New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 2897644 | 386 (1.440) | 3 (0.010) | 3/220 | NT | 1.1% | intergenic (+911/+462) | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis |
? | CP009273 | 2897767 = | 233 (1.100) | intergenic (+1034/+339) | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2897467‑2897644 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggtttatccccgctggcgcggggaacacTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAACAACACATCCATTATGTTAAAGAGCACTTAATCCATTGATTAAAAAGGTAAATATTTAAAATAACTCTATAC > CP009273/2897767‑2897913 TTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTC < 2:3391220/150‑1 TTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTC < 2:3391209/150‑1 TCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCG < 2:2593400/150‑1 CGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCGCACGGACTACAAAGCCGTGTATCTTCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGAAGCACCCATGACCACTTCGG > 1:3233904/1‑150 CGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGG > 1:3233822/1‑150 CGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGG > 1:2049590/1‑150 GCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGT < 2:1113273/150‑1 GCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGT < 2:1113261/150‑1 GCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGT > 1:4074290/1‑150 CAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTT > 1:964385/1‑150 CAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTT > 1:1709738/1‑150 CAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCCTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCGCTCTGCAACAGCAGCACCCATCACCACGTCGGTT > 1:2523930/1‑150 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1:1149966/1‑150 ATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTAT < 1:2703442/150‑1 ATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTAT > 2:3121261/1‑150 TCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGGATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATC > 2:1997376/1‑150 CTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCC > 2:3681772/1‑150 CTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCC > 1:2562633/1‑150 CTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCC > 1:1814275/1‑150 TATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCTGGGAACAAGTTCGCACGGAATAAAAATCCGTTTATCTGCTCTTTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCC < 1:1069679/150‑1 TATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCC > 1:1614402/1‑150 TATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATATGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGTCTCAGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCC > 2:345779/1‑150 TATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAAAACAAATCCGAGTAACTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCAAGGCCACGTCGGATTATCCC > 2:345633/1‑150 ATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCC > 2:2272153/1‑150 TGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCG > 2:1334430/1‑150 TGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGACGGTTTATCCCCG > 1:4421057/1‑150 GGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGC > 2:4220319/1‑150 GGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGC > 1:3700941/1‑150 GGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGC > 2:4220181/1‑150 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CGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAACAACACATCCATTATGTTAAAGAGCACTTAATCCATTGATTAAAAAGGTAAATATTTAAAATAAC < 2:4110522/150‑1 GGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAACAACACATCCATTATGTTAAAGAGCACTTAATCCATTGATTAAAAAGGTAAATATTTAAAATAACTC < 1:444499/150‑1 GGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAACAACACATCCATTATGTTAAAGAGCACTTAATCCATTGATTAAAAAGGTAAATATTTAAAATAACTC < 2:3136686/150‑1 GGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAACAACACATCCATTATGTTAAAGAGCACTTAATCCATTGATTAAAAAGGTAAATATTTAAAATAACTCT > 2:4141330/1‑150 GGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAACAACACATCCATTATGTTAAAGAGCACTTAATCCATTGATTAAAAAGGTAAATATTTAAAATAACTCT < 1:3424407/150‑1 GGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAACAACACATCCATTATGTTAAAGAGCACTTAATCCATTGATTAAAAAGGTAAATATTTAAAATAACTCT < 1:3423844/150‑1 GGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAACAACACATCCATTATGTTAAAGAGCACTTAATCCATTGATTAAAAAGGTAAATATTTAAAATAACTCT > 2:366383/1‑150 GGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTAACAAATTTATAGTATCACACAAACAACACATCCATTATGTTAAAGAGCACTTAATCCATTGATTAAAAAGGTAAATATTTAAAATAACTCT > 2:366400/1‑150 AACACTAGAAAAATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATAACACAAACAACACATCCATTATGTTAAAGTGCACTTAATCCATTGTTTAAAAAGGTAAATATTTAAAATAACTCTAT < 1:3982134/150‑1 ACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAACAACACATCCATTATGTTAAAGAGCACTTAATCCATTGATTAAAAATGTAAATATTTAAAATAACTCTATA > 2:3235669/1‑150 CACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAACAACACATCCATTATGTTAAAGAGCACTTAATCCATTGATTAAAAAGGTAAATATTTAAAATAACTCTATAC > 2:3213895/1‑150 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |