| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 758,030 | C→A | 7.2% | I351I (ATC→ATA) | sucB → | dihydrolipoyltranssuccinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 758,030 | 0 | C | A | 7.2% | 1253.2 / 50.4 | 332 | I351I (ATC→ATA) | sucB | dihydrolipoyltranssuccinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (149/159); new base A (13/11); total (162/170) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.73e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 337 total aligned reads displayed.
CTGGCAGTCAAAGGCCGTGACGGCAAGCTGACCGTTGAAGATCTGACCGGTGGTAACTTCACCATCACCAACGGTGGTGTGTTCGGTTCCCTGATGTCTACGCCGATCATCAACCCGCCGCAGAGCGCAATTCTGGGTATGCACGCTATCAAAGATCGTCCGATGGCGGTGAATGGTCAGGTTGAGATCCTGCCGATGATGTACCTGGCGCTGTCCTACGATCACCGTCTGATCGATGGTCGCGAATCCGTGGGCTTCCTGGTAACGATCAAAGAGTTGCTGGAAGATCCGACGCGTCT > CP009273/757881‑758179 | tGGCAGTCAAAGGCCGTGACGGCAAGCTGACCGTTGAAGATCCGACCGGTGGTAACTTCACCATCACCAACGGTGGTGTGTTCGGTTCCCTGATGTCTACGCCGATCATCAACCCGCCGCAGAGCGCAATTCTGGGTATGCACGCTATCa > 2:2960765/1‑150 (MQ=255) cAGTCAAAGGCCGTGACGGCAAGCTGACCGTTGAAGATCTGACCGGTGGTAACTTCACCATCACCAACGGTGGTGTGTTCGGTTCCCTGATGTCTACGCCGATCATCAACCCGCCGCAGAGCGCAATTCTGGGTATGCACGCTATCAAAg < 1:3553645/150‑1 (MQ=255) tCAAAGGCCGTGACGGCAAGCTGACCGTTGAAGATCTGACCGGTGGTAACTTCACCATCACCAACGGTGGTGTGTTCGGTTCCCTGATGTCTACGCCGATCATCAACCCGCCGCAGAGCGCAATTCTGGGTATGCACGCTATCAAAGATc > 2:3566815/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |