| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,365,977 | T→A | 9.7% | A154A (GCT→GCA) | efp → | polyproline‑specific translation elongation factor EF‑P |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,365,977 | 0 | T | A | 9.7% | 665.9 / 50.3 | 203 | A154A (GCT→GCA) | efp | polyproline‑specific translation elongation factor EF‑P |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (85/98); new base A (10/10); total (95/108) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.16e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.51e-01 | |||||||||||
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
TGGCTGCTGGATCAGGCAGAGTGTATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAG > CP009273/4365831‑4366126 | ggCTGCTGGATCAGGCAGAGTGTATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTAccc < 1:4464516/150‑1 (MQ=255) tgctgGATCAGGCAGAGTGTATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGt > 1:1502615/1‑150 (MQ=255) gctgGATCAGGCAGAGTGTATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTc < 2:47520/150‑1 (MQ=255) tgGATCAGGCAGAGTGTATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTa > 2:4824455/1‑150 (MQ=255) gATCAGGCAGAGTGTATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACt < 1:2608275/150‑1 (MQ=255) gATCAGGCAGAGTGTATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACt < 1:2830716/150‑1 (MQ=255) cAGGCAGAGTGTATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGgc > 1:4353737/1‑150 (MQ=255) aGGCAGAGTGTATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGgcg < 2:3096842/150‑1 (MQ=255) ggCAGAGTGTATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGgcgc > 2:4773338/1‑150 (MQ=255) ggCAGAGTGTATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGgcgc > 2:2187148/1‑150 (MQ=255) gCAGAGTGTATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCAACCCTGTCTACTGGCGCt < 2:815877/150‑1 (MQ=255) agagTGTATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCTCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCtgt > 1:2950278/1‑150 (MQ=255) agagTGTATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCtgt > 2:3958525/1‑150 (MQ=255) agTGTATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCAACCCTGTCTACTGGCGCTGTgg > 1:1405223/1‑150 (MQ=255) tgtATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCAACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGtt > 1:3943014/1‑150 (MQ=255) aTCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTaaa < 1:4321228/150‑1 (MQ=255) gTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGtt > 1:250644/1‑150 (MQ=255) tAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTc > 1:1323947/1‑150 (MQ=255) tAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTc > 2:4958001/1‑150 (MQ=255) tAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCGGTGGTTAAAGTTc > 2:2442336/1‑150 (MQ=255) aaCTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTcc < 1:538226/150‑1 (MQ=255) aaCTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCAACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTcc > 2:4029333/1‑150 (MQ=255) tgtgGAATGGTCAGCCGATCTCCGTGACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGt < 1:1896380/150‑1 (MQ=255) aaTGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTa > 2:637543/1‑150 (MQ=255) aaTGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTa < 1:3372707/150‑1 (MQ=255) aTGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTAc > 1:4717837/1‑150 (MQ=255) gTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACaaa < 1:3143801/150‑1 (MQ=255) cAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATc > 2:2934956/1‑150 (MQ=255) aGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCAACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCg > 1:603104/1‑150 (MQ=255) cGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCg < 2:592726/150‑1 (MQ=255) gATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGa < 2:707220/150‑1 (MQ=255) gATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGa > 1:1915389/1‑150 (MQ=255) gATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGa > 2:2932251/1‑150 (MQ=255) gATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTGTGTACAAATCGGCGa > 1:1041174/1‑150 (MQ=255) gATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCAACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGa < 1:1127470/150‑1 (MQ=255) tctcCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAg < 2:2686934/150‑1 (MQ=255) ccGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGtca > 2:3347062/1‑150 (MQ=255) ccGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGtca < 1:2398072/150‑1 (MQ=255) cGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGtcat < 2:4653753/150‑1 (MQ=255) ttACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGtcatca < 2:1903838/150‑1 (MQ=255) ttACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGtcatca > 1:303931/1‑150 (MQ=255) aCTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCaaa < 1:2698903/150‑1 (MQ=255) cgccgccgCACTTCGTTGCTCGGGCAATCGTTGATCCCGAGCCGGGCCTGCCAGGTGCTACCGCAGGGACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGAGCTGGGGTGAACGTTCCGCTGGTGGTACAAAGCGGCGAAGTCATCTAAg < 2:1539360/148‑1 (MQ=255) tCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCAACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGt < 2:1658039/150‑1 (MQ=255) ccgccgAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTg < 1:2647094/150‑1 (MQ=255) ccgccgAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTg < 1:788256/150‑1 (MQ=255) cgAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCAACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATa < 2:505303/150‑1 (MQ=255) tCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGct < 2:1314005/150‑1 (MQ=255) gTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGctct > 1:579479/1‑150 (MQ=255) gTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGctct < 1:3489936/150‑1 (MQ=255) ttGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTg < 2:3491076/150‑1 (MQ=255) tGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTgg > 1:4590036/1‑150 (MQ=255) gAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGt < 1:4078891/150‑1 (MQ=255) aCTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCCTCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGa > 1:217475/1‑150 (MQ=255) tGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAAt > 1:214908/1‑150 (MQ=255) tGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAAt > 1:2673484/1‑150 (MQ=255) ggAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATa < 1:1552770/150‑1 (MQ=255) gAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATAc > 1:1462863/1‑150 (MQ=255) gAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCAACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATAc < 2:1405223/150‑1 (MQ=255) gAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCAACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATAc < 1:3654271/150‑1 (MQ=255) aaaTCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACg > 1:216429/1‑150 (MQ=255) aTCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGtc < 2:1844055/150‑1 (MQ=255) aTCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGtc < 1:1710006/150‑1 (MQ=255) tCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGtct < 1:2375823/150‑1 (MQ=255) cGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGtctc < 1:3441619/150‑1 (MQ=255) cGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGtctc < 1:3958525/150‑1 (MQ=255) cGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGtctc > 1:5021007/1‑150 (MQ=255) gTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGtctct > 2:3134331/1‑150 (MQ=255) ttGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGtctctc < 2:2149608/150‑1 (MQ=255) ttGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGtctctc > 2:3776323/1‑150 (MQ=255) tGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTcg > 1:1976530/1‑150 (MQ=255) gATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTcgc > 2:4245390/1‑150 (MQ=255) aTACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTcgcg > 2:4708319/1‑150 (MQ=255) gATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAATGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAg < 2:4127096/150‑1 (MQ=255) gATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAg > 1:4606563/1‑150 (MQ=255) aTCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGt < 2:746407/150‑1 (MQ=255) cGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAAt < 2:1041748/150‑1 (MQ=255) gCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCg > 1:4333991/1‑150 (MQ=255) ggTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTgtggt < 1:818870/150‑1 (MQ=255) ggTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTgtggt < 1:4445960/150‑1 (MQ=255) gTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTgtggtg < 2:2424301/150‑1 (MQ=255) tGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGc < 1:2269257/150‑1 (MQ=255) tGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGc < 1:719383/150‑1 (MQ=255) tGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGc < 2:2464055/150‑1 (MQ=255) gATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCg < 1:2386945/150‑1 (MQ=255) aCCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGcc > 1:119263/1‑150 (MQ=255) cGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGGTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTg > 2:2716277/1‑150 (MQ=255) gCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGc > 2:3458506/1‑150 (MQ=255) gCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGc > 2:1835782/1‑150 (MQ=255) cAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCa > 2:3812746/1‑150 (MQ=255) aGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAg < 1:3246262/150‑1 (MQ=255) gTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGc > 1:4088262/1‑150 (MQ=255) cTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGc > 1:1052476/1‑150 (MQ=255) tggtggCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGCGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCa < 2:2842099/150‑1 (MQ=255) cAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCa < 2:3321338/150‑1 (MQ=255) aaaCCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGACGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCACGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCAGCAGGCTGCACCATCAc > 1:4513009/1‑150 (MQ=255) cGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTAt < 1:3776750/150‑1 (MQ=255) ggCAACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTAtt > 2:2371490/1‑150 (MQ=255) cTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCa < 1:2849994/150‑1 (MQ=255) tACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGGTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAg > 2:720707/1‑150 (MQ=255) | TGGCTGCTGGATCAGGCAGAGTGTATCGTAACTCTGTGGAATGGTCAGCCGATCTCCGTTACTCCGCCGAACTTCGTTGAACTGGAAATCGTTGATACCGATCCGGGCCTGAAAGGTGATACCGCAGGTACTGGTGGCAAACCGGCTACCCTGTCTACTGGCGCTGTGGTTAAAGTTCCGCTGTTTGTACAAATCGGCGAAGTCATCAAAGTGGATACCCGCTCTGGTGAATACGTCTCTCGCGTGAAGTAATGCGGTTGTGGTGCGGCCTGCAGGCTGCACCATCACTTATTCAG > CP009273/4365831‑4366126 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |