Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 833,505 | G→T | 8.0% | intergenic (‑124/+141) | ybiJ ← / ← ybiI | DUF1471 family putative periplasmic protein/DksA‑type zinc finger protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 833,505 | 0 | G | T | 8.0% | 508.0 / 21.4 | 138 | intergenic (‑124/+141) | ybiJ/ybiI | DUF1471 family putative periplasmic protein/DksA‑type zinc finger protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (62/65); new base T (2/9); total (64/74) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.25e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.03e-01 |
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
AACAACAGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACGTTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGATATCTAACCTACTGATAAACCATTTATTTGTTGTACTTATGAACTTGTTTTATACCGCGTGGCAGTCACAGCAGCGTTAAAGGCACGGAATGACACGCAAAATACAAATTATACTCGCTATGCATCTCGCCAGTTGTAGTTAACGTAA > CP009273/833358‑833654 | acaacaGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACGTTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTtata > 2:4571321/1‑150 (MQ=255) acaacaGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACGTTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGata < 2:2256058/150‑1 (MQ=255) caacaGTATTGATAGTTTTCATAATTAATCTCTCGCAGGTGATTTTTGTATAAGTGACGTTGTTTCGTCGATGTGATGAGTATCACGTTTTTTTACGAGAGATAAAATCGAAGAGAATTGACCGCCTTGTTCAAATAAATTGATTGatat < 1:3182909/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |