| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 2,379,310 | C→A | 17.4% | intergenic (‑109/‑29) | yfbK ← / → yfbL | Von Willebrand factor domain putative lipoprotein/putative peptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,379,310 | 0 | C | A | 17.4% | 660.5 / 104.5 | 230 | intergenic (‑109/‑29) | yfbK/yfbL | Von Willebrand factor domain putative lipoprotein/putative peptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (95/95); new base A (20/20); total (115/115) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
AAACTACTCATAAGCAACATGATTATATTTTTATTTCGCATATAAAATCCTTTTAAATAAACTCAGGCACCAGACATAAAATATACTCTTTGTATAATCCTGCTAATCTTAATAAAATACAATATCGAAACCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATGAAAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCTGGGTCAATGCATTACCGTCAACGCCCCGACACGCAAGTCCTGAGCAAT > CP009273/2379161‑2379459 | ctactCATAAGCAACATGATTATATTTTTATTTCGCATATAAAATCCTTTTAAATAAACTCAGGCACCAGACATAAAATATACTCTTTGTATAATCCTGCTAATCTTAATAAAATACAATATCGAAACCCATAGCAAATAATGATTcaac > 2:1537596/1‑150 (MQ=255) ctCATAAGCAACATGATTATATTTTTATTTCGCATATAAAATCCTTTTAAATAAACTCAGGCACCAGACATAAAATATACTCTTTGTATAATCCTGCTAATCTTAATAAAATACAATATCGAAACCCATAGCAAATAATGATTCaacaac < 1:39247/150‑1 (MQ=255) aTAAGCAACATGATTATATTTTTATTTCGCATATAAAATCCTTTTAAATAAACTCAGGCACCAGACATAAAATATACTCTTTGTATAATCCTGCTAATCTTAATAAAATACAATATCGAAACCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCa < 2:4969650/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |