| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | CP009273 | 724,497 | 0 | A | G | 8.1% | 515.2 / 28.1 | 160 | intergenic (‑220/‑93) | kdpF/ybfA | potassium ion accessory transporter subunit/DUF2517 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (93/54); new base G (3/10); total (96/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.71e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.75e-01 | |||||||||||
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |