| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,127,390 | G→A | 6.3% | intergenic (‑74/‑100) | yghS ← / → yghT | putative ATP‑binding protein/putative ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,127,390 | 0 | G | A | 6.3% | 668.9 / 23.0 | 206 | intergenic (‑74/‑100) | yghS/yghT | putative ATP‑binding protein/putative ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (91/102); new base A (7/6); total (98/108) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
CTGAACCATCACATCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTATTGGTAGCGATGGTTC > CP009273/3127241‑3127539 | cTGAACCATCACATCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATtgtg < 2:1907358/150‑1 (MQ=255)cTGAACCATCACATCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATtgtg > 1:3569193/1‑150 (MQ=255) tGAACCATCACATCCTACAATGGCAATATCTCGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGa < 2:4818308/150‑1 (MQ=255) gAACCATCACATCCGACAATGGCAATAACAAGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGAc < 2:4308693/150‑1 (MQ=255) aCCATCACATCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTAACaa > 1:1073135/1‑150 (MQ=255) ccATCACATCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTTCGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAAt > 2:4823196/1‑150 (MQ=255) tCACATCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGt > 2:1583068/1‑150 (MQ=255) acaTCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTa > 1:1342166/1‑150 (MQ=255) acaTCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTa < 1:2905100/150‑1 (MQ=255) acaTCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTa < 1:177049/150‑1 (MQ=255) aTCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAAt < 1:3074916/150‑1 (MQ=255) aTCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAAt > 2:399080/1‑150 (MQ=255) tCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTTGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAAtt < 2:3286947/150‑1 (MQ=255) ccTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATtg < 2:4538653/150‑1 (MQ=255) cTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATtgt > 1:4245556/1‑150 (MQ=255) cTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATtgt < 1:680690/150‑1 (MQ=255) cAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGAc < 2:1095405/150‑1 (MQ=255) cAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGAc < 1:3988085/150‑1 (MQ=255) aTAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCt < 1:1679143/150‑1 (MQ=255) aTAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCt > 1:3297568/1‑150 (MQ=255) acacGCTCTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGaa < 2:5132584/150‑1 (MQ=255) acacGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGaa > 1:348695/1‑150 (MQ=255) acacGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGaa < 2:3696950/150‑1 (MQ=255) acGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTAACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAAtt > 1:2185072/1‑150 (MQ=255) aCTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGc > 2:4781257/1‑150 (MQ=255) cTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCt < 1:3755973/150‑1 (MQ=255) cTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCt > 2:1418371/1‑150 (MQ=255) cTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCt > 2:146002/1‑150 (MQ=255) cTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCt < 2:271792/150‑1 (MQ=255) cTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCt < 1:1158540/150‑1 (MQ=255) cGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCa > 1:4596706/1‑150 (MQ=255) gAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATaaa < 1:2712389/150‑1 (MQ=255) aattaattATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATaaaa < 2:4209699/150‑1 (MQ=255) aattaattATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATaaaa < 2:4210335/150‑1 (MQ=255) aattaattATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATaaaa > 2:2718196/1‑150 (MQ=255) aattaTTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACat > 2:3133854/1‑150 (MQ=255) tattGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATAtt < 1:1388686/150‑1 (MQ=255) tattGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATAtt < 2:4919922/150‑1 (MQ=255) attGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTa < 2:2599870/150‑1 (MQ=255) attGACATATTACGTTGATTAACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTa > 2:4507243/1‑150 (MQ=255) tGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAAc < 2:2283866/150‑1 (MQ=255) tGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAAc < 2:2952695/150‑1 (MQ=255) tatTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCaaat < 2:2059190/150‑1 (MQ=255) atTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCaaata < 2:4375682/150‑1 (MQ=255) ttACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCaaataa > 1:220925/1‑150 (MQ=255) ttACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCaaataa > 1:3435129/1‑150 (MQ=255) aCGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCaaataaat < 1:57065/150‑1 (MQ=255) cGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAaataaata > 1:833473/1‑150 (MQ=255) gTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAatat > 2:4941245/1‑150 (MQ=255) gATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATAtttt > 2:3345554/1‑150 (MQ=255) gATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTAACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATAtttt < 1:4716138/150‑1 (MQ=255) gAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGa < 2:1217014/150‑1 (MQ=255) gAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGa > 1:1452620/1‑150 (MQ=255) aaaaaCCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGat > 2:5067643/1‑150 (MQ=255) aaaaaCCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGat < 1:189800/150‑1 (MQ=255) aaaaCCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGata < 2:4823150/150‑1 (MQ=255) aaaCCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGatat > 1:3666542/1‑150 (MQ=255) aaaCCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTAACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGatat > 2:690663/1‑150 (MQ=255) cGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATttaaa < 1:1247335/150‑1 (MQ=255) gTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTAACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATttaaattaaa > 1:1610537/1‑150 (MQ=255) tAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAg < 1:1201831/150‑1 (MQ=255) taatGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGata > 2:1816226/1‑150 (MQ=255) taatGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTAAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGata < 2:1229599/150‑1 (MQ=255) tATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTc < 1:5182554/150‑1 (MQ=255) ttGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCAt > 1:1529266/1‑150 (MQ=255) tatTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGt > 1:528960/1‑150 (MQ=255) tACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCaa > 2:1726284/1‑150 (MQ=255) aCGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAAt < 2:4997844/150‑1 (MQ=255) aCGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAAt < 2:2416505/150‑1 (MQ=255) gTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATaa > 2:4465101/1‑150 (MQ=255) tGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATACATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAac < 2:1163495/150‑1 (MQ=255) ggTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAaca > 1:4172400/1‑150 (MQ=255) ggTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAaca < 1:2827757/150‑1 (MQ=255) tCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTAACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACAcc < 2:1610537/150‑1 (MQ=255) cGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTc > 2:1070362/1‑150 (MQ=255) gTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTcc > 1:598937/1‑150 (MQ=255) gTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTcc > 2:3777945/1‑150 (MQ=255) gTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTcc > 1:2282081/1‑150 (MQ=255) tGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCa > 2:2779288/1‑150 (MQ=255) cAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTaa > 1:1743704/1‑150 (MQ=255) aGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAAt < 2:1144511/150‑1 (MQ=255) aGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAAt < 2:4373021/150‑1 (MQ=255) aaTATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTg > 2:10638/1‑150 (MQ=255) tatCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGcc > 2:4210076/1‑150 (MQ=255) tatCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGcc > 2:183115/1‑150 (MQ=255) tCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGt < 1:640929/150‑1 (MQ=255) ccGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGtt > 1:5047003/1‑150 (MQ=255) gTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTAt > 1:93194/1‑150 (MQ=255) gTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTAt > 1:1223999/1‑150 (MQ=255) ttCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTAtt < 2:84238/150‑1 (MQ=255) ttCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTAtt < 1:373077/150‑1 (MQ=255) aaCCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGACGTTATTGGt > 2:2194833/1‑150 (MQ=255) aCCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTATTGGTa < 2:3828800/150‑1 (MQ=255) cTTATTGTAACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTATTGGTAGc < 1:4410410/150‑1 (MQ=255) ttATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTATTGGTAGCg < 1:1510092/150‑1 (MQ=255) ttGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTATTGGTAGCGATg > 2:497215/1‑150 (MQ=255) tgACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTATTGGTAGCGATGGtt < 2:348695/150‑1 (MQ=255) gACACTGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACAAATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTATTGGTAGCGATGGTTc < 2:3601235/150‑1 (MQ=255) gACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGTATATATTAATGCAGTCAATAACACCTCCAATAATTGCCGTTATTGGTAGCGATGGTTc > 1:1742251/1‑150 (MQ=255) gACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTATTGGTAGCGATGGTTc > 1:2313270/1‑150 (MQ=255) | CTGAACCATCACATCCTACAATGGCAATAACACGCACTGGCGTGGAATTAATTATTGACATATTACGTTGATTCACGAAAAACCCGGCAGTAAATAATGTATTGAATATTACGTGGTCCGTGCTCAGAATATCCGTTCAACCTTATTGTGACAATGGTTAATTGTGACATTGACCTGAATTACGCTTTCATAAAAACATATTAACCAAATAAATATTTTTAATGGATATTTAAATTAAAGGATATATTCATGCAGTCAATAACACCTCCATTAATTGCCGTTATTGGTAGCGATGGTTC > CP009273/3127241‑3127539 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |