Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 109,800 | A→T | 8.5% | intergenic (‑94/‑131) | coaE ← / → guaC | dephospho‑CoA kinase/GMP reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 109,800 | 0 | A | T | 8.5% | 629.9 / 40.7 | 188 | intergenic (‑94/‑131) | coaE/guaC | dephospho‑CoA kinase/GMP reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (76/96); new base T (6/10); total (82/106) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.93e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.26e-01 |
Only 100 of 191 total aligned reads displayed.
GCAACGGTACTCTTGCCACTGCCAATGCCTCCCGTTAAGGCAACTATATACCTCATAATTTATATTCCCGGGAATTCATCATGATTATCAAAACGTTAAAAATGAGTGCACGAAAGCGAAATTGATGAAACGTTCGCTCACTATTTACCAGGTAAATTTATGGGATTGTAGCGTAAAAAAAGACAATTTCGCAGTCTTGCGCCGCATTGATTAGTGCGTATGATAGCGTCACTGGAGTTGCGCTCTTACCCTTATAGCCATTAACCCCAGGAATCCGCACATGCGTATTGAAGAAGATC > CP009273/109651‑109949 | aCTCTTGCCACTGCCAATGCCTCCCGTTAAGGCAACTATATACCTCATAATTTATATTCCCGGGAATTCATCATGATTATCAAAACGTTAAAAATGAGTGCACGAAAGCGAAATTGATGAAACGTTCGCTCACTATTTACCAGGTAAAtt < 2:3887359/150‑1 (MQ=255) tctTGCCACTGCCAATGCCTCCCGTGAAGGCAACTATATACCTCATAATTTCTATTCCCGGGAATTCATAATGAGTATCAAAACGTTAAAAATGAGTGCACGACAGCGAAATTGATGAAACGTTCGCTCACTATTTACCAGGTAAATTTa < 2:3969403/150‑1 (MQ=255) ttGCCACTGCCAATGCCTCCCGTTAAGGCAACTATATACCTCATAATTTATATTCCCGGGAATTCATCATGATTATCAAAACGTTAAAAATGAGTGCACGAAAGCGAAATTGATGAAACGTTCGCTCACTATTTACCAGGTAAATTTATg < 1:4082430/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |