| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,280,688 | G→T | 7.1% | S95S (TCG→TCT) | nrfD → | formate‑dependent nitrite reductase, membrane subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,280,688 | 0 | G | T | 7.1% | 1329.6 / 50.8 | 351 | S95S (TCG→TCT) | nrfD | formate‑dependent nitrite reductase, membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (161/165); new base T (3/22); total (164/187) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.51e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 355 total aligned reads displayed.
GGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCAAAAGGTTCTGAGCCTGCTGACGCCCGTTCA > CP009273/4280539‑4280837 | gcggTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGa < 1:2536338/150‑1 (MQ=255) gTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATgg > 1:2828110/1‑150 (MQ=255) gCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATgggg > 2:2539197/1‑150 (MQ=255) aGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGt > 2:275008/1‑150 (MQ=255) aGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTGCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGt > 2:1888415/1‑150 (MQ=255) gACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTg > 1:3799695/1‑150 (MQ=255) aCAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGa > 1:2675958/1‑150 (MQ=255) cAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGAt > 2:3309644/1‑150 (MQ=255) aGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATg < 1:3183230/150‑1 (MQ=255) tACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCt < 2:910072/150‑1 (MQ=255) cGTTGCTGCGCACCACGCTGATGGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGt < 1:2488823/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGtt > 1:1164090/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCTATGGGGGTGATGCTGTTTc < 1:3889049/150‑1 (MQ=255) tgcGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGCTGGGGGTGATGCTGTTTCAGc > 1:446166/1‑150 (MQ=255) gcgcACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCTATGGGGGTGATGCTGTTTCAGct < 2:2966425/150‑1 (MQ=255) accacGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTAc > 1:567709/1‑150 (MQ=255) ccacGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACa > 2:1401665/1‑150 (MQ=255) ccacGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACa > 2:1758407/1‑150 (MQ=255) cacGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACAt < 1:3852095/150‑1 (MQ=255) gCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACAtggt < 2:4709464/150‑1 (MQ=255) gATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATggtggt < 2:4733032/150‑1 (MQ=255) tGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGtggtgct > 2:1981421/1‑150 (MQ=255) gTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGtggtgctg < 1:1528030/150‑1 (MQ=255) gTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGtggtgctg > 1:4212417/1‑150 (MQ=255) gTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGtggtgctg < 1:2384769/150‑1 (MQ=255) tCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGtggtgctgg > 2:367031/1‑150 (MQ=255) tCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGtggtgctgg > 2:4561158/1‑150 (MQ=255) cgggccgggcGCGGTGATCCTCGGCCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGtggtgctggt < 1:1126479/150‑1 (MQ=255) gcctggcGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGTAGCTGATTTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCTATGGGGGTGTTGCTGTTTCAGCTCTACATGGTggtgctggtgct < 1:4686950/150‑1 (MQ=255) cgggcGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCtgt < 1:500889/150‑1 (MQ=255) cgcgGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGtggct < 1:3040185/150‑1 (MQ=255) cgcgGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGtggct < 1:1846634/150‑1 (MQ=255) cgcgGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGtggct < 1:4000413/150‑1 (MQ=255) cgGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGtggctgg < 2:3961380/150‑1 (MQ=255) gTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCg < 2:4184235/150‑1 (MQ=255) tCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCTATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGaaaa < 2:506066/150‑1 (MQ=255) tCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGaaaa > 1:214752/1‑150 (MQ=255) ccTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAAt < 1:2496381/150‑1 (MQ=255) ccTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAAt < 1:4133474/150‑1 (MQ=255) cTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATc < 1:1921835/150‑1 (MQ=255) tCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCt < 2:1506374/150‑1 (MQ=255) tCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCt < 1:3502936/150‑1 (MQ=255) cGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCtt > 1:98543/1‑150 (MQ=255) tCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGa < 1:1612679/150‑1 (MQ=255) cTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGaa > 2:686228/1‑150 (MQ=255) cTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGaa < 2:3614599/150‑1 (MQ=255) ttGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACAt < 1:2229171/150‑1 (MQ=255) tGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATg > 2:2269142/1‑150 (MQ=255) tGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATg > 1:3688083/1‑150 (MQ=255) gATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGa < 2:1228078/150‑1 (MQ=255) aTCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGAt < 1:3477999/150‑1 (MQ=255) tCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGAtt > 2:2336711/1‑150 (MQ=255) tCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGAtt < 1:1026878/150‑1 (MQ=255) ccTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGAttt > 2:1043465/1‑150 (MQ=255) gTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATttgctt > 2:2079098/1‑150 (MQ=255) tCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATttgcttg < 2:3429348/150‑1 (MQ=255) cTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATttgcttgc > 2:1547590/1‑150 (MQ=255) ccACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCt < 2:2905340/150‑1 (MQ=255) ccTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGca > 1:1078181/1‑150 (MQ=255) ccTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGca > 2:3127510/1‑150 (MQ=255) tGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGcaac < 1:3111899/150‑1 (MQ=255) aaGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACCGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTCCAGGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACg > 2:3995126/1‑150 (MQ=255) aaGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACg > 2:3194229/1‑150 (MQ=255) aaGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACg > 1:371904/1‑150 (MQ=255) gACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCt > 2:268314/1‑150 (MQ=255) ccGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTgg > 2:4020939/1‑150 (MQ=255) tGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTg > 2:1130910/1‑150 (MQ=255) ggACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGc > 1:1567190/1‑150 (MQ=255) aCCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCg > 2:4459048/1‑150 (MQ=255) ccTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGa > 1:258759/1‑150 (MQ=255) cTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGaa > 1:4718923/1‑150 (MQ=255) cTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCt < 2:3068811/150‑1 (MQ=255) gAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTggg > 2:3909068/1‑150 (MQ=255) aaGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTgggg > 1:2343991/1‑150 (MQ=255) aGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGa > 1:340856/1‑150 (MQ=255) gCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGAt > 2:2143327/1‑150 (MQ=255) gCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGAt < 2:1169967/150‑1 (MQ=255) cTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATc < 2:2830172/150‑1 (MQ=255) cTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATc > 1:1356149/1‑150 (MQ=255) cTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATc < 1:1716958/150‑1 (MQ=255) aTGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTg < 1:2940154/150‑1 (MQ=255) ttCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCaa < 1:2150836/150‑1 (MQ=255) ttCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCaa > 1:703058/1‑150 (MQ=255) ttCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCaa > 1:2870384/1‑150 (MQ=255) tCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCaaa < 2:447527/150‑1 (MQ=255) aCTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCAAAAgg > 1:1770365/1‑150 (MQ=255) tACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCAAAAGGtt < 2:776586/150‑1 (MQ=255) aCAGTTTTACCTCGGTGATGTCTATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCAAAAGGTTc < 2:2645828/150‑1 (MQ=255) aCAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCAAAAGGTTc < 2:597093/150‑1 (MQ=255) cAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCAAAAGGTTCt > 1:667665/1‑150 (MQ=255) aGTTTTACCTCGGTGATGTCTATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCAAAAGGTTCTg < 1:4092526/150‑1 (MQ=255) gtattACCTCGGTGAGGTCTATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCAAAAGGTTCTGa < 1:1807260/147‑1 (MQ=255) tttACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCAAAAGGTTCTGAGc > 1:2255696/1‑150 (MQ=255) tACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCAAAAGGTTCTGAGCct > 2:4098307/1‑150 (MQ=255) aCCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCAAAAGGTTCTGAGCctg > 1:4278343/1‑150 (MQ=255) aCCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCAAAAGGTTCTGAGCctg < 1:3309624/150‑1 (MQ=255) cTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCAAAAGGTTCTGAGCctgct > 1:4307020/1‑150 (MQ=255) gTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCAAAAGGTTCTGAGCCTGCTGACg > 1:739290/1‑150 (MQ=255) gTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCAAAAGGTTCTGAGCCTGCTGACGCCCGt < 1:885056/150‑1 (MQ=255) gATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCAAAAGGTTCTGAGCCTGCTGACGCCCGTTCa < 1:3240495/150‑1 (MQ=255) | GGCGGTGCAGACAGTACGTTGCTGCGCACCACGCTGATTGTCGGGCCGGGCGCGGTGATCCTCGGTCTGTTGATCCTCGTCTTCCACCTGACAAGACCGTGGACCTTCTGGAAGCTGATGTTCCACTACAGTTTTACCTCGGTGATGTCGATGGGGGTGATGCTGTTTCAGCTCTACATGGTGGTGCTGGTGCTGTGGCTGGCGAAAATCTTTGAACATGATTTGCTTGCCCTGCAACAACGCTGGTTGCCGAAGCTGGGGATCGTGCAAAAGGTTCTGAGCCTGCTGACGCCCGTTCA > CP009273/4280539‑4280837 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |