Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,934,843 | G→T | 100% | H50N (CAT→AAT) | ygdD ← | UPF0382 family inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,934,843 | 0 | G | T | 96.9% | 800.1 / 11.7 | 224 | H50N (CAT→AAT) | ygdD | UPF0382 family inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (4/3); new base T (112/104); total (117/107) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
CCCACAAACGCAGATGGGACAGCGCCAGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATGAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATGGCGGCGAAAATCAGCATAAAACGGCTGG > CP009273/2934696‑2934986 | ccACAAACGCAGATGGGACAGCGCCAGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTaaa < 2:744492/150‑1 (MQ=255) caAACGCAGATGGGACAGCGCCAGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTCTTAAACGc > 1:2922454/1‑150 (MQ=255) caAACGCAGATGGGACAGCGCCAGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGc > 1:4967233/1‑150 (MQ=255) aaaCGCAGATGGGACAGCGCCAGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGcc > 1:2692478/1‑150 (MQ=255) cAGATGGGACAGCGCCAGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGTAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTa < 1:2239135/150‑1 (MQ=255) gATGGGACAGCGCCAGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTAtt < 2:4790569/150‑1 (MQ=255) ggACAGCGCCAGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAg < 1:4267717/150‑1 (MQ=255) gACAGCGCCAGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGGGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAgg < 2:946398/150‑1 (MQ=255) aCAGCGCCAGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGc > 1:3949449/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCAGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGcc < 2:3409456/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCgg < 1:1178761/150‑1 (MQ=255) cgcCAGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTACCGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGt < 2:2434019/150‑1 (MQ=255) cgcCAGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGt < 1:4166276/150‑1 (MQ=255) ccAGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCt > 1:2342292/1‑150 (MQ=255) ccAGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCt > 1:4840326/1‑150 (MQ=255) cAGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTg > 1:559856/1‑150 (MQ=255) aGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTgg > 1:839240/1‑150 (MQ=255) aGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTgg > 2:2868379/1‑150 (MQ=255) gCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGAt > 1:1088945/1‑150 (MQ=255) cAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATc > 2:4499924/1‑150 (MQ=255) cAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATc > 1:4403201/1‑150 (MQ=255) aaTAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGAGACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATcc < 2:1959585/150‑1 (MQ=255) aTAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCa > 2:5122307/1‑150 (MQ=255) cTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCAtc < 1:4571330/150‑1 (MQ=255) gCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCacc < 1:1052320/150‑3 (MQ=255) gCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAAc < 2:2979906/150‑1 (MQ=255) gCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAAc < 2:2616005/150‑1 (MQ=255) gCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAAc < 2:4823706/150‑1 (MQ=255) tGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACgg > 2:503496/1‑150 (MQ=255) acacCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCa < 2:3996628/150‑1 (MQ=255) cacCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCAt < 1:1220780/150‑1 (MQ=255) cacCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCAt < 1:3524596/150‑1 (MQ=255) cacCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCAt < 1:4720461/150‑1 (MQ=255) acCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATg < 1:1562191/150‑1 (MQ=255) acCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATg > 1:408661/1‑150 (MQ=255) acCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATg < 1:3396856/150‑1 (MQ=255) gTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGtt > 2:1422254/1‑150 (MQ=255) gCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGtttt < 2:1559519/150‑1 (MQ=255) tAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACt < 1:1565395/150‑1 (MQ=255) tAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACt < 1:710483/150‑1 (MQ=255) aaCGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACtt > 1:4961851/1‑150 (MQ=255) aGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAAcaca > 2:1000243/1‑150 (MQ=255) aGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAAcaca > 2:2906797/1‑150 (MQ=255) ggAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACAt < 2:1232600/150‑1 (MQ=255) aaaaCGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATgc < 2:1043001/150‑1 (MQ=255) aaCGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATgcgc < 2:3536558/150‑1 (MQ=255) aaCGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATgcgc > 1:3687437/1‑150 (MQ=255) aaCGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATgcgc > 1:3873927/1‑150 (MQ=255) aCGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATgcgcg < 2:3270449/150‑1 (MQ=255) aCGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATgcgcg < 2:4855778/150‑1 (MQ=255) cTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCCGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCGCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTTACACATGCGCGccg > 2:3446225/1‑149 (MQ=255) cTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCa < 1:181434/150‑1 (MQ=255) cTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCa < 2:4848922/150‑1 (MQ=255) cTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCa > 1:3038770/1‑150 (MQ=255) cAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCAGCTCAACGGCCCCCATCGTTATACTTAACACATGCGCGCCAAAAgcg > 1:3798056/1‑150 (MQ=255) aGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAgcgc > 2:1577069/1‑150 (MQ=255) gTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGcc > 1:2056743/1‑150 (MQ=255) gTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATGAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGcc > 1:4877204/1‑150 (MQ=255) tAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGccc > 2:3182795/1‑150 (MQ=255) aaaaCCAGCTACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAACCGCCTGGTATTCGCGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCa < 2:4562423/150‑1 (MQ=255) aaaaCCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCa > 2:1495012/1‑150 (MQ=255) aaaCCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCag < 1:2761203/150‑1 (MQ=255) aaCCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCaga < 2:2883723/150‑1 (MQ=255) aaCCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCAGGGTTTTCCTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCaga > 2:2978110/1‑150 (MQ=255) aCCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCagag > 1:1724511/1‑150 (MQ=255) aCCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCagag > 1:439476/1‑150 (MQ=255) aCCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCagag < 2:4967233/150‑1 (MQ=255) aCCAGATACTGATGCGACGCTGAATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCagag < 1:4825981/150‑1 (MQ=255) aTACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCcaca > 1:2352369/1‑150 (MQ=255) cTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACaaaa < 2:106486/150‑1 (MQ=255) aTGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATg < 2:2545055/150‑1 (MQ=255) tGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGa > 2:1650831/1‑150 (MQ=255) gCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGaa > 2:4065839/1‑150 (MQ=255) cGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAg < 2:2714518/150‑1 (MQ=255) cGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCg < 1:5035629/150‑1 (MQ=255) gCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGc > 1:648902/1‑150 (MQ=255) cTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCTTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCt < 1:896726/150‑1 (MQ=255) cTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCt < 1:2407985/150‑1 (MQ=255) cTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCt > 2:3052910/1‑150 (MQ=255) tGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTa > 2:2341514/1‑150 (MQ=255) aTTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATg > 1:555564/1‑150 (MQ=255) aTTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATg > 1:2480297/1‑150 (MQ=255) aTTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATg < 2:789319/150‑1 (MQ=255) ttGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATgg < 2:512013/150‑1 (MQ=255) ttGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATgg < 1:3461513/150‑1 (MQ=255) gCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAACAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATggcg < 2:3974430/150‑1 (MQ=255) gCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATggcg > 1:3774335/1‑150 (MQ=255) aCCTAAGATCGCCTGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATGGCGGCGAAAATCAg < 1:1358306/150‑1 (MQ=255) aCCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAACGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATGGCGGCGAAAATCAg < 2:2143447/150‑1 (MQ=255) aCCTAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATGGCGGCGAAAATCAg < 2:3110307/150‑1 (MQ=255) tAAGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATGGCGGCGAAAATCAGCAt > 2:42742/1‑150 (MQ=255) tAAGATCGCCAGCGTATGAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATGGCGGCGAAAATCAGCAt > 1:3203672/1‑150 (MQ=255) aaGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAACAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATGGCGGCGAAAATCAGCATa < 2:4004449/150‑1 (MQ=255) aaGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATGGCGGCGAAAATCAGCATa > 1:2506044/1‑150 (MQ=255) aGATCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATGGCGGCGAAAATCAGCATaa > 2:313479/1‑150 (MQ=255) tCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATGGCGGCGAAAATCAGCATAAAAc < 2:3861226/150‑1 (MQ=255) tCGCCAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATGGCGGCGAAAATCAGCATAAAAc < 2:1356112/150‑1 (MQ=255) cccgCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATGGCGGCGAAAATCAGCATAAAACGGc < 1:906785/147‑1 (MQ=255) cAGCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATGGCGGCGAAAATCAGCATAAAACGGCt > 2:499446/1‑150 (MQ=255) gCGTATTAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATGGCGGCGAAAATCAGCATAAAACGGCTgg < 2:439361/150‑1 (MQ=255) | CCCACAAACGCAGATGGGACAGCGCCAGGCAATAAAGGCTGCCGCTGAACAACACCGTGCCTAACGCGAGGAAAACGCTACTCCAGTAAAACCAGATACTGATGCGACGCTGCATTGCCACCGCCAGACCTAAGATCGCCAGCGTATGAAACGCCTGGTATTCGAGGCCGGTCTGGATCCAGCCCATCTCAACGGCCCCCATGGTTTTACTTAACACATGCGCGCCAAAAGCGCCCAGAGCCACAAAAATGAAGCCGCTAATGGCGGCGAAAATCAGCATAAAACGGCTGG > CP009273/2934696‑2934986 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |