MQ=255) gAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCa < 2:2838891/150‑1 (MQ=255) aTTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCAcc < 2:1838379/150‑1 (MQ=255) aTTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCGACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATCTCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCAcc < 2:607702/150‑1 (MQ=255) tttAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCACCg < 1:370297/150‑1 (MQ=255) tAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCACCggg < 1:1716376/150‑1 (MQ=255) aaTAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCACCGGGGCTg > 2:194293/1‑150 (MQ=255) aaTAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCACCGGGGCTg > 2:4586695/1‑150 (MQ=255) aGTGGTGGGAAATTAATCTATGATATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCACCGGGGCTGttt > 2:3115040/1‑150 (MQ=255) tggtggGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCACCGGGGCTGTTTCg > 2:1155525/1‑150 (MQ=255) tggtggGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCACCGGGGCTGTTTCg < 1:4589029/150‑1 (MQ=255) tggtggGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCACCGGGGCTGTTTCg < 1:1806970/150‑1 (MQ=255) ggtggGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCACCGGGGCTGTTTCGc > 1:2405426/1‑150 (MQ=255) ggAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCACCGGGGCTGTTTCGCAttt < 1:3309325/150‑1 (MQ=255) aTTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCACCGGGGCTGTTTCGCATTTctta < 1:4029628/150‑1 (MQ=255) aaTCTATGATATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCACCGGGGCTGTTTCGCATTTcttactt > 2:4929755/1‑150 (MQ=255) tCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCACCGGGGCTGTTTCGCATTTCTTACTtat < 1:300099/150‑1 (MQ=255) tCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCACCGGGGCTGTTTCGCATTTCTTACTtat < 1:2513001/150‑1 (MQ=255) aaaTACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCACCGGGGCTGTTTCGCATTTCTTACTTATACGCCg > 2:1001448/1‑150 (MQ=255) aaTACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCACCGGGGCTGTTTCGCATTTCTTACTTATACGCCGa > 1:4501536/1‑150 (MQ=255) | AAGTGACTGTTTGGTTAGGTTGCGAACAGCGTGGCGCTATATTCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATTCGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAGTGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAGCCCCGGATTTCACCGGGGCTGTTTCGCATTTCTTACTTATACGCCGA > CP009273/692685‑692983 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |