| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | CP009273 | 1,521,540 | 0 | T | C | 9.7% | 382.3 / 26.4 | 124 | intergenic (+131/‑619) | yncH/rhsE | IPR020099 family protein/pseudogene, Rhs family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (72/40); new base C (6/6); total (78/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.58e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
TATCCGGCAGGTATGCTAAAAGGATAAATGGCGTTCTCTGTATTTATTCGCAATTATCTGTAGGACAAATATGGAGAGCTTGATGAGTCAGAGCTAAAACAGCAATTGATTAATAAACATGTTGATTTATTCAAGAAAATGGATGTATTTTAAATGTTGATTCTTAATATAACCTAATCAATAGATTATCAAGTGAGAGCTACACATTATTGGAGGGGCAGGGGAAAACACCATTTTGGGAACAATGCATCAGGTACTCTTACCACTGAAGCAAGATCATCCGGCACCAGGTGGTGGT > CP009273/1521391‑1521688 | tatCCGGCAGGTATGCTAAAAGGATAAATGGCGTTCTCTGTATTTATTCGCAATTATCTGTAGGACAAATATGGAGAGCTTGATGAGTCAGAGCTAAAACAGCAATTGATTAATAAACATGTTGATTTATTCAAGAAAATGGATGTAttt > 2:4485875/1‑150 (MQ=255) atCCGGCAGGTATGCTAAAAGGATAAATGGCGTTCTCTGTATTTATTCGCAATTATCTGTAGGACAAATATGGAGAGCTTGATGAGTCAGAGCTAAAACAGCAATTGATTAATAAACATGTTGATTTATTCAAGAAAATTGATGTAtttt > 1:2385927/1‑150 (MQ=255) atCCGGCAGGTATGCTAAAAGGATAAATGGCGTTCTCTGTATTTATTCGCAATTATCTGTAGGACAAATATGGAGAGCTTGATGAGTCAGAGCTAAAACAGCAATTGATTAATAAACATGTTGATTTATTCAAGAAAATGGATGTAtttt > 1:2385901/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |