| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,617,026 | A→G | 11.0% | T90A (ACA→GCA) | yhhH → | putative immunity protein for putative polymorphic toxin RhsB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,617,026 | 0 | A | G | 11.0% | 468.9 / 41.1 | 155 | T90A (ACA→GCA) | yhhH | putative immunity protein for putative polymorphic toxin RhsB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (86/52); new base G (10/7); total (96/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.96e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
CGCAAGTATGAAAGTGAAGGTAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTAAGGATAATCAAACATCGTGTGCGCT > CP009273/3616879‑3617174 | gcAAGTATGAAAGTGAAGGTAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTaacaa < 2:2375945/150‑1 (MQ=255) aGTATGAAAGTGAAGGTAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAAcaacaa < 2:4579505/150‑1 (MQ=255) gTATGAAAGTGAAGGTAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAg < 1:972977/150‑1 (MQ=255) gAAAGTGAAGGTAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAGCAACAAGTTgg > 1:3478167/1‑150 (MQ=255) aaaGTGAAGGTAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTggg > 2:2109522/1‑150 (MQ=255) aaGTGAAGGTAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGgt > 1:4399849/1‑150 (MQ=255) aaGTGAAGGTAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGgt > 1:4400548/1‑150 (MQ=255) gTGAAGGTAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAGCAACAAGTTGGgttg < 1:1943205/150‑1 (MQ=255) gTGAAGGTAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAGCAACAAGTTGGgttg < 1:1943208/150‑1 (MQ=255) tGAAGGTAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGgttgt > 2:3346320/1‑150 (MQ=255) gAAGGAAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGgttgtt < 1:2268055/150‑1 (MQ=255) gAAGCTAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGgttgtt < 1:4581417/150‑1 (MQ=255) aaGGTAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGttgttg > 2:3760713/1‑150 (MQ=255) acctAAAAATACCGTAATAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGATATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGa < 2:4355274/147‑1 (MQ=255) gTAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGCTGGGTTGTTGAAg < 1:2951432/150‑1 (MQ=255) ctAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGCTGGGTTGTTGAAg < 1:2951197/149‑1 (MQ=255) ctAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGCTGGGTTGTTGAAg < 1:2344314/149‑1 (MQ=255) tAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAgg < 2:1727939/150‑1 (MQ=255) aaaTATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGt < 2:1291205/150‑1 (MQ=255) atatACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTAc < 1:2639769/150‑1 (MQ=255) gTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCAc > 1:1690145/1‑150 (MQ=255) tAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTc > 2:4054152/1‑150 (MQ=255) tAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTc < 1:958442/150‑1 (MQ=255) tAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTAGAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTc < 1:958422/150‑1 (MQ=255) ttGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCaa > 1:919841/1‑150 (MQ=255) tGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCaaa > 1:3495555/1‑150 (MQ=255) aaaTAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCtgg < 1:3379269/150‑1 (MQ=255) aaTAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAGCAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCtggt < 1:1508429/150‑1 (MQ=255) aaTAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCtggt < 1:3893732/150‑1 (MQ=255) aaTAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCtggt < 1:3500733/150‑1 (MQ=255) aaTAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCtggt < 1:3894443/150‑1 (MQ=255) aaTAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCtggt > 2:4445471/1‑150 (MQ=255) aaaGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTggg > 2:4692134/1‑150 (MQ=255) gCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGtt < 2:1600575/150‑1 (MQ=255) gCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGtt < 2:3504069/150‑1 (MQ=255) cTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCTTTATGTACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGATAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATACACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGttt > 2:2448976/1‑150 (MQ=255) cTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGttt > 2:679642/1‑150 (MQ=255) cTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGttt > 2:3049459/1‑150 (MQ=255) cTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGttt > 2:3049452/1‑150 (MQ=255) tataGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGtttt > 1:683969/1‑150 (MQ=255) ataGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGttttt > 1:432187/1‑150 (MQ=255) ataGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGttttt < 1:263944/150‑1 (MQ=255) taGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAGCAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTtta < 1:1190271/150‑1 (MQ=255) aTTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTtattat > 1:2522007/1‑150 (MQ=255) aTTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTtattat > 2:3650645/1‑150 (MQ=255) gAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGaa > 2:3641431/1‑150 (MQ=255) gAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGaa > 2:3641445/1‑150 (MQ=255) aaTTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGaaa > 1:1794230/1‑150 (MQ=255) aTTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAAt < 2:3121849/150‑1 (MQ=255) aGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAgg > 2:1394568/1‑150 (MQ=255) tGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCaa > 2:820166/1‑150 (MQ=255) agaTATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAGCAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCaaaa > 1:1435037/1‑150 (MQ=255) agaTATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAGCAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCaaaa > 1:1434997/1‑150 (MQ=255) gTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATggg > 1:2795415/1‑150 (MQ=255) aaGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGgaga > 2:3458745/1‑150 (MQ=255) gAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAGCAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAAt < 2:3204531/150‑1 (MQ=255) aaTCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAAtt > 1:4396403/1‑150 (MQ=255) aaTCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAAtt > 1:1386314/1‑150 (MQ=255) aaTCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAAtt > 2:1675252/1‑150 (MQ=255) ttATGGACAGGATGCCTCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGaa < 2:4710728/150‑1 (MQ=255) tATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAAt > 2:1042794/1‑150 (MQ=255) tATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAAt < 2:532779/150‑1 (MQ=255) tATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAAt > 1:3286813/1‑150 (MQ=255) tATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAAt > 2:2038353/1‑150 (MQ=255) gCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGa < 1:491948/150‑1 (MQ=255) ccGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGaa < 1:1101863/150‑1 (MQ=255) cAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAAt > 1:3708847/1‑150 (MQ=255) ataagaagaaAAAACATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATa < 2:4099364/148‑1 (MQ=255) agaagaagaAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAGCAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATa < 2:201617/150‑1 (MQ=255) agaagaagaAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAGCAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGAGGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGACAATa > 1:3123667/1‑150 (MQ=255) agaagaagaAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATa > 1:4439268/1‑150 (MQ=255) agaagaagaAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATa < 2:4099298/150‑1 (MQ=255) aagaagaaAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCATACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATATGCAAAAATGATTGTAGAATTATTAATTTTTGACACTGAAAATaat > 1:2043284/1‑149 (MQ=255) aagaagaaAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAg > 2:1349843/1‑150 (MQ=255) agaagaaAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGt < 1:2404523/150‑1 (MQ=255) gaagaaAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTa > 2:1351241/1‑150 (MQ=255) aagaaAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTAt > 1:1332540/1‑150 (MQ=255) aagaaAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTAt > 1:1332557/1‑150 (MQ=255) aagaaAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTAt < 2:432187/150‑1 (MQ=255) agaaAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATg > 1:2760697/1‑150 (MQ=255) aaaaaCCATACGAAATCACTGAGTTAGCAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTa > 1:3682732/1‑150 (MQ=255) aaaaaCCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTa > 1:1938825/1‑150 (MQ=255) aaaaaCCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTa < 2:3639962/150‑1 (MQ=255) aaCCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTAAgg > 1:4431625/1‑150 (MQ=255) aCCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTAAGGa < 1:3652991/150‑1 (MQ=255) cATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTAAGGATa > 2:4366380/1‑150 (MQ=255) aTACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTAAGGATaa > 1:1902174/1‑150 (MQ=255) aTACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTAAGGATaa < 1:3278865/150‑1 (MQ=255) tACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTAAGGATAAt > 2:3144445/1‑150 (MQ=255) aCGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTAAGGATAATc > 2:3094304/1‑150 (MQ=255) cGAAATCACTGAGTTAGCAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTAAGGATAATCa > 1:3276731/1‑150 (MQ=255) gAAATCACTGAGTTAGCAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGACTTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTAAGGATAATCaa > 1:4148895/1‑150 (MQ=255) gAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTAAGGTTAATCaa > 2:3887213/1‑150 (MQ=255) aaaTCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTAAGGATAATCaaa > 2:3509249/1‑150 (MQ=255) aaaTCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTAAGGATAATCaaa > 2:1236266/1‑150 (MQ=255) aaaTCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTAAGGATAATCaaa > 2:1120619/1‑150 (MQ=255) tCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTAAGGATAATCAAACAt > 2:4706508/1‑150 (MQ=255) tGAGTTAACAACAAGCTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTAAGGATAATCAAACATCgtg > 2:2853876/1‑150 (MQ=255) gAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTAAGGATAATCAAACATCgtgt < 1:2277126/150‑1 (MQ=255) aacaacAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTAAGGATAATCAAACATCGTGTGCGCt > 2:1479470/1‑150 (MQ=255) | CGCAAGTATGAAAGTGAAGGTAAATATACCGTTAGAAATTTGGTTAAAAATAAAGCTATAGCATTGGAATTAGCTGAGATATATGTTAAGAATCGTTATGGACAGGATGCCGCAGAAGAAGAAAAACCATACGAAATCACTGAGTTAACAACAAGTTGGGTTGTTGAAGGTACCATTCACTCAGACCAAATTGCTGGTGGGGTTTTTATTATAGAAATAGGCAAAAATGATGGGAGAATTCTGAATTTTGGCCACGGAAAATAAGTATGTAAGGATAATCAAACATCGTGTGCGCT > CP009273/3616879‑3617174 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |