Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 833,505 | G→T | 11.9% | intergenic (‑124/+141) | ybiJ ← / ← ybiI | DUF1471 family putative periplasmic protein/DksA‑type zinc finger protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 833,505 | 0 | G | T | 11.9% | 701.0 / 57.9 | 216 | intergenic (‑124/+141) | ybiJ/ybiI | DUF1471 family putative periplasmic protein/DksA‑type zinc finger protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (96/94); new base T (15/11); total (111/105) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.36e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
GCAACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACGTTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGAACTTGTTTTATACCGCGTGGCAGTCACAGCAGCGTTAAAGGCACGGAATGACACGCAAAATACAAATTATACTCGCTATGCATCTCGCCAGTTGTAGTTAACGTAA > CP009273/833356‑833654 | aacaacAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACGTTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATtgattgat > 2:557663/1‑150 (MQ=255) acaacaGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACGTTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGata > 2:3000040/1‑150 (MQ=255) acaacaGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACGTTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGata > 2:4492415/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |