| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,897,136 | C→A | 7.3% | intergenic (+403/+970) | ygcE → / ← queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,897,136 | 0 | C | A | 7.3% | 683.9 / 28.2 | 200 | intergenic (+403/+970) | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (97/88); new base A (9/6); total (106/94) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.04e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.11e-01 | |||||||||||
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
CTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTA > CP009273/2896991‑2897283 | cTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTaaa > 1:1015695/1‑150 (MQ=255) atatCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGaaa < 2:3964054/150‑1 (MQ=255) atatCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGaaa < 2:4010525/150‑1 (MQ=255) tatCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGtaaa > 2:1987931/1‑150 (MQ=255) tttATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTATAAAGAAAAAAtt > 2:4047503/1‑150 (MQ=255) aTTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAAc < 1:3996509/150‑1 (MQ=255) ttCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACa < 2:4066766/150‑1 (MQ=255) cATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAgg < 2:2564135/150‑1 (MQ=255) aTAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGc > 2:1204660/1‑150 (MQ=255) aTAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGc < 2:1017280/150‑1 (MQ=255) aGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCAtt < 1:1704642/150‑1 (MQ=255) aCTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAAt < 2:5023497/150‑1 (MQ=255) cTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAAtt > 2:1506861/1‑150 (MQ=255) cTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAAtt > 1:830440/1‑150 (MQ=255) cTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAAtt > 1:353091/1‑150 (MQ=255) atcaACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAatat > 2:3011900/1‑150 (MQ=255) atcaACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAAGTAACAGGCATTAATTCAatat > 2:1993698/1‑150 (MQ=255) atcaACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTATAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAatat > 2:2375560/1‑150 (MQ=255) tcaACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATAtt < 2:555459/150‑1 (MQ=255) tcaACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATAtt < 1:3881262/150‑1 (MQ=255) caACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTa < 1:2626442/150‑1 (MQ=255) aGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTaaaaa < 1:1377176/150‑1 (MQ=255) gTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTATAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAaat > 1:153890/1‑150 (MQ=255) tataGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAaata > 2:1155770/1‑150 (MQ=255) ataGAGTCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAaataa < 2:4677293/150‑1 (MQ=255) ataGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAaataa > 1:3363194/1‑150 (MQ=255) taGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAaataat > 2:1471896/1‑150 (MQ=255) gagGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAACATAATAg > 2:3095612/1‑150 (MQ=255) gagGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAg > 2:4359032/1‑150 (MQ=255) gagGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAg > 2:2429393/1‑150 (MQ=255) agGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGa > 2:2767566/1‑150 (MQ=255) ggCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGAt > 2:3334597/1‑150 (MQ=255) tGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATATATTAAAAttt > 1:549665/1‑150 (MQ=255) ccACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACg > 2:3483355/1‑150 (MQ=255) cACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGa > 1:4666569/1‑150 (MQ=255) ttAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAg > 1:5182840/1‑150 (MQ=255) aGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGaa < 1:1190545/150‑1 (MQ=255) aGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGaa > 1:294651/1‑150 (MQ=255) gCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAAt > 1:5045303/1‑150 (MQ=255) gCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAAt < 1:1678182/150‑1 (MQ=255) gCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTATAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAAt > 1:5130111/1‑150 (MQ=255) cTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCa < 2:3879290/150‑1 (MQ=255) cTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCa < 2:652124/150‑1 (MQ=255) tCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCAt > 2:4592726/1‑150 (MQ=255) tCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCAt < 1:1214676/150‑1 (MQ=255) aaaaCAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAATATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATAc > 2:226224/1‑150 (MQ=255) aaaaCAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATAc > 1:4254270/1‑150 (MQ=255) aaaaCAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATAc > 2:2838524/1‑150 (MQ=255) aaaCAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACa < 1:1822577/150‑1 (MQ=255) aaaGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATa > 1:295471/1‑150 (MQ=255) aaGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAACAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATaa > 1:5119442/1‑150 (MQ=255) aGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAac < 1:3056623/150‑1 (MQ=255) aaaCTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACtt > 1:1928348/1‑150 (MQ=255) aaaCTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACtt > 1:2595557/1‑150 (MQ=255) aaCTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACttt < 2:927835/150‑1 (MQ=255) cTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGa < 2:3069880/150‑1 (MQ=255) ccAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTATAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTa > 1:1602642/1‑150 (MQ=255) aTTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAaatt < 1:2642430/150‑1 (MQ=255) ttattaCTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATATATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCAAACAAATAAAACTTTGATTaaaaata > 2:5069269/1‑146 (MQ=255) ttattaCTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAaattta < 2:854581/150‑1 (MQ=255) tattaCTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAaatttat > 2:4169300/1‑149 (MQ=255) attaCTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAaatttaat > 1:1586441/1‑150 (MQ=255) ttAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTATAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAAtttttt < 1:2070899/150‑1 (MQ=255) tAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTg > 2:1915974/1‑150 (MQ=255) ccAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTAt < 2:2120019/150‑1 (MQ=255) cAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTATAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATc < 2:2648897/150‑1 (MQ=255) aaTGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCg < 2:3218394/150‑1 (MQ=255) gAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATa < 1:1299810/150‑1 (MQ=255) gAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTAGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATa < 2:1653338/150‑1 (MQ=255) aaTAACAAGCTTAAAAAATATCCTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATaa < 1:2807913/150‑1 (MQ=255) aaCAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATtg < 1:3446061/150‑1 (MQ=255) aaCAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATtg > 1:4450333/1‑150 (MQ=255) aCAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTATAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATtgt > 2:2659391/1‑150 (MQ=255) cAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTACATTTATTTTTTTGTATCGATAGTtgtg > 1:2346235/1‑150 (MQ=255) aaGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGa < 2:370355/150‑1 (MQ=255) gCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAAc < 1:1584265/150‑1 (MQ=255) cTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAATAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAAAATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAAcc < 2:3583324/150‑1 (MQ=255) cTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAAcc < 1:709356/150‑1 (MQ=255) cTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAAcc < 1:2497850/150‑1 (MQ=255) ttAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACct < 2:3598451/150‑1 (MQ=255) ttAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACct > 2:382167/1‑150 (MQ=255) ttAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACct < 1:692212/150‑1 (MQ=255) tAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACctc > 1:1177527/1‑150 (MQ=255) tAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACctc > 1:3775310/1‑150 (MQ=255) tAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACctc < 1:3316011/150‑1 (MQ=255) tAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACctc < 2:3380319/150‑1 (MQ=255) tAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTGTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACctc > 1:3775184/1‑150 (MQ=255) aaaaTATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACctctct > 2:4291586/1‑150 (MQ=255) aaaaTATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACctctct < 1:1204428/150‑1 (MQ=255) aaaTATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTg > 1:2235895/1‑150 (MQ=255) aaTATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACGTTGAGTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTgg > 2:4014153/1‑150 (MQ=255) ataCTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCAt < 2:1015695/150‑1 (MQ=255) ataCTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCAt < 2:1645350/150‑1 (MQ=255) ataCTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGCCAt < 1:4728116/150‑1 (MQ=255) ataCTGTTATTATAAAGAAATAATTTACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATTATAGATTAAAATTTCTTATCGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCAt < 2:4238386/150‑1 (MQ=255) aCTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATgg < 2:1684032/150‑1 (MQ=255) gTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGgaga < 1:5151690/150‑1 (MQ=255) ttATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATAGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGaa > 2:4815033/1‑150 (MQ=255) aTTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACt > 1:2904515/1‑150 (MQ=255) ttCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTa > 1:317836/1‑150 (MQ=255) | CTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCTCAAAACAAAGACAAACTTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTA > CP009273/2896991‑2897283 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |