Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,357,615 | A→C | 12.8% | N484H (AAT→CAT) | yhcD → | putative outer membrane fimbrial subunit usher protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,357,615 | 0 | A | C | 12.8% | 603.9 / 79.5 | 218 | N484H (AAT→CAT) | yhcD | putative outer membrane fimbrial subunit usher protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (103/87); new base C (12/16); total (115/103) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.13e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 |
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
CGCCATTATCGCGAACTGTCTGAAGCGATTGATGATGATTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACATCAGTATTCCATTTGGCAGA > CP009273/3357468‑3357764 | cGCCATTATCGCGAACTGTCTGAAGCGATTGATGATGATTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACCAt < 1:1964319/150‑1 (MQ=255) cGCCATTATCGCGAACTGTCTGAAGCGATTGATGATGATTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAAt > 2:1528828/1‑150 (MQ=255) gCCATTATCGCGAACTGTCTGAAGCGATTGATGATGATTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACCATg > 1:970287/1‑150 (MQ=255) aTTATCGCGAACTGTCTGAAGCGATTGATGATGATTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACt > 1:3085935/1‑150 (MQ=255) ttATCGCGAACTGTCTGAAGCGTTTCATGATGTTTATACCGATCCGACTAAAAGCAGTTATGCGCTTTGTTTAAACTGGTCTAACTACATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGAGTc < 2:4790073/150‑1 (MQ=255) tATCGCGAACTGTCTGAAGCGATTGATGATGATTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCa > 1:2942882/1‑150 (MQ=255) tATCGCGAACTGTCTGAAGCGATTGATGATGATTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCa > 2:3879415/1‑150 (MQ=255) tATCGCGAACTGTCTGAAGCGATTGATGATGATTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCa > 1:3707876/1‑150 (MQ=255) cgAACTGTCTGAAGCGATTGATGATGATTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCaa > 1:3405953/1‑150 (MQ=255) cTGTCTGAAGCGATTGATGATGATTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCACCCtt > 1:3624180/1‑150 (MQ=255) tCTGAAGCGATTGATGATGATTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAat < 2:1353901/150‑1 (MQ=255) cTGAAGCGATTGATGATGATTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAata < 2:1430610/150‑1 (MQ=255) gAAGCGATTGATGATGATTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATAtt > 2:2473297/1‑150 (MQ=255) aaGCGATTGATGATGATTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTa < 1:498380/150‑1 (MQ=255) gATTGATGATGATTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTg < 1:3994575/150‑1 (MQ=255) aTTGATGATGATTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTgg > 1:1651065/1‑150 (MQ=255) tgatgatgaTTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGaa < 2:2016057/150‑1 (MQ=255) tgatgatgaTTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGaa > 2:4230585/1‑150 (MQ=255) atgatTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAg > 1:2526201/1‑150 (MQ=255) atgatTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAg < 1:1365899/150‑1 (MQ=255) atgatTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAg < 1:4989380/150‑1 (MQ=255) atTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGt < 2:4845049/150‑1 (MQ=255) ttATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGtt < 1:3648656/150‑1 (MQ=255) tataCCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATCGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTc > 1:2842193/1‑150 (MQ=255) ccGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACCATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAac > 2:2672845/1‑150 (MQ=255) cGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACCATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAtca > 1:5041246/1‑150 (MQ=255) cGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAaca < 1:957493/150‑1 (MQ=255) gATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAacac < 1:1002120/150‑1 (MQ=255) gATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAacac > 1:2498897/1‑150 (MQ=255) aTCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACg < 1:527399/150‑1 (MQ=255) tCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATCTTAACTGGAACAAAGCGTGCAATCACGc > 2:5147273/1‑150 (MQ=255) tCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGc < 1:466636/150‑1 (MQ=255) tCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGc > 1:2296812/1‑150 (MQ=255) ccGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGcc < 2:2650385/150‑1 (MQ=255) gACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCAc < 2:1090978/150‑1 (MQ=255) cTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACgg < 1:1602947/150‑1 (MQ=255) tAAAAGCACTTATGCTCTTGTTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGt < 2:4136029/150‑1 (MQ=255) aaaaGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACCATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGtt > 1:4111886/1‑150 (MQ=255) aaaGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGttt < 1:2412346/150‑1 (MQ=255) aGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTcc < 1:2695093/150‑1 (MQ=255) cACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGt > 1:2114285/1‑150 (MQ=255) cACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGt > 2:4585953/1‑150 (MQ=255) cTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCa > 1:613238/1‑150 (MQ=255) tATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAAc > 1:1267313/1‑150 (MQ=255) cgcTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGgc < 2:3364745/150‑1 (MQ=255) cgcTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGgc > 2:3508257/1‑150 (MQ=255) gcTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGgca > 1:4173377/1‑150 (MQ=255) ttGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGgcagc > 2:4913317/1‑150 (MQ=255) tttAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACCATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCa > 2:4293978/1‑150 (MQ=255) tttAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCa > 2:2959924/1‑150 (MQ=255) tttAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCa > 2:3615677/1‑150 (MQ=255) ttAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCaa > 1:4315663/1‑150 (MQ=255) tGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGt > 1:88122/1‑150 (MQ=255) ggTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACCATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTg < 1:4250219/150‑1 (MQ=255) ggTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACCATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTg < 2:2050064/150‑1 (MQ=255) cTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCtt > 1:1093872/1‑150 (MQ=255) tAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCtta < 2:3975372/150‑2 (MQ=255) tAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTc > 1:2924918/1‑150 (MQ=255) tAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTc < 2:1235507/150‑1 (MQ=255) aaCTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCGTCa > 2:4406617/1‑150 (MQ=255) aTTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAaat > 2:343805/1‑150 (MQ=255) ttCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAaata < 2:784881/150‑1 (MQ=255) tCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACCATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAaataa < 2:2684762/150‑1 (MQ=255) tCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAaataa < 1:347455/150‑1 (MQ=255) tCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAaataa > 1:4458978/1‑150 (MQ=255) tGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACCATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATg < 1:1472660/150‑1 (MQ=255) gtTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACg < 2:1598091/150‑1 (MQ=255) gtTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATGAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACg < 2:2842193/150‑1 (MQ=255) ttCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGAt < 2:1152256/150‑1 (MQ=255) tCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATg < 2:1697813/150‑1 (MQ=255) aaCATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGt < 1:831698/150‑1 (MQ=255) aCATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTg > 1:2708757/1‑150 (MQ=255) cATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGa > 1:1897740/1‑150 (MQ=255) aTCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGAt > 1:1246677/1‑150 (MQ=255) aTCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGAt < 2:55305/150‑1 (MQ=255) aTCAGTGGCTATAAAACATATAGTTAAGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGAt < 1:3792860/150‑1 (MQ=255) cAGTGGATATAAAAAATATAGTTACGACGGTGACCATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCt < 2:5054962/150‑1 (MQ=255) aGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACCATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTg > 2:3281915/1‑150 (MQ=255) aGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTg > 1:749987/1‑150 (MQ=255) aGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTg > 1:2451500/1‑150 (MQ=255) gTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGt < 1:4643264/150‑1 (MQ=255) cTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTa < 1:1154334/150‑1 (MQ=255) cTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTa < 1:1776356/150‑1 (MQ=255) tataAAACATATAGTTACGACGGTGACCATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTAc < 1:3670928/150‑1 (MQ=255) tataAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTAc > 1:2753548/1‑150 (MQ=255) ataAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACg > 1:2662623/1‑150 (MQ=255) taAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGt > 1:1421121/1‑150 (MQ=255) aaaaCATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTc > 2:3312246/1‑150 (MQ=255) atatAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACAt > 2:31594/1‑150 (MQ=255) atatAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACAt > 2:2270023/1‑150 (MQ=255) aGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACATCAGt > 2:4651064/1‑150 (MQ=255) gTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACATCAGTa > 2:3276162/1‑150 (MQ=255) ttACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACATCAGTAt < 1:1801110/150‑1 (MQ=255) acgGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACATCAGTATTCCAt > 1:4795794/1‑150 (MQ=255) ggTGACCATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACATCAGTATTCCAttt < 1:5102884/150‑1 (MQ=255) gTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACATCAGTATTCCATTTg > 1:3479516/1‑150 (MQ=255) gACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACATCAGTATTCCATTTGGc > 2:4468571/1‑150 (MQ=255) cAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACATCAGTATTCCATTTGGCAg < 1:2984880/150‑1 (MQ=255) aaTGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACATCAGTATTCCATTTGGCAGa > 2:4607053/1‑150 (MQ=255) aaTGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACATCAGTATTCCATTTGGCAGa < 2:1795295/150‑1 (MQ=255) | CGCCATTATCGCGAACTGTCTGAAGCGATTGATGATGATTATACCGATCCGACTAAAAGCACTTATGCGCTTGGTTTAAACTGGTCTAACTCCATTCTGGGTGGTTTCAACATCAGTGGCTATAAAACATATAGTTACGACGGTGACAATGACTCAAGCAACCTTAATATTAACTGGAACAAAGCGTTCAAACACGCCACGGTTTCCGTCAACTGGCAGCATCAACTTAGTGCTTCAGAAAATAATGAAGACGATGGTGATCTGTTCTACGTCAACATCAGTATTCCATTTGGCAGA > CP009273/3357468‑3357764 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |