Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,070,058 | C→A | 13.2% | A90A (GCC→GCA) | yeeS → | CP4‑44 prophage; putative DNA repair protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,070,058 | 0 | C | A | 13.2% | 782.6 / 75.1 | 239 | A90A (GCC→GCA) | yeeS | CP4‑44 prophage; putative DNA repair protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (99/108); new base A (15/17); total (114/125) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
ATGGCGGGACTGGAGCGTGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTT > CP009273/2069909‑2070207 | aTGGCGGGACTGGAGCGTGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGcc < 1:973510/150‑1 (MQ=255) tGGCGGGACTGGAGCGTGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCg < 1:3438025/150‑1 (MQ=255) gggACTGGAGCGTGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGc > 2:4644455/1‑150 (MQ=255) gACTGGAGCGTGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCg > 1:369490/1‑150 (MQ=255) tGGAGCGTGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTgg > 2:1248363/1‑150 (MQ=255) gAGCGTGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTa > 2:753963/1‑150 (MQ=255) gAGCGTGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCAGCTGCCGTGGTa < 1:728621/150‑1 (MQ=255) gAGCGTGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCAGCTGCCGTGGTa > 1:104707/1‑150 (MQ=255) cGTGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTg < 1:1438648/150‑1 (MQ=255) cGTGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTg < 2:5149949/150‑1 (MQ=255) tGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGc < 1:3894877/150‑1 (MQ=255) tGAAGAATGCCGGGTGCTGGATCGGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCAGCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGc > 1:3423644/1‑150 (MQ=255) gaagaaTTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCCGAGTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGca < 1:4432520/150‑1 (MQ=255) agaaTTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGcaca < 1:2135184/150‑1 (MQ=255) aaTTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGcacaca > 1:4264973/1‑150 (MQ=255) cGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCAc > 1:343446/1‑150 (MQ=255) gggTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCAGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCAcc < 1:1428315/150‑1 (MQ=255) tGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGt < 1:3096939/150‑1 (MQ=255) cTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTcc < 2:1609329/150‑1 (MQ=255) tGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCg < 1:1736892/150‑1 (MQ=255) tGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCg < 1:2894240/150‑1 (MQ=255) aTCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTg < 1:4582165/150‑1 (MQ=255) tCTGAACAACCAGAATCATCTGATTGCCGGTGAAACCCTCGTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGa < 1:3298024/150‑1 (MQ=255) tGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACACTGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAg < 2:1775222/150‑1 (MQ=255) aacaacCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTc > 1:4041246/1‑150 (MQ=255) aacaacCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTc < 2:4621209/150‑1 (MQ=255) acaacCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTca > 2:531962/1‑150 (MQ=255) aGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCa > 2:1971272/1‑150 (MQ=255) gAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAg < 2:3745512/150‑1 (MQ=255) gAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAg < 2:1148126/150‑1 (MQ=255) aGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACAACAAAGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAgg > 1:2865081/1‑150 (MQ=255) gCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGc < 1:776158/150‑1 (MQ=255) gCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGc < 1:3946457/150‑1 (MQ=255) tGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAg > 1:4873319/1‑150 (MQ=255) aTTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGAc > 1:376757/1‑150 (MQ=255) tGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCg < 2:3577425/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCgg < 1:1930483/150‑1 (MQ=255) ggTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCtt < 2:2065990/150‑1 (MQ=255) ggTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCAGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGACGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCtt > 2:3298212/1‑150 (MQ=255) ggTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCAGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCtt < 2:256660/150‑1 (MQ=255) gTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTa > 2:1284391/1‑150 (MQ=255) gTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCAGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTa < 1:4409726/150‑1 (MQ=255) tGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCAGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTAt > 2:5112348/1‑150 (MQ=255) aaCCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCAc < 1:1156233/150‑1 (MQ=255) aaCCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCAc > 1:2651634/1‑150 (MQ=255) cccTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCg > 1:1190412/1‑150 (MQ=255) ccTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGa > 2:4061164/1‑150 (MQ=255) ccTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGa > 1:2488781/1‑150 (MQ=255) ctctTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGaa < 2:3302232/150‑1 (MQ=255) tctTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAAc < 1:962123/150‑1 (MQ=255) ttCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCAGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGt > 2:3104476/1‑150 (MQ=255) cACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCt < 2:4359057/150‑1 (MQ=255) cACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCt < 1:108602/150‑1 (MQ=255) ggCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTa > 1:4542920/1‑150 (MQ=255) aCCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAg > 1:3954353/1‑150 (MQ=255) ccATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAgg > 1:2401621/1‑150 (MQ=255) aTCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGACCGTCTGGTACAGGCa > 2:1964734/1‑150 (MQ=255) aTCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCa > 1:1400861/1‑150 (MQ=255) tCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCAc < 1:1243926/150‑1 (MQ=255) cAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACt < 2:1830551/150‑1 (MQ=255) aCCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTgg < 1:444573/150‑1 (MQ=255) aCGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCtg > 2:2348781/1‑150 (MQ=255) cGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCtgg < 2:126720/150‑1 (MQ=255) ggAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCtggt > 2:2559176/1‑150 (MQ=255) ggAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCtggt > 2:1423067/1‑150 (MQ=255) ggAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCtggt < 2:3992063/150‑1 (MQ=255) ggAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCAGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCtggt < 1:3012077/150‑1 (MQ=255) aaGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCtggtgg < 1:1887764/150‑1 (MQ=255) gTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGat > 1:3594666/1‑150 (MQ=255) gTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGat < 2:1499836/150‑1 (MQ=255) cATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATc > 2:834677/1‑150 (MQ=255) aTCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATcc < 2:2796713/150‑1 (MQ=255) tCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCg < 1:1636073/150‑1 (MQ=255) cGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTg > 1:2483351/1‑150 (MQ=255) cGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTg > 1:5012565/1‑150 (MQ=255) gggAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGc < 2:4960339/150‑1 (MQ=255) gggAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGc < 1:4941167/150‑1 (MQ=255) ggAAGTTATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGACACACCCATTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCACGTACAGGCACAGCGCCTGGTGGATATCCGGGTGcc > 2:605827/1‑150 (MQ=255) tGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACACTCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGAcc < 2:3482350/150‑1 (MQ=255) tGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGAcc > 2:2002818/1‑150 (MQ=255) tGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGAcc < 1:5076991/150‑1 (MQ=255) tGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGAcc < 2:4163112/150‑1 (MQ=255) tGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCAGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGAcc < 1:4629560/150‑1 (MQ=255) aTTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCAt > 1:534498/1‑150 (MQ=255) aTTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCAt < 2:1217286/150‑1 (MQ=255) aaaCGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTg < 1:2088813/150‑1 (MQ=255) aaCGCGCCCTGTACCACAATGCAGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGa > 1:2611362/1‑150 (MQ=255) gcgcCCTGTACCACAATGCAGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAg < 1:1867647/150‑1 (MQ=255) cgcCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGt < 1:4685349/150‑1 (MQ=255) gcCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTc > 1:122676/1‑150 (MQ=255) gcCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTc < 1:3246744/150‑1 (MQ=255) cTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGt > 2:3316781/1‑150 (MQ=255) cTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGt > 2:711371/1‑150 (MQ=255) gTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTgg > 1:2742496/1‑150 (MQ=255) cacaATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAAc < 1:1823883/150‑1 (MQ=255) aaggCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACCATCACCCGTCCGGGGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGACCGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAg < 2:4363869/147‑1 (MQ=255) aaTGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAg < 2:81195/150‑1 (MQ=255) tGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGt < 1:1247927/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGtt < 1:4121726/150‑1 (MQ=255) cGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGtttt > 2:2768888/1‑150 (MQ=255) | ATGGCGGGACTGGAGCGTGAAGAATTCCGGGTGCTGTATCTGAACAACCAGAATCAGCTGATTGCCGGTGAAACCCTCTTCACCGGCACCATCAACCGCACGGAAGTCCATCCCCGGGAAGTGATTAAACGCGCCCTGTACCACAATGCCGCTGCCGTGGTACTGGCACACAATCACCCGTCCGGTGAAGTCACACCCAGTAAGGCAGACCGGCTTATCACCGAACGTCTGGTACAGGCACTGGGCCTGGTGGATATCCGGGTGCCGGACCATCTGATAGTCGGTGGCAACCAGGTTTT > CP009273/2069909‑2070207 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |