| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2897461 | 376 (1.400) | 3 (0.010) | 3/220 | NT | 1.1% | intergenic (+728/+645) | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis |
| ? | CP009273 | 2897645 = | 264 (1.250) | intergenic (+912/+461) | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 500 total aligned reads displayed.
TTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAA‑GCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGA > CP009273/2897313‑2897609 | ctattaCAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGtt < 1:2878717/149‑1 (MQ=255) taCAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCg > 2:4586984/1‑150 (MQ=255) cAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCa > 1:4692610/1‑150 (MQ=255) aaGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCaa > 1:519029/1‑150 (MQ=255) gTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGCCAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAAt > 1:4262433/1‑150 (MQ=255) gTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGGTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGACTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCACGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAAt > 1:2359544/1‑150 (MQ=255) gCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGAAAATCTATg > 2:3753222/1‑150 (MQ=255) tAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGACCACCTGATTTCGCAAATCTATggg > 2:3592867/1‑149 (MQ=255) aaaaCTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACgaaatgctggtgagcgttaatgccgcaa > 1:718072‑M1/1‑122 (MQ=255) aaaCTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCt > 2:1301021/1‑150 (MQ=255) aCTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTAt > 2:3815999/1‑150 (MQ=255) cTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGCATATCCGCCTCAGTCGACAATTACCGCTCAGCTGTATCCCCGCTGGCGCGGGGACCAACTGTTTTCTCAAGTCTATGTACAATTGCTAtt > 2:4450499/1‑150 (MQ=255) gagaAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCgg < 2:3741550/150‑1 (MQ=255) agaAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATACCCGCTGGCGCGCGGAACACCTGTGTTCGCAAATCGATGGACTATGGCGAGTCGGt > 1:1488723/1‑150 (MQ=255) gaAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGtt < 1:1797631/150‑1 (MQ=255) aaaGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGttt < 1:4327459/150‑1 (MQ=255) aaaGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGttt > 1:2547145/1‑150 (MQ=255) aaGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTa < 1:3495794/150‑1 (MQ=255) gagaTAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATc > 2:1453124/1‑150 (MQ=255) gaTAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACATAAAGGCCTCAGTAGTCTCGACAGGCTCCGTTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGGATATTGCTATTCGGTTTATccc > 1:1702864/1‑150 (MQ=255) aCGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCt < 1:1872585/150‑1 (MQ=255) cgtgTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTg < 2:3933537/147‑1 (MQ=255) ttATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGgcgc > 2:2045506/1‑150 (MQ=255) 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cGCTGGCGCGGGGAACACgaaatgctggtgagcgttaatgccgcaaacacaggtttatccccgctggcgcggggaacacattacgcctttttgcgattgcccggtttttgccggtttatccccgctggcgcggggaacactctaaacata < 1:4362480‑M1/150‑133 (MQ=255) cGCTGGCGCGGGGAACACgaaatgctggtgagcgttaatgccgcaaacacaggtttatccccgctggcgcggggaacacattacgcctttttgcgattgcccggtttttgccggtttatccccgctggcgcggggaacactctaaacata < 2:3497221‑M1/150‑133 (MQ=255) gCTGGCGCGGGGAACACgaaatgctggtgagcgttaatgccgcaaacacaggtttatccccgctggcgcggggaacacattacgcctttttgcgattgcccggtttttgccggtttatccccgctggcgcggggaacactctaaacataa > 1:371636‑M1/1‑17 (MQ=255) cTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAA‑GCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAAc > 2:3462698/1‑150 (MQ=255) ggCGCGGGGAACACCTGTTTTCTCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAGCACTGAGTACAAACGCCG‑GGATCTGCAAGGGTTATCCCCGCGGGCGCGGGGAACACTGGATCTGCGActg > 2:2525589/1‑148 (MQ=255) 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acacgaaatgctggtgagcgttaatgccgcaaacacaggtttatccccgctggcgcggggaacacattacgcctttttgcgattgcccggtttttgccggtttatccccgctggcgcggggaacactctaaacataacctattattaatt < 1:1000732‑M1/150‑147 (MQ=255) acCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAA‑GCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGa < 2:4336911/150‑1 (MQ=255) | TTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAA‑GCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGA > CP009273/2897313‑2897609 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |