Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,116,964 | A→G | 100% | intergenic (‑21/+53) | dinI ← / ← pyrC | DNA damage‑inducible protein I/dihydro‑orotase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,116,964 | 0 | A | G | 95.6% | 721.0 / 14.0 | 205 | intergenic (‑21/+53) | dinI/pyrC | DNA damage‑inducible protein I/dihydro‑orotase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (3/6); new base G (101/92); total (107/98) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.20e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.36e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
GTACCGATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCAACCTGTTGCT > CP009273/1116817‑1117108 | gTACCGATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCt > 2:3076626/1‑150 (MQ=255) tACCGATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTg > 1:3996087/1‑150 (MQ=255) tACCGATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTg < 1:1534189/150‑1 (MQ=255) cGATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGtt < 2:2451234/150‑1 (MQ=255) cGATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGtt < 2:38443/150‑1 (MQ=255) gTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGTCTTCAATTAGCATAATAGCCCCCAGGTGAATATGCTGGttatttat > 1:85617/1‑150 (MQ=255) tGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTtata < 2:2518235/150‑1 (MQ=255) tGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCAGTTGAATATTCTGGTTATTtata > 1:3716219/1‑150 (MQ=255) ccTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAg < 1:1330634/150‑1 (MQ=255) ccTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCAGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAg > 1:1075676/1‑150 (MQ=255) cTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAgg > 2:4595162/1‑150 (MQ=255) tCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTa > 2:3134417/1‑150 (MQ=255) tCATTATCAGGAAACGCAGACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTa < 2:196309/150‑1 (MQ=255) cATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTaa < 1:955339/150‑1 (MQ=255) cATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTaa > 1:579222/1‑150 (MQ=255) aTTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTaaa > 1:2074406/1‑150 (MQ=255) aTTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTaaa > 2:755324/1‑150 (MQ=255) aTTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTaaa < 2:1787736/150‑1 (MQ=255) aTCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATa > 2:1190284/1‑150 (MQ=255) aTCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATa < 2:2595316/150‑1 (MQ=255) gAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTa > 2:3612348/1‑150 (MQ=255) aaCGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAAt > 2:1615757/1‑150 (MQ=255) aaCGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAAt < 2:3396664/150‑1 (MQ=255) aaCGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAAt < 2:3999750/150‑1 (MQ=255) aaCGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAAt < 1:803998/150‑1 (MQ=255) aCGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATg < 2:1573136/150‑1 (MQ=255) cGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTAGGGTGACGTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGa > 2:2483255/1‑150 (MQ=255) cTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAg < 2:2775950/150‑1 (MQ=255) aTACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAg < 1:3887586/150‑1 (MQ=255) tACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCGAATGACAACAGGAAGc > 1:1820585/1‑150 (MQ=255) aCGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCt < 1:3076626/150‑1 (MQ=255) gcggGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACg < 1:1520684/150‑1 (MQ=255) gcggGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACg < 2:1075676/150‑1 (MQ=255) gcggGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACg < 1:4566685/150‑1 (MQ=255) gggAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGAt > 1:3494424/1‑150 (MQ=255) gggAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTAGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCAGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGTTAAAATAACAAAATGACAACAGGAAACTAAGAt > 1:1085220/1‑150 (MQ=255) gAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGAttt < 1:2650299/150‑1 (MQ=255) agatCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTAAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTa > 1:1750496/4‑150 (MQ=255) aGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTa < 1:2137274/150‑1 (MQ=255) ttCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTAtt < 1:710981/150‑1 (MQ=255) tCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTg < 1:3166894/150‑1 (MQ=255) tCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACGTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGGTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTg > 2:3373982/1‑150 (MQ=255) ccagccagGGCGTCAAGAGCCCCAGCTGGCACTGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGGTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGttt < 2:2870459/150‑1 (MQ=255) agccagGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGTCTTCAAATCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATAAAGGTAAAATAACCTAATGAAAACAGGAAGCAACGATTTTTATTGTTTaa > 2:3572093/1‑150 (MQ=255) gccagGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAAc < 2:523609/150‑1 (MQ=255) cagGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCAGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATTACAACAGGAAGCTAAGATTTTTATTGTTTAACgg > 1:3458945/1‑150 (MQ=255) agGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAGCAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGa > 1:3522254/1‑150 (MQ=255) ggCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGAcc < 2:945663/150‑1 (MQ=255) gCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCa < 2:878188/150‑1 (MQ=255) aaTAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTa < 1:2424239/150‑1 (MQ=255) gCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGt < 2:4153534/150‑1 (MQ=255) tGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCgg < 1:2143982/150‑1 (MQ=255) tGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCgg > 1:2366631/1‑150 (MQ=255) gCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGAATTTTATTGTTTAACGGAACCGCGTACCGTTTCCCCGGCg > 2:92919/1‑150 (MQ=255) gCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAAAAGCCCCCAGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCg > 1:676219/1‑150 (MQ=255) aaTGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAg < 2:1026268/150‑1 (MQ=255) aaTGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAg < 2:3411730/150‑1 (MQ=255) aTGGAGAAGTGTTCGCTATGGTGACTTCAAATCGCATAATATCCCCCTGTTTAATATGCTGGTTATTTATAAAGGTAAAATAAACTAATTACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAAAGGACCACCGTAACGTTTACCCGGCGAgg > 1:2101232/1‑150 (MQ=255) gagaAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAAt < 1:1190284/150‑1 (MQ=255) agaAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATg < 1:1856627/150‑1 (MQ=255) gaAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATgg < 1:1604233/150‑1 (MQ=255) aGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTTTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCa < 2:3258757/150‑1 (MQ=255) ttttCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCAcc < 1:2978666/150‑1 (MQ=255) cGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCg > 1:3438208/1‑150 (MQ=255) gCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCgt < 1:3807763/150‑1 (MQ=255) tATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCgtgt < 1:396057/150‑1 (MQ=255) tATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCgtgt > 1:3190755/1‑150 (MQ=255) tATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCgtgt > 2:931956/1‑150 (MQ=255) tATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCgtgt > 2:931607/1‑150 (MQ=255) tATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTAGTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCgtgt > 2:1354908/1‑150 (MQ=255) aTGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGtc > 1:535305/1‑150 (MQ=255) ggTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGtcat > 2:3533857/1‑150 (MQ=255) ggTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGtcat > 2:1601974/1‑150 (MQ=255) ggTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGtcat > 2:829885/1‑150 (MQ=255) ggTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGtcat < 2:1925271/150‑1 (MQ=255) gTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGtcatc > 1:1248602/1‑150 (MQ=255) gTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGtcatc > 1:4129282/1‑150 (MQ=255) cTTCAATTCGCATAATATCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGATGAATGGCACCAGCGTGTCAtcagtc > 2:4665620/1‑150 (MQ=255) cTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCAtcagtc > 1:1269504/1‑150 (MQ=255) ttCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCAtcagtca < 1:3328940/150‑1 (MQ=255) ttCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCAtcagtca > 2:3230300/1‑150 (MQ=255) ttCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCg < 1:315350/150‑1 (MQ=255) cGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGAt < 1:4709713/150‑1 (MQ=255) gCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATg < 1:2240527/150‑1 (MQ=255) cATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGc > 1:250177/1‑150 (MQ=255) taataGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCtt < 2:2066929/150‑1 (MQ=255) aataGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCttt > 2:144973/1‑150 (MQ=255) ataGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTc > 2:3890808/1‑150 (MQ=255) ataGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTc < 1:3106675/150‑1 (MQ=255) ataGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTc < 1:738547/150‑1 (MQ=255) taGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCa < 1:280939/150‑1 (MQ=255) aGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAg < 2:1523052/150‑1 (MQ=255) cccTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCAAc > 1:2463020/1‑150 (MQ=255) cccTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTAACGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCAAc > 2:3763142/1‑150 (MQ=255) ccTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCAAcc > 2:2990027/1‑150 (MQ=255) ccTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCAAcc < 2:2964844/150‑1 (MQ=255) tGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCAACCTGTTg > 2:4523779/1‑150 (MQ=255) tGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCAACCTGTTg > 2:1750464/1‑150 (MQ=255) gAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCAACCTGTTGc > 2:1180211/1‑150 (MQ=255) aaTATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGACTGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCAACCTGTTGct > 2:3550199/1‑150 (MQ=255) | GTACCGATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCAACCTGTTGCT > CP009273/1116817‑1117108 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |