| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,242,023 | G→T | 18.7% | pseudogene (1135/1323 nt) | yjbI → | pseudogene, SopA‑related, pentapeptide repeats‑containing |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,242,023 | 0 | G | T | 18.7% | 585.6 / 104.5 | 214 | pseudogene (1135/1323 nt) | yjbI | pseudogene, SopA‑related, pentapeptide repeats‑containing |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (101/73); new base T (27/13); total (128/86) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.90e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.81e-01 | |||||||||||
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
GTGATGATGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTACTGCG > CP009273/4241874‑4242172 | gTGATGATGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATg < 1:2383346/150‑1 (MQ=255) atgatgTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATTGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGata > 2:3590998/1‑150 (MQ=255) tgTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGtt > 1:3606788/1‑150 (MQ=255) gTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTg < 2:2863460/150‑1 (MQ=255) ttCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGaa < 2:409663/150‑1 (MQ=255) tCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAAt > 2:931743/1‑150 (MQ=255) aCCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATcc < 1:2803928/150‑1 (MQ=255) ccTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATNGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCt < 1:4792518/150‑1 (MQ=255) cTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTa < 1:1680850/150‑1 (MQ=255) cTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTa < 1:5088002/150‑1 (MQ=255) tataTTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTAc > 1:3367605/1‑150 (MQ=255) atatTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTAGAATCCTACa > 1:4715338/1‑150 (MQ=255) ataGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGAt > 1:4246811/1‑150 (MQ=255) aGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATAc > 2:1582242/1‑150 (MQ=255) gAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATAcc > 1:2145915/1‑150 (MQ=255) cttaaGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAAtt < 2:4233214/147‑1 (MQ=255) cTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAAtt < 2:5029448/150‑1 (MQ=255) aaTTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTcc < 2:4133315/150‑1 (MQ=255) gAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTACGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGtata > 1:519128/1‑150 (MQ=255) tttAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTAc > 1:488124/1‑150 (MQ=255) tttAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTAc < 1:4373077/150‑1 (MQ=255) cacGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATc < 1:877679/150‑1 (MQ=255) acGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATcc < 2:4641262/150‑1 (MQ=255) atgaatTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTCTATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGAc > 2:3004724/1‑150 (MQ=255) gaatTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACAt > 1:4467254/1‑150 (MQ=255) gaatTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACAt > 1:2516184/1‑150 (MQ=255) gaatTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACAt > 2:3152278/1‑150 (MQ=255) gaatTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACAt > 2:1453999/1‑150 (MQ=255) gaatTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACAt > 2:2250462/1‑150 (MQ=255) atTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATga > 2:4331015/1‑150 (MQ=255) tAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATgaga > 1:2497384/1‑150 (MQ=255) tAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATgaga > 2:2594307/1‑150 (MQ=255) aaCACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGAt < 2:2798028/150‑1 (MQ=255) acacGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATg > 2:4659455/1‑150 (MQ=255) acGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGtt < 1:699820/150‑1 (MQ=255) gAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGc < 1:4363868/150‑1 (MQ=255) gAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGc > 2:3597540/1‑150 (MQ=255) aaaCGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGcc < 1:2690813/150‑1 (MQ=255) aaaCGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGcc > 2:5069033/1‑150 (MQ=255) aaaCGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGcc < 2:1421333/150‑1 (MQ=255) aaaCGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGcc > 2:1196116/1‑150 (MQ=255) gATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGtt > 1:1326202/1‑150 (MQ=255) aataTCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAAt < 1:3696348/150‑1 (MQ=255) tatCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCt > 1:1253596/1‑150 (MQ=255) aTCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAg > 2:2941795/1‑150 (MQ=255) aTCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCAGTTAATCTTACTCAg > 2:2941986/1‑150 (MQ=255) tCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAgg > 1:4871735/1‑150 (MQ=255) ccTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCATTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGa < 2:1115621/150‑1 (MQ=255) ccTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGa > 2:1887749/1‑150 (MQ=255) cTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGaa < 2:2411723/150‑1 (MQ=255) tGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGaaa > 1:1405062/1‑150 (MQ=255) gTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAac > 1:3470315/1‑150 (MQ=255) gTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAac > 1:3120932/1‑150 (MQ=255) ctcctcAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACt > 2:5162699/1‑150 (MQ=255) ctcctcAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATCCCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACt > 1:2925742/1‑150 (MQ=255) ctcctcAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACt > 1:2926069/1‑150 (MQ=255) cctcAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACttt < 1:4285972/150‑1 (MQ=255) ctcAGTCGTTGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACTCtttt < 1:4145296/150‑1 (MQ=255) ctcAGTCGATGATGGGCCATTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACtttt < 2:3055496/150‑1 (MQ=255) aGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAg > 1:4996187/1‑150 (MQ=255) gTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAgg < 2:1282736/136‑1 (MQ=255) cGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTc > 2:4394897/1‑150 (MQ=255) gatgatGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTcc < 2:2020546/150‑1 (MQ=255) atgatgGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCa < 1:2291258/150‑1 (MQ=255) tgatgGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCaa > 1:1675564/1‑150 (MQ=255) tgatgGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCaa < 1:3429832/150‑1 (MQ=255) atgGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAAt > 1:2434274/1‑150 (MQ=255) atgGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAAt > 2:856356/1‑150 (MQ=255) atgGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAAt > 1:5016466/1‑150 (MQ=255) gggCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAAtct < 1:2869807/150‑1 (MQ=255) gggCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAAtct > 2:1770373/1‑150 (MQ=255) cAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATg < 2:1629335/150‑1 (MQ=255) aGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATgg > 1:4119590/1‑150 (MQ=255) aGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATgg > 1:3444913/1‑150 (MQ=255) aGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATgg > 1:2773881/1‑150 (MQ=255) tggtggTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAat > 2:3377159/1‑150 (MQ=255) tggtggTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAat < 1:383441/150‑1 (MQ=255) tggtggTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAat < 2:3651430/150‑1 (MQ=255) ggtggtAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAata > 2:686371/1‑150 (MQ=255) gtggtAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAatat < 1:3073140/150‑1 (MQ=255) gtggtAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAatat < 2:3940258/150‑1 (MQ=255) gtggtAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAatat < 1:3590998/150‑1 (MQ=255) ggtAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATgc < 2:4686189/150‑1 (MQ=255) ggtAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATgc < 1:2011878/150‑1 (MQ=255) ggtAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATgc > 2:2466099/1‑150 (MQ=255) tAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATgcgc > 1:2956181/1‑150 (MQ=255) aaGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCt > 1:1069677/1‑150 (MQ=255) aGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCtt > 1:3508774/1‑150 (MQ=255) aGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCtt < 1:1582242/150‑1 (MQ=255) cTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCtttt > 2:797585/1‑150 (MQ=255) cTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCtttt < 1:1339392/150‑1 (MQ=255) cccAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTcc > 2:4897887/1‑150 (MQ=255) cccAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTcc < 2:4946809/150‑1 (MQ=255) gcgcTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCAt > 1:840851/1‑150 (MQ=255) cgcTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCAtt > 1:3682293/1‑150 (MQ=255) cgcTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATAGGAATACCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTAATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCCtt > 2:3886244/1‑150 (MQ=255) cgcTTACATGATATGTTGAATACTACAAAATATACCTATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCAtt < 1:1873598/150‑1 (MQ=255) aCATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTAc < 2:1173697/150‑1 (MQ=255) aCATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTAc > 1:4882496/1‑150 (MQ=255) aTGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTGTTCCCCATTTTTACTg > 1:1101869/1‑150 (MQ=255) | GTGATGATGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTACTGCG > CP009273/4241874‑4242172 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |