Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 975,610 | G→T | 7.0% | V1277L (GTG→TTG) | mukB → | chromosome condensin MukBEF, ATPase and DNA‑binding subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 975,610 | 0 | G | T | 7.0% | 896.1 / 36.2 | 256 | V1277L (GTG→TTG) | mukB | chromosome condensin MukBEF, ATPase and DNA‑binding subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (109/129); new base T (9/9); total (118/138) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.09e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
CCTCCCGTGAACAGAAACTGGCGATCAGTTCCCGCAGCGTGGCGAACATCATTCGCAAAACCATTCAGCGCGAGCAGAACCGTATCCGTATGCTCAACCAGGGGTTGCAGAACGTATCGTTTGGTCAGGTGAACAGCGTGCGTCTCAACGTGAACGTGCGTGAAACGCACGCCATGCTACTGGATGTGCTCTCTGAACAGCACGAGCAGCATCAGGATCTGTTTAACAGCAACCGTTTGACCTTCTCGGAAGCGCTGGCGAAACTGTATCAACGTCTTAACCCGCAGATTGATATGGG > CP009273/975461‑975758 | ccTCCCGTGAACAGAAACTGGCGATCAGTTCCCGCAGCGTGGCGAACATCATTCGCAAAACCATTCAGCGCGAGCAGAACCGTATCCGTATGCTCAACCAGGGGTTGCAGAACGTATCGTTTGGTCAGGTGAACAGCGTGCGTCTCaacg > 2:3320545/1‑150 (MQ=255) cTCCCGTGAACAGAAACTGGCGATCAGTTCCCGCAGCGTGGCGAACATCATTCGCAAAACCATTCAGCGCGAGCAGAACCGTATCCGTATGCTCAACCAGGGGTTGCAGAACGTATCGTTTGGTCAGGTGAACAGCGTGCGTCTCaacgt < 1:1061024/150‑1 (MQ=255) cGTGAACAGAAACTGGCGATCAGTTCCCGCAGCGTGGCGAACATCATTCGCAAAACCATTCAGCGCGAGCAGAACCGTATCCGTATGCTCAACCAGGGGTTGCAGAACGTATCGTTTGGTCAGGTGAACAGCGTGCGTCTCaacgtgaac < 1:2612784/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |