| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,565,497 | G→A | 100% | S269L (TCG→TTG) | gadB ← | glutamate decarboxylase B, PLP‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,565,497 | 0 | G | A | 88.9% | 129.3 / 16.3 | 81 | S269L (TCG→TTG) | gadB | glutamate decarboxylase B, PLP‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/8); new base A (28/44); total (29/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.47e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.73e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
CCCAGCGGAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCGATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTG > CP009273/1565455‑1565642 | cccAGCGGAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTa < 1:1273895/150‑1 (MQ=11)cccAGCGGAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTa < 2:4258769/150‑1 (MQ=11)cccAGCGGAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTa < 1:1434382/150‑1 (MQ=11)cccAGCGGAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTa < 1:1434398/150‑1 (MQ=11) ccAGCGGAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTAt < 2:176844/150‑1 (MQ=14) ccAGCGGAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTAt > 2:4853694/1‑150 (MQ=14) cAGCGGAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCGATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATc < 1:1863003/150‑1 (MQ=32) cAGCGGAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATc < 2:2473776/150‑1 (MQ=17) cAGCGGAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATc < 2:2473689/150‑1 (MQ=17) aGCGGAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCg < 1:533793/150‑1 (MQ=17) aGCGGAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCg < 1:533922/150‑1 (MQ=17) gCGGAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACCCGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCgg < 2:5166240/150‑1 (MQ=17) gCGGAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCgg > 2:1691806/1‑150 (MQ=17) cGGAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGc < 1:175185/150‑1 (MQ=17) cGGAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGc > 2:830673/1‑150 (MQ=17) cGGAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGc > 2:3950990/1‑150 (MQ=17) ggAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGcc > 1:4749432/1‑150 (MQ=17) ggAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGcc > 1:1351221/1‑150 (MQ=17) ggAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGcc < 2:1302381/150‑1 (MQ=17) gAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCt > 2:3087769/1‑150 (MQ=17) gAGCCAGACCGAATTGATGGCCTGCAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCt < 2:1934628/150‑1 (MQ=12) aGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTg > 1:3622536/1‑150 (MQ=17) aGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTg < 1:2885586/150‑1 (MQ=17) aGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTg < 1:2886070/150‑1 (MQ=17) aGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTg < 1:2885548/150‑1 (MQ=17) gCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTgg < 2:3034173/150‑1 (MQ=17) gCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTgg < 2:4118575/150‑1 (MQ=17) ccAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGa < 2:1972576/150‑1 (MQ=17) ccAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGa > 2:896813/1‑150 (MQ=17) cAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGaa > 2:3990830/1‑150 (MQ=17) cAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGaa > 1:3771895/1‑150 (MQ=17) cAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGaa > 2:5118062/1‑150 (MQ=17) cAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGaa > 2:5118066/1‑150 (MQ=17) aGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCGATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAAt < 2:1444973/150‑1 (MQ=32) aGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCGATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAAt < 2:4044823/150‑1 (MQ=32) aGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAAt < 1:2982611/150‑1 (MQ=17) aGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCAAGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAAt > 2:894765/1‑150 (MQ=17) gACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAAtt < 1:1385676/150‑1 (MQ=17) aCCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGACttt > 2:3250147/1‑150 (MQ=17) aCCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAAttt < 1:95420/150‑1 (MQ=17) aCCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAAttt < 2:1668578/150‑1 (MQ=17) cGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTAt < 2:63545/150‑1 (MQ=17) caTTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATcc < 1:830963/149‑1 (MQ=17) aaTTTATGGCCTGAAGCACTGATCGATTTCACCCGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATcc < 2:2752112/150‑1 (MQ=17) aaTTTATGGCCTGAAGCACTGATCGATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATcc < 2:2752105/150‑1 (MQ=32) aaTTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCGAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATcc < 1:3128907/150‑1 (MQ=17) aaTTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATcc < 1:3128875/150‑1 (MQ=17) aTTTATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCa < 1:5182977/150‑1 (MQ=17) tttATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAg > 1:3034996/1‑150 (MQ=17) tttATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAg > 1:1577648/1‑150 (MQ=17) tATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGACTTTATCCAgcg > 1:362218/1‑150 (MQ=17) tATGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAgcg > 1:1268115/1‑150 (MQ=17) aTGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAgcgc > 1:141590/1‑150 (MQ=17) aTGGCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAgcgc > 2:3485692/1‑150 (MQ=17) ggCCTGAAGCACTGATCGATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCAt < 1:1837443/150‑1 (MQ=32) ggCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCAt < 2:4097089/150‑1 (MQ=17) ggCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCAt < 2:1501064/150‑1 (MQ=17) ggCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCAt < 2:529180/150‑1 (MQ=17) ggCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCAt < 2:529181/150‑1 (MQ=17) gCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATc < 2:872347/150‑1 (MQ=17) gCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATc < 1:4549937/150‑1 (MQ=17) gCCTGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACAAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATc > 2:1001221/1‑150 (MQ=17) ccTGAAGCACTGATCGATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCg < 1:2075051/150‑1 (MQ=32) tGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTg < 2:4617021/150‑1 (MQ=17) tGAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTg < 2:2558752/150‑1 (MQ=17) gAAGCACTGATCAATTTCACCCGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGc < 1:4743858/150‑1 (MQ=17) gAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGc > 1:2671648/1‑150 (MQ=17) gAAGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGc < 1:4045494/150‑1 (MQ=17) aaGCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCa < 2:462815/150‑1 (MQ=17) gCACTGATCGATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGc > 1:993359/1‑150 (MQ=32) gCACTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCCGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAAGTTATCCAGCGCATCGTGCAGc > 1:2436425/1‑150 (MQ=12) cTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGt > 1:1755332/1‑150 (MQ=17) cTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGt > 1:1012471/1‑150 (MQ=17) cTGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGt > 1:4722626/1‑150 (MQ=17) tGATCGATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGtt < 2:1310718/150‑1 (MQ=32) tGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGtt < 2:5054894/150‑1 (MQ=17) tGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGtt < 2:464459/150‑1 (MQ=17) tGATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGtt < 2:2210588/150‑1 (MQ=17) gATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTtg < 2:551905/150‑1 (MQ=17) gATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTtg < 2:552009/150‑1 (MQ=17) gATCAATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTtg > 2:211127/1‑150 (MQ=17) | CCCAGCGGAGCCAGACCGAATTTATGGCCTGAAGCACTGATCGATTTCACACGCGGCAGGCGGAAGTCCCAGACGATATCCGGGGCGACGAACGGTGCCAGGAAGCCACCGCTGGCAGCGTCGATGTGCATGTCGATGTCGATACCGGTATCGGCCTGGAATTTATCCAGCGCATCGTGCAGCGGTTG > CP009273/1565455‑1565642 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |