| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 132,632 | 0 | A | T | 20.8% | 534.1 / 130.5 | 224 | V107E (GTG→GAG) | speE | spermidine synthase (putrescine aminopropyltransferase) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (88/89); new base T (21/25); total (110/114) | |||||||||||
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Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
AGATAATGACATCAAAGGTCTGGCTGGTTTGATTAACGAAATTGACGCCATCGTCGATCACCAGCTTAAAGCGCGGATCGTCGTAGCTACCGGCGTTATGGTTGGGTAGATACTGACGGCAGAACGATACGACACCCGCATCGATTTCCACCATCGTGATTGACTCAACGTTTTTATGTCGGGTTACTTCACGCAGCATGGCACCGTCGCCGCCGCCGATAATCAGCACATGTTTCGCGTGACCATGGGCCAGTAGCGGAACATGGGTCATCATCTCATGATAGATAAACTCGTCGCG > CP009273/132483‑132780 | agaTAATGACATCAAAGGTCTGGCTGGTTTGATTAACGAAATTGACGCCATCGTCGATCACCAGCTTAAAGCGCGGATCGTCGTAGCTACCGGCGTTATGGTTGGGTAGATACTGACGGCAGAACGATACGACACCCGCATCGATTTcca > 1:4690153/1‑150 (MQ=255) gaTAATGACATCAAAGGTCTGGCTGGTTTGATTAACGAAATTGACGCCATCGTCGATCACCAGCTTAAAGCGCGGATCGTCGTAGCTACCGGCGTTATGGTTGGGTAGATACTGACGGCAGAACGATACGACACCCGCCTCGATTTccac > 2:4054129/1‑150 (MQ=255) aTGACATCAAAGGTCTGGCTGGTTTGATTAACGAAATTGACGCCATCGTCGATCACCAGCTTAAAGCGCGGATCGTCGTAGCTACCGGCGTTATGGTTGGGTAGATACTGACGGCAGAACGATACGACACCCGCATCGATTTCCTCCATc < 1:4768946/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |