| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 363,890 | G→T | 7.4% | M349I (ATG→ATT) | mhpA → | 3‑(3‑hydroxyphenyl)propionate hydroxylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 363,890 | 0 | G | T | 7.4% | 1425.3 / 58.8 | 377 | M349I (ATG→ATT) | mhpA | 3‑(3‑hydroxyphenyl)propionate hydroxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (179/170); new base T (17/11); total (196/181) | |||||||||||
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Only 100 of 389 total aligned reads displayed.
TGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCGTTGGTTATCCAGGGGAAAGCCCGCGATGCGCTGCTCGATACCTATCAACAAGAACGTCGCGATCACGCCAAAGCGATGATTGACCTGTCCGTGACGGCGGGCAACGTGCTGGCTCCGCCGAAACGCTGGCAGGGTACGTTACGTGACGGCGTTTCCTGGCTGTTGAATTATCTGCCGCCAGTAAAACGCTACTTCCTCGAAATGCGCTTCAAGCCGATGCCGCAATA > CP009273/363742‑364039 | ggTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCGTTGGTTATCCAGGGGAAAGCCCGCGATGCGCTGCTCGATACCTATCAACAAGAACGTCGCGATCACGCCAAAGCGATGATTGa > 1:2330067/1‑150 (MQ=255) aTGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCGTTGGTTATCCAGGGGAAAGCCCGCGATGCGCTGCTCGATACCTATCAACAAGAACGTCGCGATCACGCCAAAGCGATGATTGACCt > 1:3549860/1‑150 (MQ=255) tGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCGTTGGTTATCCAGGGGAAAGCCCGCGATGCGCTGCTCGATACCTATCAACAAGAACGTCGCGATCACGCCAAAGCGATGATTGACCTg > 2:1287332/1‑150 (MQ=255) 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gatgatTGACCTGTCCGTGACGGCGGGCAACGTGCTGGCTCCGCCGAAACGCTGGCAGGGTACGTTACGTGACGGCGTTTCCTGGCTGTTGAATTATCTGCCGCCAGTAAAACGCTACTTCCTCGAAATGCGCTTCAAGCCGATGCCGCa > 2:353688/1‑150 (MQ=255) atgatTGACCTGTCCGTGACGGCGGGCAACGTGCTGGCTCCGCCGAAACTCTGGCAGGGTACGTTACGTGACGGCGTTTCCTGGCTGTTGAATTATCTGCCGCCAGTAAAACGCTACTTCCTCGAAATGCGCTTCAATCCGATGCCGCaa > 1:2004410/1‑150 (MQ=255) | TGCCGGTATGGCAGGGGCAGGGCTATAACAGTGGTATGCGCGACGCCTTTAACCTCGCATGGAAACTGGCGTTGGTTATCCAGGGGAAAGCCCGCGATGCGCTGCTCGATACCTATCAACAAGAACGTCGCGATCACGCCAAAGCGATGATTGACCTGTCCGTGACGGCGGGCAACGTGCTGGCTCCGCCGAAACGCTGGCAGGGTACGTTACGTGACGGCGTTTCCTGGCTGTTGAATTATCTGCCGCCAGTAAAACGCTACTTCCTCGAAATGCGCTTCAAGCCGATGCCGCAATA > CP009273/363742‑364039 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |