Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 3,907,456 | 0 | C | A | 9.9% | 907.7 / 51.7 | 250 | D369Y (GAT→TAT) | glmU | fused N‑acetyl glucosamine‑1‑phosphate uridyltransferase/glucosamine‑1‑phosphate acetyl transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (122/102); new base A (14/12); total (136/114) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
GCCTTTGCCTACTGTTACCGGGGCCACCAGCTGAGTGTCGGAACCAACAAACACATCGTCGCCGATAATGGTCTTAAATTTATTCGCACCATCGTAGTTGCAGGTAATGGTTCCCGCGCCGATGTTAACGTTATCGCCAATTTCCGCATCGCCCAGGTAAGTCAGATGACCAGCTTTCGAGCCTTTACCCAGACGCGCTTTTTTCATCTCAACGAAGTTACCGACGTGAGCACCTTCCAGCAACTCAGCACCAGGACGCAAACGGGCAAACGGGCCAATGGTACAGGCCGCTGCCAGAT > CP009273/3907307‑3907605 | gcCTTTGCCTACTGTTACCGGGGCCACCAGCTGAGTGTCGGAACCAACAAACACATCGTCGCCGATAATGGTCTTAAATTTATTCGCACCATCGTAGTTGCAGGTAATGGTTCCCGCGCCGATGTTAACGTTATCGCCAATTTCCGCATc > 2:2849498/1‑150 (MQ=255) tGCCTACTGTTACCGGGGCCACCAGCTGAGTGTCGGAACCAACAAACACATCGTCGCCGATAATGGTCTTAAATTTATTCGCACCATCGTAGTTGCAGGTAATGGTTCCCGCGCCGATGTTAACGTTATCGCCAATTTCCGCATCGCCCa > 1:116427/1‑150 (MQ=255) tGCCTACTGTTACCGGGGCCACCAGCTGAGTGTCGGAACCAACAAACACATCGTCGCCGATAATGGTCTTAAATTTATTCGCACCATCGTAGTTGCAGGTAATGGTTCCCGCGCCGATGTTAACGTTATCGCCAATTTCCGCATCGCCCa > 2:634900/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |