| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 2,181,645 | A→G | 53.7% | N83N (AAT→AAC) | yehA ← | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 2,181,645 | 0 | A | G | 53.7% | 41.0 / 221.5 | 149 | N83N (AAT→AAC) | yehA | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (27/42); new base G (30/50); total (57/92) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.67e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
TAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTTGAGTAAGTGCAAAATCCCCCTGA > CP009273/2181497‑2181792 | tAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAaat > 1:2611207/1‑150 (MQ=255) aaTCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAaatt > 1:4257525/1‑150 (MQ=255) aaTCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAaatt < 1:4593864/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |