| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP009273 | 816,078 | C→G | 12.2% | intergenic (+34/‑171) | ybhL → / → ybhM | UPF0005 family inner membrane protein/UPF0005 family inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | CP009273 | 816,078 | 0 | C | G | 12.2% | 463.4 / 6.0 | 177 | intergenic (+34/‑171) | ybhL/ybhM | UPF0005 family inner membrane protein/UPF0005 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (64/87); new base G (2/23); total (67/110) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.49e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
ATACCCGCGACACGTCGAACCTGCGCAAATATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAACCTGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGTTTTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTT > CP009273/815929‑816227 | aTACCCGCGACACGTCGAACCTGCGCAAATATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAACCTGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTc < 2:3700447/150‑1 (MQ=255) tACCCGCGACACGTCGAACCTGCGCAAATATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAACCTGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCg < 2:1439565/150‑1 (MQ=255) tACCCGCGACACGTCGAACCTGCGCAAATATTCCATTCTTGGCGCGTTAACCTTGTATCTGGACTTCATCAACCTGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCg > 2:2992247/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |