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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,944,267 | 0 | A | T | 11.2% | 1226.3 / 108.1 | 371 | pseudogene (348/984 nt) | ilvG | pseudogene, acetolactate synthase 2 large subunit, valine‑insensitive; acetolactate synthase II, large subunit, cryptic, interrupted |
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Only 100 of 374 total aligned reads displayed.
TGTATCGCCACGTCTGGTCCGGGCGCAACCAACCTGATAACCGGGCTTGCGGACGCACTGTTAGATTCCATCCCTGTTGTTGCCATCACCGGTCAAGTGTCCGCACCGTTTATCGGCACTGACGCATTTCAGGAAGTGGATGTCCTGGGATTGTCGTTAGCCTGTACCAAGCACAGCTTTCTGGTGCAGTCGCTGGAAGAGTTGCCGCGCATCATGGCTGAAGCATTCGACGTTGCCTGCTCAGGTCGTCCTGGTCCGGTTCTGGTCGATATCCCAAAAGATATCCAGTTAGCCAG > CP009273/3944118‑3944413 | tatCGCCACGTCTGGTCCGGGCGCAACCAACCTGATAACCGGGCTTGCGGACGCACTGTTAGATTCCATCCCTGTTGTTGCCATCACCGGTCAAGTGTCCGCACCGTTTATCGGCACTGACGCATTTCAGGAAGTGGATGTCCTGGGttt < 2:1842407/150‑1 (MQ=255) tatCGCCACGTCTGGTCCGGGCGCAACCAACCTGATAACCGGGCTTGCGGACGCACTGTTAGATTCCATCCCTGTTGTTGCCATCACCGGTCAAGTGTCCGCACCGTTTATCGGCACTGACGCATTTCAGGAAGTGGATGTCCTGGGAtt > 2:682791/1‑150 (MQ=255) atCGCCACGTCTGGTCCGGGCGCAACCAACCTGATAACCGGGCTTGCGGACGCACTGTTAGATTCCATCCCTGTTGTTGCCATCACCGGTCAAGTGTCCGCACCGTTTATCGGCACTGACGCATTTCAGGAAGTGGATGTCCTGGGATTg < 1:3304573/150‑1 (MQ=255) 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gAAGTGGATGTCCTGGGATTGTCGTTAGCCTGTACCAAGCACAGCTTTCTGGTGCAGTCGCTGGAAGAGTTGCCGCGCATCATGGCTGAAGCATTCGACGTTGCCTGCTCAGGTCGTCCTGGTCCGGTTCTGGTCGATATCCCAAAGGat > 1:3045192/1‑150 (MQ=255) aaGTGGATGTCCTGGGATTGTCGTTAGCCTGTACCAAGCACAGCTTTCTGGTGCAGTCGCTGGAAGAGTTGCCGCGCATCATGGCTGAAGCATTCGACGTTGCCTGCTCAGGTCGTCCTGGTCCGGTTCTGGTCGATATCCCAAAAGata > 2:4554875/1‑150 (MQ=255) aGTGGATGTCCTGGGATTGTCGTTAGCCTGTACCAAGCACAGCTTTCTGGTGCAGTCGCTGGAAGAGTTTCCGCGCATCATGGCTGAAGCATTCGACGTTGCCTGCTCAGGTCGTCCTGGTCCGGTTCTGGTCGATATCCCAAAAGatat > 1:353718/1‑150 (MQ=255) gTGGATGTCCTGGGATTGTCGTTAGCCTGTACCAAGCACAGCTTTCTGGTGCAGTCGCTGGAAGAGTTGCCGCGCATCATGGCTGAAGCATTCGACGTTGCCTGCTCAGGTCGTCCTGGTCCGGTTCTGGTCGATATCCCAAAAGATATc > 2:2841060/1‑150 (MQ=255) gTGGATGTCCTGGGATTGTCGTTAGCCTGTACCAAGCACAGCTTTCTGGTGCAGTCGCTGGAAGAGTTGCCGCGCATCATGGCTGAAGCATTCGACGTTGCCTGCTCAGGTCGTCCTGGTCCGGTTCTGGTCGATATCCCAAAAGATATc < 1:49469/150‑1 (MQ=255) gTGGATGTCCTGGGATTGTCGTTAGCCTGTACCAAGCACAGCTTTCTGGTGCAGTCGCTGGAAGAGTTGCCGCGCATCATGGCTGAAGCATTCGACGTTGCCTGCTCAGGTCGTCCTGGTCCGGTTCTGGTCGATATCCCAAAAGATATc > 1:318656/1‑150 (MQ=255) gTGGATGTCCTGGGATTGTCGTTAGCCTGTACCAAGCACAGCTTTCTGGTGCAGTCGCTGGAAGAGTTGCCGCGCATCATGGCTGAAGCATTCGACGTTGCCTGCTCAGGTCGTCCTGGTCCGGTTCTGGTCGATATCCCAAAAGATATc > 1:4559643/1‑150 (MQ=255) tGGATGTCCTGGGTTTGTCGTTAGCCTGTACCAAGCACAGCTTTCTGGTGCAGTCGCTGGAAGAGTTGCCGCGCATCATGGCTGAAGCATTCGACGTTGCCTGCTCAGGTCGTCCTGGTCCGGTTCTGGTCGATATCCCAAAAGATATcc < 2:4018249/150‑1 (MQ=255) tGGATGTCCTGGGATTGTCGTTAGCCTGTACCAAGCACAGCTTTCTGGTGCAGTCGCTGGAAGAGTTGCCGCGCATCATGGCTGAAGCATTCGACGTTGCCTGCTCAGGTCGTCCTGGTCCGGTTCTGGTCGATATCCCAAAAGATATcc > 1:201379/1‑150 (MQ=255) tGGATGTCCTGGGATTGTCGTTAGCCTGTACCAAGCACAGCTTTCTGGTGCAGTCGCTGGAAGAGTTGCCGCGCATCATGGCTGAAGCATTCGACGTTGCCTGCTCAGGTCGTCCTGGTCCGGTTCTGGTCGATATCCCAAAAGATATcc < 2:1575176/150‑1 (MQ=255) ggATGTCCTGGGATTGTCGTTAGCCTGTACCAAGCACAGCTTTCTGGTGCAGTCGCTGGAAGAGTTGCCGCGCATCATGGCTGAAGCATTCGACGTTGCCTGCTCAGGTCGTCCTGGTCCGGTTCTGGTCGATATCCCAAAAGATATCCa > 2:1723704/1‑150 (MQ=255) gATGTCCTGGGTTTGTCGTTAGCCTGTACCAAGCACAGCTTTCTGGTGCAGTCGCTGGAAGAGTTGCCGCGCATCATGGCTGAAGCATTCGACGTTGCCTGCTCAGGTCGTCCTGGTCCGGTTCTGGTCGATATCCCAAAAGATATCCAg < 2:4349195/150‑1 (MQ=255) gATGTCCTGGGATTGTCGTTAGCCTGTACCAAGCACAGCTTTCTGGTGCAGTCGCTGGAAGAGTTGCCGCGCATCATGGCTGAAGCATTCGACGTTGCCTACTCAGGTCGTCCTGGTCCGGTTCTGGTCGATATCCCAAAAGATATCCAg < 2:4228972/150‑1 (MQ=255) gTCCTGGGATTGTCGTTAGCCTGTACCAAGCACAGCTTTCTGGTGCAGTCGCTGGAAGAGTTGCCGCGCATCATGGCTGAAGCATTCGACGTTGCCTGCTCAGGTCGTCCTGGTCCGGTTCTGGTCGATATCCCAAAAGATATCCAGTTa > 2:1884080/1‑150 (MQ=255) cTGGGATTGTCGTTAGCCTGTACCAAGCACAGCTTTCTGGTGCAGTCGCTGGAAGAGTTGCCGCGCATCATGGCTGAAGCATTCGACGTTGCCTGCTCAGGTCGTCCTGGTCCGGTTCTGGTCGATATCCCAAAAGATATCCAGTTAGcc < 1:2930889/150‑1 (MQ=255) tGGGATTGTCGTTAGCCTGTACCAAGCACAGCTTTCTGGTGCAGTCGCTGGAAGAGTTGCCGCGCATCATGGCTGAAGCATTCGACGTTGCCTGCTCAGGTCGTCCTGGTCCGGTTCTGGTCGATATCCCAAAAGATATCCAGTTAGCCa > 2:3164056/1‑150 (MQ=255) tGGGATTGTCGTTAGCCTGTACCAAGCACAGCTTTCAGGTGCAGTCGCTGGAATAGTTGCCGCGCATCATGGCAGAAGCATTCGACGTTGACTGCTCAGGTCGTCATGGTCCGGTTCTGGTCGATATCCCAAAAGATATCCAGTTAGCCa > 2:794468/1‑150 (MQ=255) | TGTATCGCCACGTCTGGTCCGGGCGCAACCAACCTGATAACCGGGCTTGCGGACGCACTGTTAGATTCCATCCCTGTTGTTGCCATCACCGGTCAAGTGTCCGCACCGTTTATCGGCACTGACGCATTTCAGGAAGTGGATGTCCTGGGATTGTCGTTAGCCTGTACCAAGCACAGCTTTCTGGTGCAGTCGCTGGAAGAGTTGCCGCGCATCATGGCTGAAGCATTCGACGTTGCCTGCTCAGGTCGTCCTGGTCCGGTTCTGGTCGATATCCCAAAAGATATCCAGTTAGCCAG > CP009273/3944118‑3944413 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |