| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,897,318 | T→A | 5.9% | intergenic (+42/‑21) | manX → / → manY | fused mannose‑specific PTS enzymes: IIA component/IIB component/mannose‑specific enzyme IIC component of PTS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,897,318 | 0 | T | A | 5.9% | 726.6 / 24.9 | 202 | intergenic (+42/‑21) | manX/manY | fused mannose‑specific PTS enzymes: IIA component/IIB component/mannose‑specific enzyme IIC component of PTS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (106/84); new base A (8/4); total (114/88) | |||||||||||
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Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
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tACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTACCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCtt > 1:3913896/1‑150 (MQ=255) tACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTACCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCtt > 2:390728/1‑150 (MQ=255) | GAGGCGTTCAAGAAACTGAATGCGCGCGGTATTGAGCTGGAAGTCCGTAAGGTTTCCACCGATCCGAAACTGAAAATGATGGATCTGATCAGCAAAATCGATAAGTAACGTATTGTGTTGATTATCACTCAGTTTTCACACTTAAGTCTTACGTAAACAGGAGAAGTACAATGGAGATTACCACTCTTCAAATTGTGCTGGTATTTATCGTAGCCTGTATCGCAGGTATGGGATCAATCCTCGATGAATTTCAGTTTCACCGTCCGCTAATCGCGTGTACCCTGGTGGGTATCGTTCTT > CP009273/1897169‑1897467 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |