| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 950,103 | T→C | 8.9% | intergenic (‑181/+225) | focA ← / ← ycaO | formate channel/ribosomal protein S12 methylthiotransferase accessory factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 950,103 | 0 | T | C | 8.9% | 581.5 / 34.0 | 191 | intergenic (‑181/+225) | focA/ycaO | formate channel/ribosomal protein S12 methylthiotransferase accessory factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (96/78); new base C (4/13); total (100/91) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.99e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 | |||||||||||
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
GATACTAACAAAGCATTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAATATATGTAAA > CP009273/949954‑950252 | gaTACTAACAAAGCATTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGtt > 1:3545935/1‑150 (MQ=255) aTACTAACAAAGCATTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTg < 2:1172430/150‑1 (MQ=255) tACTAACAAAGCATTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGa > 2:4245389/1‑150 (MQ=255) tACTAACAAAGCATTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGa > 2:3809860/1‑150 (MQ=255) tAACAAAGCATTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAAtt > 2:1261708/1‑150 (MQ=255) aGCATTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGTCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTcc < 1:284688/150‑1 (MQ=255) aGCATTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTcc < 1:4228744/150‑1 (MQ=255) cATTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGc > 2:195343/1‑150 (MQ=255) aTTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCa > 2:4682115/1‑150 (MQ=255) tataGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCAtc > 1:36488/1‑150 (MQ=255) tataGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCAtc < 2:519736/150‑1 (MQ=255) ataGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCAtcc < 1:4621602/150‑1 (MQ=255) ataGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCAtcc < 1:2599930/150‑1 (MQ=255) taGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCAtcct > 2:4472555/1‑150 (MQ=255) aGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCAtcctc > 1:4673105/1‑150 (MQ=255) gATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCAtcctcc > 2:3567620/1‑150 (MQ=255) tGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGc > 1:4029627/1‑150 (MQ=255) agaAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTa < 1:2908597/150‑1 (MQ=255) ttGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACa > 2:2960097/1‑150 (MQ=255) tGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAg < 1:270634/150‑1 (MQ=255) atatAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGtt < 1:1282605/150‑1 (MQ=255) ataGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGttaa > 1:853997/1‑150 (MQ=255) gATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGttaatta > 1:147585/1‑150 (MQ=255) tCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTaaa < 1:3161315/150‑1 (MQ=255) cATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTaaaa < 2:4967570/150‑1 (MQ=255) atatCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAg > 1:26074/1‑150 (MQ=255) atatCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAg < 1:4762731/150‑1 (MQ=255) atatCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTAAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAg > 2:2124081/1‑150 (MQ=255) atCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAggg < 2:3859329/150‑1 (MQ=255) tctcGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGa > 1:669991/1‑150 (MQ=255) cGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATATAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCa < 2:2452622/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCAt < 2:885867/150‑1 (MQ=255) ggCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAgg < 2:2360698/150‑1 (MQ=255) ggCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAgg > 2:2445051/1‑150 (MQ=255) gCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGc < 1:982939/150‑1 (MQ=255) ataGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAAt < 2:3836300/150‑1 (MQ=255) ataGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAAGAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTATAAGGGAGCATCAGGCGAAt > 1:8203/1‑150 (MQ=255) aaccgCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATTCAAATACGGATTAAACATTTCATTATACAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAAt < 2:3270717/146‑1 (MQ=255) aGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATaa > 2:1200682/1‑150 (MQ=255) ccGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTa > 1:612907/1‑150 (MQ=255) ccGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTa < 2:1569627/150‑1 (MQ=255) cGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATatc < 2:2914914/150‑1 (MQ=255) gCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCAGCAGGCGAATAAAGTAACAatatag > 1:3041777/1‑148 (MQ=255) tGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATatcgatc > 1:424670/1‑150 (MQ=255) ttttATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGtat < 1:1211521/150‑1 (MQ=255) aTGCAAAGACTTATTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGtatttat < 2:3928190/150‑1 (MQ=255) tGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGtatttatt < 1:2061040/150‑1 (MQ=255) tGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGtatttatt < 1:3846911/150‑1 (MQ=255) gCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATttatta > 1:3860831/1‑150 (MQ=255) cAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTaa > 1:2480608/1‑150 (MQ=255) aaaTACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTaaa > 1:991064/1‑150 (MQ=255) aaaTACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTaaa > 1:2025456/1‑150 (MQ=255) aaTACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAAt > 2:3106537/1‑150 (MQ=255) tACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATAc < 1:2235520/150‑1 (MQ=255) aCGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACa < 1:4359500/150‑1 (MQ=255) ggAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACaaa > 2:2527209/1‑150 (MQ=255) ggAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACaaa > 2:4041847/1‑150 (MQ=255) gAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAAt < 1:4897123/150‑1 (MQ=255) gAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAAt < 1:4897153/150‑1 (MQ=255) gTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTa > 2:4457719/1‑150 (MQ=255) gTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTa > 2:1868553/1‑150 (MQ=255) tAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTAc > 1:3010579/1‑150 (MQ=255) aaTATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCg > 1:740193/1‑150 (MQ=255) tatTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGat < 2:4174031/150‑1 (MQ=255) atTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGata > 1:3435762/1‑150 (MQ=255) atTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGata < 2:612907/150‑1 (MQ=255) ttGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATAtt > 2:4064651/1‑150 (MQ=255) ttATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAAc < 1:4875437/150‑1 (MQ=255) ttATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAAc < 2:626345/150‑1 (MQ=255) tATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAAcc > 1:3420284/1‑150 (MQ=255) ccAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTta < 1:1229442/150‑1 (MQ=255) ccAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTta > 2:1837441/1‑150 (MQ=255) ccAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTta > 1:5070444/1‑150 (MQ=255) ccAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTta > 1:5070249/1‑150 (MQ=255) ccAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTta < 1:3825781/150‑1 (MQ=255) cAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTtat < 1:815596/150‑1 (MQ=255) cAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTtat < 2:4944954/150‑1 (MQ=255) ataaaaataaaTTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAAt < 1:944318/150‑1 (MQ=255) ataaaaataaaTTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAAt > 1:3353960/1‑150 (MQ=255) taaaaataaaTTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAAtt < 2:2102683/150‑1 (MQ=255) taaaaataaaTTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAAtt < 2:703731/150‑1 (MQ=255) taaaaataaaTTTTAAAAAATAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAAtt < 2:3954115/150‑1 (MQ=255) aaaataaaTTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTAc > 2:1329173/1‑150 (MQ=255) ataaatTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAat > 2:387703/1‑150 (MQ=255) taaatTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAatt < 2:4735692/150‑1 (MQ=255) ttttAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAAAAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAAttattt < 2:3156/150‑1 (MQ=255) tttAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAAttatttt < 2:1844416/150‑1 (MQ=255) tttAAAAATTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAAttatttt > 2:4582416/1‑150 (MQ=255) tAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAAttattttat > 1:1635842/1‑150 (MQ=255) aaaaaTTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAAttattttatt > 1:2092972/1‑150 (MQ=255) aaaaTTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTttatta < 1:1436165/150‑1 (MQ=255) aaaTTAACAAATGAGTCGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTaa > 2:1529584/1‑150 (MQ=255) cAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAat > 1:3967651/1‑150 (MQ=255) cAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAat > 1:1788422/1‑150 (MQ=255) aaTGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAatat > 2:437048/1‑150 (MQ=255) aaTGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAatat > 2:4865305/1‑150 (MQ=255) aTGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAatata > 1:3248586/1‑150 (MQ=255) aGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAATATATGt < 2:1185664/150‑1 (MQ=255) ttGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATAGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAATATATGTaa > 1:3749829/1‑150 (MQ=255) tGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAATATATGTaaa < 1:1335114/150‑1 (MQ=255) | GATACTAACAAAGCATTATAGATGAGAAATTGATATAGATCATATCTCGCCTGGCTTATAGGCCCGTAACTCGCATGGTTTTTATGCAAATACGGAGTAAATATTTGATTATCCAAATAAAAATAAATTTTAAAAATTAACAAATGAGTTGAATTTTTTCCGCATCCTCCGCTAAAACAGTTAATTAAAAGGGAGCATCAGGCGAATAAAGTAACAATATCGATCGTATTTATTAAATACAAATTACCGATATTTAACCTTATAATTACAATTATTTTATTAATGCAAATATATGTAAA > CP009273/949954‑950252 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |