Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,986,289 | T→A | 33.4% | N4Y (AAT→TAT) | pgsA ← | phosphatidylglycerophosphate synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,986,289 | 0 | T | A | 33.4% | 353.8 / 282.0 | 254 | N4Y (AAT→TAT) | pgsA | phosphatidylglycerophosphate synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (93/76); new base A (42/43); total (135/119) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.26e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
TGCCAGAAAACCATCGAACCAGTCAGTCACCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGCACTTTTGCAATTTCCTCGACGCTGGCGTT > CP009273/1986140‑1986438 | tGCCAGAAAACCATCGAACCAGTCAGTCACCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATAtt < 1:21349/150‑1 (MQ=255) ccAGAAAACCATCGAACCAGTCAGTCACCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATaaa > 2:3568884/1‑150 (MQ=255) aGAAAACCATCGAACCAGTCAGTCACCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAAt < 2:1797478/150‑1 (MQ=255) aaaaCCATCGAACCAGTCAGTCACCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATCAATGACCAGTACAAAGCATGGGCTAAGGATGACACGGCACAGTGTCAGCAACGGCGGGAGAGTAACTTg > 2:4813954/1‑150 (MQ=255) aaaaCCATCGAACCAGTCAGTCACCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTg < 2:1246164/150‑1 (MQ=255) aaaaCCATCGAACCAGTCAGTCACCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTg > 1:993386/1‑150 (MQ=255) aaaaCCATCGAACCAGTCAGTCACCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTg > 1:440294/1‑150 (MQ=255) aaaaCCATCGAACCAGTCAGTCACCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTg > 1:2794047/1‑150 (MQ=255) aaCCATCGAACCAGTCAGTCACCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATCTTAAATTGCa > 2:4245583/1‑150 (MQ=255) aaCCATCGAACCAGTCAGTCACCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCa > 2:4772832/1‑150 (MQ=255) ccATCGAACCAGTCAGTCACCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATa > 1:1929371/1‑150 (MQ=255) cATCGAACCAGTCAGTCACCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATaa > 2:2345027/1‑150 (MQ=255) gAACCAGTCAGTCACCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGAc > 1:4338691/1‑150 (MQ=255) gAACCAGTCAGTCACCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGAc < 2:299141/150‑1 (MQ=255) aaCCAGTCAGTCACAGCCTCGACTCAGAAAATTAGCGCTGCGGCAAACGTCGAACAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACATAGAATGGGTTAAGGATGACACTGTAAAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACg > 2:1098853/1‑150 (MQ=255) gtcagtcaCCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTaa > 1:353622/1‑150 (MQ=255) gtcagtcaCCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTaa < 1:1965372/150‑1 (MQ=255) tcagtcaCCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAAc < 1:2318128/150‑1 (MQ=255) tcagtcaCCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAAc < 2:466292/150‑1 (MQ=255) cagtcaCCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACt < 2:1185049/150‑1 (MQ=255) cagtcaCCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACt > 1:3110778/1‑150 (MQ=255) agtcaCCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTa > 2:4422730/1‑150 (MQ=255) caCCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCt > 1:849128/1‑150 (MQ=255) caCCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCt < 1:1001405/150‑1 (MQ=255) ccgcGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCtgttgt < 2:590629/150‑1 (MQ=255) cAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGa < 2:2842725/150‑1 (MQ=255) aGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGAt < 2:3667642/150‑1 (MQ=255) gAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGAtt > 1:1206079/1‑150 (MQ=255) gAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGAtt > 2:2751042/1‑150 (MQ=255) aTGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTAccc > 1:4586796/1‑150 (MQ=255) aTGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTAccc < 1:4030922/150‑1 (MQ=255) cgcgGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATg < 2:4901404/150‑1 (MQ=255) gcggcgGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGt < 1:159535/150‑1 (MQ=255) ggcAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTa < 2:3836025/150‑1 (MQ=255) gcAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTAc < 2:3257164/150‑1 (MQ=255) cAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCCATACCAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACa > 2:2657354/1‑150 (MQ=255) cAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACa < 2:1929371/150‑1 (MQ=255) cAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTCCa > 2:2657262/1‑150 (MQ=255) cGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAgaga > 2:3411346/1‑150 (MQ=255) ggCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGAc < 1:4373585/150‑1 (MQ=255) cGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTCTCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACAt > 1:3668786/1‑150 (MQ=255) cGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACAt > 2:2460067/1‑150 (MQ=255) ccAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGACTGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCaa > 2:4148391/1‑150 (MQ=255) ccAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCac > 1:4964397/1‑149 (MQ=255) aGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATg > 2:665615/1‑150 (MQ=255) ggTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGt > 2:1359850/1‑150 (MQ=255) cAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCaa < 1:3080929/150‑1 (MQ=255) cAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCaa > 2:4563111/1‑150 (MQ=255) aGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAAc < 1:3352780/150‑1 (MQ=255) ggCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACg < 1:5056634/150‑1 (MQ=255) gCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGa > 1:1409154/1‑150 (MQ=255) cAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGAc > 1:4084977/1‑150 (MQ=255) aGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACTGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGATACAGAGACATCAATGTTTCAACGAcc > 2:5134714/1‑150 (MQ=255) aGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGAcc > 1:2493281/1‑150 (MQ=255) aGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGAcc > 1:1397127/1‑150 (MQ=255) aaaaGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCagaa > 1:5086004/1‑150 (MQ=255) aaaGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCagaag > 1:3857605/1‑150 (MQ=255) aGACCAATACAACGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGAt < 1:4359277/150‑1 (MQ=255) ccAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCtt < 1:362579/150‑1 (MQ=255) aaTACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCtttt > 1:4902223/1‑150 (MQ=255) tACAAAGAAGGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCt < 2:3606740/150‑1 (MQ=255) aCAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTg > 2:3157403/1‑150 (MQ=255) aCAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTg > 1:1090182/1‑150 (MQ=255) cAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGc > 2:3657011/1‑150 (MQ=255) cAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGc > 1:3282138/1‑150 (MQ=255) aacgAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGcc < 1:404869/147‑1 (MQ=255) aaaGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGcc > 1:2340740/1‑150 (MQ=255) aaaGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGcc < 1:135359/150‑1 (MQ=255) aaaGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGcc < 2:730195/150‑1 (MQ=255) aGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAg < 1:1670965/150‑1 (MQ=255) aTGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGAcc < 1:4123562/150‑1 (MQ=255) gggATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCtt < 2:2220062/150‑1 (MQ=255) gggATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCtt < 1:1020231/150‑1 (MQ=255) ggATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTGTCTGCCAGACCTTg < 1:896881/150‑1 (MQ=255) tAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTgaga > 2:2783008/1‑150 (MQ=255) tAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGa > 2:2789665/1‑150 (MQ=255) aaGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGaa > 2:3701588/1‑150 (MQ=255) aGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGaaa > 1:73075/1‑150 (MQ=255) aGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGaaa > 2:5059453/1‑150 (MQ=255) aTGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAAGTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATAc < 1:4531511/150‑1 (MQ=255) acGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGc > 2:3980386/1‑150 (MQ=255) cGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGCa < 1:1253381/150‑1 (MQ=255) gAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCAAAATACCCGGCACt > 1:5138115/1‑150 (MQ=255) cAGTGTAAGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGACGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGCACtttt > 2:2254458/1‑150 (MQ=255) aaGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTAGCAAAATACCCGGCACTTTTGCAAtt > 2:3393640/1‑150 (MQ=255) aGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGCACTTTTGCAAttt < 1:1545055/150‑1 (MQ=255) aGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGCACTTTTGCAAttt < 2:2861563/150‑1 (MQ=255) aGCAACGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGCACTTTTGCAAttt > 1:4643699/1‑150 (MQ=255) aaCGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGCACTTTTGCAATTTCCt < 1:4245583/150‑1 (MQ=255) aaCGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGCACTTTTGCAATTTCCt < 1:4773068/150‑1 (MQ=255) aCGTAGGGATATTAAATTGCTTAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGCACTTTTGCAATTTCCTc < 2:1477443/150‑1 (MQ=255) aCGTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGCACTTTTGCAATTTCCTc < 1:3471021/150‑1 (MQ=255) cGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGCACTTTTGCAATTTCCTCg < 2:849128/150‑1 (MQ=255) gTAGGGATATAAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGCACTTTTGCAATTTCCTCGa > 2:1590489/1‑150 (MQ=255) ggATATTACATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGCACTTTTGCAATTTCCTCGACGCt < 1:1495868/150‑1 (MQ=255) ggATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGCACTTTTGCAATTTCCTCGACGCt < 1:3216523/150‑1 (MQ=255) ggATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGCACTTTTGCAATTTCCTCGACGCt > 1:3019959/1‑150 (MQ=255) ggATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGCACTTTTGCAATTTCCTCGACGCt > 2:5188821/1‑150 (MQ=255) tataAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGCACTTTTGCAATTTCCTCGACGCTGGc > 2:453149/1‑150 (MQ=255) tAAAGTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGCACTTTTGCAATTTCCTCGACGCTGGCGtt < 1:2661217/150‑1 (MQ=255) | TGCCAGAAAACCATCGAACCAGTCAGTCACCGCCGCGACGCAGAAAATGAGCGCGGCGGCAAACGGCGACCAGGTGACAGGCAGATAAAAGACCAATACAAAGAATGGGATAAGGATGACACGGAACAGTGTAAGCAACGTAGGGATATTAAATTGCATAATGACGGGTAACTATCTGTTGTCAGTAAGATTACCCCTATGTTGCTACAGAGACATCAATGTTTCAACGACCAGAAGATCTTTTCTGCCAGACCTTGCGAAATACCCGGCACTTTTGCAATTTCCTCGACGCTGGCGTT > CP009273/1986140‑1986438 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |