New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 376716 = | NA (NA) | 218 (0.810) | 121/278 | NT | 89.7% | intergenic (‑1/‑91) | yaiX/insC1 | pseudogene, interrupted by IS2A, acetyltransferase homolog; nonfunctional; interruped by IS2; putative transferase/IS2 repressor TnpA |
? | CP009273 | 566411 = | 25 (0.090) | coding (63/552 nt) | ybcL | inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor; DLP12 prophage; secreted protein, UPF0098 family |
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
CGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/376864‑376716 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTCCTGAAGGTACCAAAAGCTTTGCCGTAACTG > CP009273/566411‑566559 CGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAA < 2:4834289/150‑1 CGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAA > 2:2507788/1‑150 CGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAA > 2:1921272/1‑150 CGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAA > 1:494101/1‑150 CGATCTTGTCCTGTGTGGGACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAA < 1:2528805/150‑1 CGATCTGTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAA < 1:2443515/150‑1 GATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAAT < 1:1536487/150‑1 TCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTT < 1:1235497/150‑1 TCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTT < 2:761299/150‑1 TCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTT < 2:2252858/150‑1 TCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTT < 1:3699404/150‑1 TCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCAGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTT < 2:3880006/150‑1 TTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCA < 2:2680614/150‑1 TTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAG > 2:4191848/1‑150 CCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTC < 1:2429828/150‑1 GTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACT > 2:4731740/1‑150 GTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACT < 1:574688/150‑1 TGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTA > 1:4083926/1‑150 TGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTA > 1:1529576/1‑150 TGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTA < 1:4302972/150‑1 TGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTA > 1:4225462/1‑150 TGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGT < 1:689703/150‑1 GGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTA < 1:2940374/150‑1 GGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTA < 2:3492514/150‑1 CGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGA > 2:321577/1‑150 CGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGA < 2:1043031/150‑1 CGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAAT < 1:2331218/150‑1 TGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAA < 2:1737626/150‑1 CGTGTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAAC < 2:3498454/150‑1 TTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAG < 2:1554868/150‑1 TTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAG < 2:1600416/150‑1 GGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCA > 1:2191731/1‑150 GCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAA > 1:3295789/1‑150 GCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAA > 1:383208/1‑150 CTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTT < 2:26114/150‑1 AGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACA < 1:3278563/150‑1 GACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAA < 1:2776511/150‑1 ACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAAC < 1:3585629/150‑1 ACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAAC > 2:1368326/1‑150 CATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACG > 1:2151849/1‑150 CAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCT < 1:4164731/150‑1 CAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCT < 1:4165770/150‑1 CATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATG > 1:1605835/1‑150 TGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTT > 1:1947121/1‑150 GTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTT < 2:1437852/150‑1 GTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTT > 1:4035626/1‑150 GTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTT < 2:3678190/150‑1 GTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTT < 1:2637577/150‑1 GTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCAATTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTT < 1:3248800/150‑1 CTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCT < 2:631146/150‑1 ATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATT < 1:4579279/150‑1 ATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATT < 1:975892/150‑1 TGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTT > 1:3918386/1‑150 TAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGT > 2:3770168/1‑150 TAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGT < 2:4684540/150‑1 AGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTG > 2:2319494/1‑150 TAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATACAGGGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGA > 1:4187210/1‑150 AAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAG > 1:463647/1‑150 AAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAG > 1:3164053/1‑150 AAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGAGTTGGGTGTGAAG > 2:2525402/1‑150 AAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGG > 1:2999736/1‑150 AACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTG < 2:2873318/150‑1 TAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTA > 1:4730164/1‑150 AGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAA < 2:707457/150‑1 AGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAA > 2:3596513/1‑150 AGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAA > 1:3413014/1‑150 GTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTTGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAAT < 1:1500636/150‑1 TATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATA < 1:738878/150‑1 ATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATAC > 1:1656893/1‑150 ATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATAC > 2:3129059/1‑150 AAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATC < 1:1378759/150‑1 AGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCG > 2:4780834/1‑150 ACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATT > 2:548163/1‑150 CTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTA > 2:1646610/1‑150 TTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAA > 2:1340539/1‑150 ATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACC > 1:3159243/1‑150 TAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCAT < 1:1045461/142‑1 TAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCAT < 1:3501128/142‑1 AAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGT > 2:3023964/1‑150 AAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGT > 2:3735838/1‑150 AAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGT < 2:1147592/150‑1 TGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTG < 1:2866739/150‑1 TGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTG < 1:865060/150‑1 GATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGG > 1:2730394/1‑150 GATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGG < 2:2890889/150‑1 GATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGG > 1:4375646/1‑150 ATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGGT > 1:2034592/1‑150 ATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGT < 2:3284428/150‑1 TGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTC < 1:731263/150‑1 TGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTC < 2:651983/150‑1 GTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTCCT < 2:4002494/150‑1 TTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTCCTG < 2:3918386/150‑1 TCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTCCTGAAG > 2:1679908/1‑150 AGATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGTAGGTGGTAATACATCGCCCTCTTTAAGCTGGTCTGGTGTTCCTGAAGGTACC > 2:312463/1‑150 GATTCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTCCTGAAGGTACCA < 2:493432/150‑1 TCA‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTTGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTCCTGAAGGTACCAAAA < 2:2591131/150‑1 A‑GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTCCTGAAGGTACCAAAAGC > 2:3044515/1‑150 GGGGGCCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTCCTGAAGGTACCAAAAGCT > 1:1482432/1‑150 CCAGTCTAATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTCCTGAAGGTACCAAAAGCTTTGCC < 2:4351980/150‑1 AATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTCCTGAAGGTACCAAAAGCTTTGCCGTAACTG < 1:2165425/150‑1 CGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCA‑GGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/376864‑376716 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTTCAGGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTCCTGAAGGTACCAAAAGCTTTGCCGTAACTG > CP009273/566411‑566559 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |