| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,197,734 | C→T | 5.1% | R219K (AGA→AAA) | cohE ← | e14 prophage; repressor protein phage e14 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,197,734 | 0 | C | T | 5.1% | 641.6 / 14.8 | 178 | R219K (AGA→AAA) | cohE | e14 prophage; repressor protein phage e14 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (78/90); new base T (6/3); total (85/93) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.12e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
TCGTACGTACCGGGCGGGCTACTTCGTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGAAGGTGGTTTCACCTGTA > CP009273/1197586‑1197883 | tCGTACGTACCGGGCGGGCTACTTCGTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTAtct < 1:2016877/150‑1 (MQ=255) gtacgtacCGGGCGGGCTACTTCGTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTAtcttc > 2:3454090/1‑150 (MQ=255) tacgtacCGGGCGGGCTACTTCGTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTAtcttct < 1:1858837/150‑1 (MQ=255) acgtacCGGGCGGGCTACTTCGTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATcttctt < 1:80305/150‑1 (MQ=255) ccGGGCGGGCTACTTCGTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGttt < 2:556796/150‑1 (MQ=255) cgggcgggCTACTTCGTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGtttt < 1:2736649/150‑1 (MQ=255) gggcgggcTACTTCGTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTc > 1:1019767/1‑150 (MQ=255) gggcgggcTACTTCGTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTc > 1:3405858/1‑150 (MQ=255) gcTACTTCGTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTgaga < 1:1089476/150‑1 (MQ=255) gcTACTTCGTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTgaga < 2:4638817/150‑1 (MQ=255) ttCGTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATc > 2:4671217/1‑150 (MQ=255) ttCGTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATc > 2:2206752/1‑150 (MQ=255) tCGTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATTTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATca > 2:874451/1‑150 (MQ=255) cGTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATTTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATcac > 1:2507050/1‑150 (MQ=255) gTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATcaca > 2:3397685/1‑150 (MQ=255) gTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATcaca > 2:1014661/1‑150 (MQ=255) gTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATcaca < 1:454602/150‑1 (MQ=255) tGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAg < 1:3780800/150‑1 (MQ=255) tGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAg > 2:2028992/1‑150 (MQ=255) tGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAg > 2:2029013/1‑150 (MQ=255) tGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCAAAg > 2:1944917/1‑150 (MQ=255) tCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCaa < 2:3927756/150‑1 (MQ=255) gcctgTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATtat > 1:2900092/1‑150 (MQ=255) ctgTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATag < 1:3932229/150‑1 (MQ=255) gtttgttGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATagag > 1:2267288/1‑150 (MQ=255) ttgttgTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCa < 2:178798/150‑1 (MQ=255) tgttgtTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCaa < 2:4328147/150‑1 (MQ=255) tgttgtTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCaa < 1:4195118/150‑1 (MQ=255) gttgttTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAAt < 1:3755241/150‑1 (MQ=255) tgttTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTa < 1:3689905/150‑1 (MQ=255) tgttTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTa < 1:3784051/150‑1 (MQ=255) gttTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTAc > 2:4700998/1‑150 (MQ=255) tttCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTAcc < 2:3783879/150‑1 (MQ=255) ttCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCg > 1:17416/1‑150 (MQ=255) tctcTTGGGTACATTATTTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATATTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGt > 1:2295615/1‑150 (MQ=255) tctTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTg > 1:2314612/1‑150 (MQ=255) ctTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGa < 1:1269968/150‑1 (MQ=255) gggTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCt < 2:3050928/150‑1 (MQ=255) ggTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCtt < 2:302968/150‑1 (MQ=255) gTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTa < 1:2218145/150‑1 (MQ=255) tACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTaa < 2:1749707/150‑1 (MQ=255) aCATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAAt < 2:495661/150‑1 (MQ=255) aCATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAAt < 2:3542610/150‑1 (MQ=255) tATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTaa > 2:1904244/1‑150 (MQ=255) aTGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAg < 2:308994/150‑1 (MQ=255) aTGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAg < 1:179678/150‑1 (MQ=255) tATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATTTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCt > 1:3695489/1‑150 (MQ=255) tctcAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCa < 1:3291700/150‑1 (MQ=255) tcAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAgg < 1:2519956/150‑1 (MQ=255) aaaGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGcc < 2:3037293/150‑1 (MQ=255) aaaGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGcc > 2:1552629/1‑150 (MQ=255) aGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAg > 2:3136225/1‑150 (MQ=255) tACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTATGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGttt < 1:3848033/150‑1 (MQ=255) gTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGttt > 1:150671/1‑150 (MQ=255) aaGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAAc < 1:3589864/150‑1 (MQ=255) tataAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCt > 2:4189960/1‑150 (MQ=255) taAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCttt > 1:1898125/1‑150 (MQ=255) taAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCttt < 1:3458132/150‑1 (MQ=255) aaaaaaaCCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTg > 2:4345164/1‑150 (MQ=255) aaaaaaaCCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTg < 1:3323216/150‑1 (MQ=255) aaaaaaCCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTga < 2:3098769/150‑1 (MQ=255) aaaaCCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTGgaga > 1:4593739/1‑150 (MQ=255) aaCCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTGTGGGTTTAACGCTTTGAGATa > 2:1398590/1‑150 (MQ=255) aaCCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATATTGTATCTTCTTGGGTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCCTTGATCATAATGTAAGTCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa > 2:2681138/1‑150 (MQ=255) aCCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATaa > 2:1905939/1‑150 (MQ=255) ccTGCCGAAGCAGGTTCATACACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAAc < 2:4483394/150‑1 (MQ=255) ccGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCtg > 2:3377265/1‑150 (MQ=255) ccGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCtg < 1:3348726/150‑1 (MQ=255) cGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCtgt > 1:2863911/1‑150 (MQ=255) cGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTGGAGATAACGCtgt > 1:1008146/1‑150 (MQ=255) aaGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTgtgt < 1:1618287/150‑1 (MQ=255) aaGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTgtgt > 1:3556885/1‑150 (MQ=255) aGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTc > 2:3611185/1‑150 (MQ=255) cAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATTTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTccc > 2:2456784/1‑150 (MQ=255) aGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCa > 1:1802792/1‑150 (MQ=255) ggTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCAt > 1:3901456/1‑150 (MQ=255) aTAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCAtcttct < 2:3263504/150‑1 (MQ=255) aTAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCAtcttct < 1:2686744/150‑1 (MQ=255) aTAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCAtcttct < 1:2685441/150‑1 (MQ=255) aaCATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGATTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATc > 1:4730684/1‑150 (MQ=255) cATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCACTTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCaa > 2:2983300/1‑150 (MQ=255) cATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTAACAATTATAGAGAAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGATTGGGTTTAACGATTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCaa > 2:708005/1‑150 (MQ=255) tAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTg > 2:4628533/1‑150 (MQ=255) tAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTg > 2:345173/1‑150 (MQ=255) aGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGa > 1:279983/1‑150 (MQ=255) aGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGa > 1:1770016/1‑150 (MQ=255) gCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGAAg < 2:331611/150‑1 (MQ=255) gCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGAAg < 2:331892/150‑1 (MQ=255) gCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTGTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGAAg > 2:1137118/1‑150 (MQ=255) cTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGAAgg > 1:1854540/1‑150 (MQ=255) tttGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGAAggt < 1:2374551/150‑1 (MQ=255) ttGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGAAggtg < 2:2835379/150‑1 (MQ=255) tGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGAAggtgg > 2:2766945/1‑150 (MQ=255) ttGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGAAGGTGGTTTCa < 2:4436945/150‑1 (MQ=255) tGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATGATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGAAGGTGGTTTCAc < 1:2461113/150‑1 (MQ=255) tATCGTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGAAGGTGGTTTCACCt < 2:1536090/150‑1 (MQ=255) aTCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGAAGGTGGTTTCACCTg < 2:403998/150‑1 (MQ=255) tcttctTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGAAGGTGGTTTCACCTGt > 1:2472644/1‑150 (MQ=255) tcttctTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGAAGGTGGTTTCACCTGt > 1:3170236/1‑150 (MQ=255) cttcttGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGAAGGTGGTTTCACCTGTa < 2:1039144/150‑1 (MQ=255) | TCGTACGTACCGGGCGGGCTACTTCGTGGGCGTCCTGCCTGTTTGTTGTTTCTCTTGGGTACATTATGTATCTCAAAGGTACATTGTCAAGTATAAAAAAACCTGCCGAAGCAGGTTCATAAACATTGATTAGGCTTTGATTTTGTATCTTCTTGGTTTTCCTGAGAAAATCACAGTACCAATTATAGAGCAATTACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATAACGCTGTGTCCCATCTTCTATCAACCTTTTGAAGGTGGTTTCACCTGTA > CP009273/1197586‑1197883 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |