| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 234,984 | G→T | 18.7% | I80I (ATC→ATA) | ykfM ← | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 234,984 | 0 | G | T | 18.7% | 159.1 / 3.7 | 83 | I80I (ATC→ATA) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/35); new base T (15/4); total (44/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.71e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TATTATTACCGCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTT > CP009273/234836‑235124 | tattatTACCGCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGa > 2:736427/1‑150 (MQ=255) attattACCGCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGAt < 2:2881529/150‑1 (MQ=255) ttattaCCGCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGAtt < 1:4607551/150‑1 (MQ=255) ttattaCCGCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGAtt < 1:4606564/150‑1 (MQ=255) tattaCCGCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTa < 1:988940/150‑1 (MQ=255) tattaCCGCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTa < 1:990506/150‑1 (MQ=255) ttaCCGCAGGGGTGATACTTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAg < 2:2765894/150‑1 (MQ=255) ccGCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAAt < 2:2720893/150‑1 (MQ=255) tttttatttAGTTTTTACATTTTCTGTTACAATATGAGATATTATTTTTTCTATTACTTTATCTATTAGTAAAATTATAAGTTTTATGTTTTTTTTTATGTATGTTGCGTAATTGACTTCCTTGTTTTTTTTGATTAAGAATGATTttat < 1:3283878/143‑1 (MQ=255) tAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTtattata > 2:1234555/1‑149 (MQ=255) tAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTtattata > 2:1234599/1‑149 (MQ=255) tAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATc < 2:1984688/150‑1 (MQ=255) tAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATc > 2:715539/1‑150 (MQ=255) aaTTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCg < 2:4668238/150‑1 (MQ=255) aTTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTGTTAAGAATGATTTTATTATAgt > 1:3599189/1‑150 (MQ=255) aTTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATTATTTtattatatt > 1:3599977/1‑147 (MQ=255) ttAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTATGAATGATTTTATTATAgta > 2:3762226/1‑150 (MQ=255) tGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTaaaa < 2:4267181/150‑1 (MQ=255) gACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAAt < 2:2214357/150‑1 (MQ=255) cATATCCTGTGACAAAAGGAGCTCTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTa > 2:450104/1‑150 (MQ=255) cATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATAGTAATTAAAATTa > 2:450105/1‑150 (MQ=255) atatCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTTAGAATTATTTTATTATAGTAATTAAAATTaa > 1:3702073/1‑149 (MQ=255) atatCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTTAGAATTATTTTATTATATTAAGTAAAATTaa > 1:915472/1‑149 (MQ=255) atatCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATAGTAATTAAAATTaa > 1:915458/1‑149 (MQ=255) atatCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTaa > 2:1069691/1‑149 (MQ=255) atatCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAc > 2:1068522/1‑150 (MQ=255) atatCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAc > 2:321496/1‑150 (MQ=255) atatCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAc > 1:1804200/1‑150 (MQ=255) tCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATg < 2:639942/150‑1 (MQ=255) ccTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTGTTTAAGAATTATTTTATTATAGTAATTAAAAATAAATGa > 1:4401921/1‑150 (MQ=255) cTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGaa > 2:2435682/1‑150 (MQ=255) cTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGaa < 2:611310/150‑1 (MQ=255) cTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGaa > 2:2976681/1‑150 (MQ=255) gtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACAataata > 1:917912/1‑150 (MQ=255) aCAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAACAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATAttt < 1:1017725/150‑1 (MQ=255) aCAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATAttt < 2:1712249/150‑1 (MQ=255) cAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTTATAATTTTTTTTTTTTATTTAGTAAAATTAAATTAATttttt > 1:4566800/1‑149 (MQ=255) cAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTa < 2:2163221/150‑1 (MQ=255) aaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaaa < 1:4591709/150‑1 (MQ=255) aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaaaa < 1:3775051/150‑1 (MQ=255) aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaaaa < 1:2039153/150‑1 (MQ=255) aGGATCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaaaaa < 2:2707494/150‑1 (MQ=255) gCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaa < 1:1997792/150‑1 (MQ=255) aaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTTAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGACa > 1:3824134/1‑150 (MQ=255) aaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAATGAAAACGACa > 1:3822867/1‑150 (MQ=255) aGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGAAAt > 1:3925225/1‑150 (MQ=255) tGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTGTTTAATAATGATTTTATTATAGTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAAGAAAAAGACAGGaa > 1:4432166/1‑150 (MQ=255) aTAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAAATATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATAATTAAAAATGAAAAAGACATTAAAACGAAGcac > 1:4636579/1‑150 (MQ=255) aTAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAACGAAGcac > 2:768390/1‑150 (MQ=255) aGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATATTAAGTAAAATTAAAATAATATTTAAAAATGAAAAACAAAAGAAAACAAAGCACAg > 1:586973/1‑150 (MQ=255) atATTAGTAAAAATATAATTTTTAGCTTTATTTTTTTGTCTGTGGCTAAATTTACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAATGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGaa < 2:1373169/149‑1 (MQ=255) tATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAAAGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAAAGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACAAGAAAAAGAATCACAGAAt > 1:308908/1‑150 (MQ=255) tattAAAAATATATGTGTTCGCTTTTTTGTTTTGTCTGTGGCTAATTTGACTACCTTGTTTTTTTTTATTAAGAATGTTTTTTTTATCGTATTTAAATTTACATTAATATTTAAAATGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 1:3149441/147‑1 (MQ=255) tAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAAACaa > 2:2023860/1‑150 (MQ=255) aGTAAAAATATAAGAGTTCGCTGTTTTTTTATTTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAc < 2:1387707/150‑1 (MQ=255) tAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAAATATTTTATTATAGTAAGTAAAAATAAAAGAATATTTTAAAAGTAAAAAGACAGGAAAAAGAAGCACACaaaaaaaca > 1:3324496/1‑143 (MQ=255) tAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTTTTATAGTAAGTAAAAATAAATTAATAATTAAAAAAGAAAAACACATGAAACCCAAGCCCACaaaaaaaaa > 1:3324330/1‑143 (MQ=255) tAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAAAGATTTTATTAAAGTAATTAAAATAAAATTAAAAATTAAAAAAGAAAAAGAAAAGAAACCCCAGCACACAATAAACaa > 1:3324376/1‑149 (MQ=255) tAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATaaaaca > 2:4026525/1‑147 (MQ=255) aaaaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATTAAACCGAAGCACAGAATAAACaat > 2:515249/1‑148 (MQ=255) atatAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACAATAAAATTTAAAAAGGAAAAACACAATAAACCCAAGCACACAATAAACAAtcaac > 2:2040779/1‑147 (MQ=255) tataATATTTAGCTGTTTTTTTATGTCTGTGGCTAATTTGAATACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGAAAAATTACATGAATATTAAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCa < 1:3563025/150‑1 (MQ=255) ataAGTGTTAGCTGTTTTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCaa < 2:2188873/150‑1 (MQ=255) ttgttttgtttTGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCGTATGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAatat < 2:918805/149‑1 (MQ=255) cTGTTTTTTTATGTCTGTGGCGAAATTTACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCGTAAGTAAATTTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAatat < 2:918818/150‑1 (MQ=255) tGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAATCTCCAATCATAAAAAAtt > 1:3096015/1‑150 (MQ=255) tGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATTAAAACGAAGCACAGAATCAACAATCTCCAAaaataaaataat > 1:3096028/1‑148 (MQ=255) tATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCGAAGCACCGAATAAACATTCTCCAATCATAAAATAttta > 2:1216259/1‑149 (MQ=255) tATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTTAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGTAACCGAAGCACAGAATCAAAATTATACAAACATAAAATAtttg > 1:2245048/1‑149 (MQ=255) atttGTTATTTCTGTGGCGAAATTTAATACATTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTc < 2:3702073/148‑1 (MQ=255) tGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAAATAAAAGAATATTTAAAAATTAAAACGACAATAAACCGAAGCACACAATCAAAAATATCCAAGCAAAAAATAattaccg > 1:3265384/1‑146 (MQ=255) ttATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTTATAAATATTTTTTTATAGTAAATAAAATTACAATAAAATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAAACGAAACACAGAATAAAAAATATACAAACAAAAAAAATTTAAGTgg > 1:1391296/1‑150 (MQ=255) tATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAAATACATGAATATTTAAAAATGAAAACGACAAGAAACCCAAACACAGAAAAAAAATTATACCATCAAAAAAAAATTAAGTGGa > 1:543655/1‑150 (MQ=255) gtgggtcGAATTTGACTACTTTCGTTTTTTTGTTTATTATTTATTTTATTATCGTAATTAAATTTAAATTAATATTAAAAATTTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 1:3017023/144‑1 (MQ=255) gtgtctaaaTTTAATACATTTTTTTTTTTGATTAATATTTATTTTATAATCTTAATAAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtttt < 1:4010823/144‑1 (MQ=255) gtgGCTAAATTTACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtttt < 1:4313087/150‑1 (MQ=255) tgGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGATTGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTtta < 2:3942202/150‑1 (MQ=255) aCCTTCTTTTTTTTTATTAATATTTTTTTTTTTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAATGGAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATaga < 1:3698351/150‑1 (MQ=255) aCCTTCTTTTTTTTTATTAATATTTATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTAAAAAAGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATaga < 1:3698285/150‑1 (MQ=255) ccTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATagag < 2:3512341/150‑1 (MQ=255) cTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg > 1:2535667/1‑150 (MQ=255) ggTTTTTTTGATTAACAATGATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATGAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 2:1297737/149‑1 (MQ=255) cGTTTTTTTGATAAATAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 2:1297735/150‑1 (MQ=255) | TATTATTACCGCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTT > CP009273/234836‑235124 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |