| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,242,023 | G→T | 11.2% | pseudogene (1135/1323 nt) | yjbI → | pseudogene, SopA‑related, pentapeptide repeats‑containing |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,242,023 | 0 | G | T | 11.2% | 587.6 / 43.7 | 170 | pseudogene (1135/1323 nt) | yjbI | pseudogene, SopA‑related, pentapeptide repeats‑containing |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (90/61); new base T (15/4); total (105/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.34e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.30e-01 | |||||||||||
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
GTGATGATGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTACTGCG > CP009273/4241874‑4242172 | gTGATGATGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATg < 1:4289651/150‑1 (MQ=255)gTGATGATGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATg < 1:2750102/150‑1 (MQ=255)gTGATGATGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATg < 1:1476009/150‑1 (MQ=255)gTGATGATGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATg < 1:812361/150‑1 (MQ=255) tgatgaTGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGa < 1:1409390/150‑1 (MQ=255) gatgatGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGat < 1:1211455/150‑1 (MQ=255) gatgatGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGat < 1:3605655/150‑1 (MQ=255) tgTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTCAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGtt > 2:3644170/1‑150 (MQ=255) tgTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTCAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGtt > 2:3644173/1‑150 (MQ=255) gTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTg > 1:1695431/1‑150 (MQ=255) ttCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGaa < 1:249931/150‑1 (MQ=255) tataTTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTAc > 2:1231641/1‑150 (MQ=255) tataTTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTAc > 2:3964827/1‑150 (MQ=255) atatTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACa < 2:568942/150‑1 (MQ=255) atatTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACa < 2:568469/150‑1 (MQ=255) ttATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAg > 2:2813011/1‑150 (MQ=255) ttATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCAGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTCCATGATATGTTGAATCCTACAAAAg > 2:3370506/1‑150 (MQ=255) aGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATAc > 1:647124/1‑150 (MQ=255) aaaCTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCa < 2:1885613/150‑1 (MQ=255) aaCTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCaa < 2:1470456/150‑1 (MQ=255) aaCTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCaa < 1:2547171/150‑1 (MQ=255) tGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTg > 1:2169854/1‑150 (MQ=255) tGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTg > 1:2953166/1‑150 (MQ=255) tGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTg > 1:581562/1‑150 (MQ=255) gAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTgg > 1:1561675/1‑150 (MQ=255) ataTAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGaa > 1:67847/3‑150 (MQ=255) aGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGaa > 2:4326163/1‑150 (MQ=255) gATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAAt > 2:1324239/1‑150 (MQ=255) ttAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACg > 1:1235292/1‑150 (MQ=255) tAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGt > 1:1024539/1‑150 (MQ=255) aaGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGta > 1:232402/1‑150 (MQ=255) aGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGtat > 2:1647376/1‑150 (MQ=255) gAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGtata > 1:2387083/1‑150 (MQ=255) gAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGtata > 1:323739/1‑150 (MQ=255) aaCCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTatat > 2:1333839/1‑150 (MQ=255) aaCCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTatat < 2:1610517/150‑1 (MQ=255) cTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTa > 2:3333259/1‑150 (MQ=255) aaCACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACaaa > 1:144500/1‑150 (MQ=255) aaCACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACaaa > 2:2713724/1‑150 (MQ=255) acGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATcc > 1:3493139/1‑150 (MQ=255) acGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATcc < 2:313934/150‑1 (MQ=255) gaatgaatTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAg < 2:2764977/150‑1 (MQ=255) gaatgaatTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAg < 2:917843/150‑1 (MQ=255) gaatgaatTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAg > 1:1070967/1‑150 (MQ=255) gaatgaatTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAg > 1:1129562/1‑150 (MQ=255) aatgaatTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGa < 1:126788/150‑1 (MQ=255) atgaatTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGAc > 1:4757069/1‑150 (MQ=255) atgaatTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGAc > 1:4757745/1‑150 (MQ=255) atgaatTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGAc > 1:1620541/1‑150 (MQ=255) atgaatTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGAc > 1:2446451/1‑150 (MQ=255) aatTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATg < 1:2760151/150‑1 (MQ=255) aaCACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGAt > 2:306973/1‑150 (MQ=255) aaCACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGAt > 1:3153783/1‑150 (MQ=255) aaCACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGAt > 1:2070192/1‑150 (MQ=255) cGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTg > 1:3574356/1‑150 (MQ=255) aataTCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAAt > 2:3154532/1‑150 (MQ=255) atatCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATc > 2:2835899/1‑150 (MQ=255) atatCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATc > 2:2834912/1‑150 (MQ=255) atatCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATc > 2:1018564/1‑150 (MQ=255) atCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCtt < 2:2368608/150‑1 (MQ=255) tCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTTAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTa < 1:1456304/150‑1 (MQ=255) cTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTAc > 2:1388363/1‑150 (MQ=255) tttATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACt < 2:1071745/150‑1 (MQ=255) tATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCa < 2:2347445/150‑1 (MQ=255) aTCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAg > 2:4298685/1‑150 (MQ=255) tCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAgg > 2:1318729/1‑150 (MQ=255) ccTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGa > 2:4706287/1‑150 (MQ=255) cTGTTCTCATCAGTCGATGATGGGCCAGGTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTAAATGATATGTTGAAACCTACAAAAGATACCAATTTGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATTATATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGaa > 1:3059890/1‑150 (MQ=255) ttCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAaca > 2:2936653/1‑150 (MQ=255) ctcctcAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTGAATCTTACTCAGGAAACACt > 1:4510605/1‑150 (MQ=255) ctcAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACtttt < 1:753505/150‑1 (MQ=255) tcAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTc > 2:522913/1‑150 (MQ=255) tCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCt < 1:909667/150‑1 (MQ=255) tCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCt < 1:2591219/150‑1 (MQ=255) cGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTc > 1:3106778/1‑150 (MQ=255) atgGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAAt < 1:670897/150‑1 (MQ=255) atgGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAAt > 1:2071609/1‑150 (MQ=255) tgGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAAtc < 2:4078842/150‑1 (MQ=255) tgGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAAtc < 2:67847/150‑1 (MQ=255) gggCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATCCCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAAtct > 2:116350/1‑150 (MQ=255) gggCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAAtct < 1:1358154/150‑1 (MQ=255) gCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCa > 1:308886/1‑150 (MQ=255) cAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATg < 2:1495821/150‑1 (MQ=255) aGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATgg > 2:537693/1‑150 (MQ=255) ttATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTa > 1:3063448/1‑150 (MQ=255) ttATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATACTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTa < 1:740870/150‑1 (MQ=255) tggtAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAACTCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATg < 2:1235292/150‑1 (MQ=255) ggtAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATgc < 1:3964827/150‑1 (MQ=255) ggtAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATgc < 1:3964995/150‑1 (MQ=255) aaGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCt > 1:1238017/1‑150 (MQ=255) aaGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCt > 1:3096030/1‑150 (MQ=255) tCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTc < 1:3963486/150‑1 (MQ=255) cccAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTcc > 1:3660815/1‑150 (MQ=255) cgcTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCAtt < 2:3495389/150‑1 (MQ=255) cTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCAtttt < 1:4637181/150‑1 (MQ=255) cTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCAtttt > 2:113971/1‑150 (MQ=255) cTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCAtttt < 1:4636312/150‑1 (MQ=255) ttACATTATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCAttttt < 2:725533/150‑1 (MQ=255) aCATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTAc > 1:3317975/1‑150 (MQ=255) gATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTACTGCg > 1:673491/1‑150 (MQ=255) | GTGATGATGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTACTGCG > CP009273/4241874‑4242172 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |