| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 48,260 | G→T | 18.7% | A164A (GCG→GCT) | kefC → | potassium:proton antiporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 48,260 | 0 | G | T | 18.7% | 1102.7 / 188.6 | 376 | A164A (GCG→GCT) | kefC | potassium:proton antiporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (164/141); new base T (34/37); total (198/178) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.29e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 397 total aligned reads displayed.
CGGAATTGATCGGCATGACGCTGGCGCTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTCCGGCGCTGCGTTTTGTAGCCCGCTCTG > CP009273/48112‑48408 | cgGAATTGATCGGCATGACGCTGGCGCTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCga < 1:1656313/150‑1 (MQ=255) ggAATTGATCGGCATGACGCTGGCGCTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCgat < 1:119135/150‑1 (MQ=255) ggAATTGATCGGCATGACGCTGGCGCTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCgat < 2:3457264/150‑1 (MQ=255) gAATTGATCGGCATGACGCTGGCGCTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCtatg > 1:4705582/1‑150 (MQ=255) taTTGATCGGCATGACGCTGGCGCTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCtatga > 1:2337461/2‑150 (MQ=255) aaTTGATCGGCATGACGCTGGCGCTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCgatga < 2:3515887/150‑1 (MQ=255) aTTGATCGGCATGACGCTGGCGCTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCtatgat > 2:1928002/1‑150 (MQ=255) tGATCGGCATGACGCTGGCGCTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTc > 1:669646/1‑150 (MQ=255) gATCGGCATGACGCTGGCGCTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCTATGATTcc > 1:303871/1‑150 (MQ=255) gATCGGCATGACGCTGGCGCTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTcc < 2:1825279/150‑1 (MQ=255) gATCGGCATGACGCTGGCGCTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTcc < 1:3240748/150‑1 (MQ=255) aTCGGCATGACGCTGGCGCTCTCCTCTCCGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCg < 2:3393466/150‑1 (MQ=255) tCGGCATGACGCTGGCGCTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGc < 1:1020311/150‑1 (MQ=255) tGACGCTGGCGCTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTgg > 1:2343411/1‑150 (MQ=255) aCGCTGGCGCTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCa > 1:1927816/1‑150 (MQ=255) aCGCTGGCGCTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCa > 2:3606122/1‑150 (MQ=255) cGCTGGCGCTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCaa > 2:2885793/1‑150 (MQ=255) gcTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCTATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAg < 1:2616746/150‑1 (MQ=255) gcTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAg < 2:4085230/150‑1 (MQ=255) ctctCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGt < 2:846050/150‑1 (MQ=255) tctcCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTg > 1:2190738/1‑150 (MQ=255) cctcTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt > 1:3924896/1‑150 (MQ=255) cctcTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCt < 1:2481286/150‑1 (MQ=255) ctctACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTc < 1:2903027/150‑1 (MQ=255) ctctACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTc < 2:4715494/150‑1 (MQ=255) aTTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATg < 2:1552329/150‑1 (MQ=255) aTTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATg > 2:3888897/1‑150 (MQ=255) ttGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATgg < 1:3138358/150‑1 (MQ=255) ttGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATgg > 2:3675450/1‑150 (MQ=255) cATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGgcgc > 1:3053847/1‑150 (MQ=255) gCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCAtt < 2:2328499/150‑1 (MQ=255) cAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCAttt < 2:442541/150‑1 (MQ=255) ggCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGc > 1:4047953/1‑150 (MQ=255) cGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCTATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGctc > 1:977014/1‑150 (MQ=255) gATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGctct > 2:2413390/1‑150 (MQ=255) gaatgaaCGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCtctctc > 2:2962378/1‑150 (MQ=255) gaatgaaCGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCtctctc > 1:484397/1‑150 (MQ=255) atgaaCGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCgg < 1:2840599/150‑1 (MQ=255) gaaCGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCg > 2:4351032/1‑150 (MQ=255) aCGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGtt > 2:468003/1‑150 (MQ=255) cGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTa > 2:1180438/1‑150 (MQ=255) gCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTaa > 2:1724025/1‑150 (MQ=255) cAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCTATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTaaa < 1:2552576/150‑1 (MQ=255) aTCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAg > 1:376709/1‑150 (MQ=255) tCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGt < 1:4505036/150‑1 (MQ=255) tGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTgg > 1:3602058/1‑150 (MQ=255) tGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTgg < 2:2817797/150‑1 (MQ=255) ggTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCggg > 1:2405641/1‑150 (MQ=255) gTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCTATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGt > 1:87863/1‑150 (MQ=255) gTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGt < 2:224407/150‑1 (MQ=255) gTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGt < 1:1340221/150‑1 (MQ=255) gACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTgc < 2:3710817/150‑1 (MQ=255) aCGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCTATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTgcg > 1:3452102/1‑150 (MQ=255) cAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCgctg > 1:1464124/1‑150 (MQ=255) aaTGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCTATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCgctggt < 2:2633659/150‑1 (MQ=255) aaTGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCgctggt < 2:548493/150‑1 (MQ=255) aTGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCgctggtg < 2:2019286/150‑1 (MQ=255) tGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCTATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCgctggtgc > 2:2671449/1‑150 (MQ=255) gggTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCTATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCgctggtgct > 1:2297347/1‑150 (MQ=255) ggTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCgctggtgctg > 2:4773608/1‑150 (MQ=255) cAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTggtggt > 1:1072186/1‑150 (MQ=255) gTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCTAGGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTAt < 1:4118611/150‑1 (MQ=255) gCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCTATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTg > 1:4570724/1‑150 (MQ=255) ccTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGc > 2:3116049/1‑150 (MQ=255) cTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCt < 1:3343547/150‑1 (MQ=255) tttGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCTATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTg < 1:4637149/150‑1 (MQ=255) tGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTggg > 2:4492234/1‑150 (MQ=255) tGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTggg < 2:1518862/150‑1 (MQ=255) tGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTggg < 2:3977056/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGgcg > 1:1908323/1‑150 (MQ=255) gTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGATGCGGGTGAGCAGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGgcgc > 1:4329619/1‑150 (MQ=255) gctgctGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTa < 2:2183069/150‑1 (MQ=255) ctgctgTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTAt < 2:2978724/150‑1 (MQ=255) gctgTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGt < 1:3999388/150‑1 (MQ=255) gctgTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGAATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGt < 1:2084062/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCTATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCAcg < 2:303871/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCAcg > 1:4430566/1‑150 (MQ=255) tCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTACAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCAcgc > 2:4239924/1‑150 (MQ=255) cAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGt > 1:492924/1‑150 (MQ=255) aGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTc > 2:3558549/1‑150 (MQ=255) aGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTc > 1:2119935/1‑150 (MQ=255) ggATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTcc < 1:1246737/150‑1 (MQ=255) ggATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTcc < 2:1670461/150‑1 (MQ=255) gATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTCCg > 2:3053952/1‑150 (MQ=255) tatCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCTATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTCCGgc < 2:4173390/150‑1 (MQ=255) tatCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTCCGgc > 2:388082/1‑150 (MQ=255) atCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTCCGgcg > 1:660778/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTCCGgcgc > 2:3201585/1‑150 (MQ=255) cggcgATCCCGCTGGTGGCTATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTCCGGCGCTGc > 2:1411206/1‑150 (MQ=255) ggcgATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTCCGGCGCTGCg > 1:1558737/1‑150 (MQ=255) cgATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTCCGGCGCTGCGtt > 2:1194557/1‑150 (MQ=255) aTCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTCCGGCGCTGCGtttt < 2:2119575/150‑1 (MQ=255) cccGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTCCGGCGCTGCGTTTTGt > 1:1893266/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTCCGGCGCTGCGTTTTGTa > 2:576369/1‑150 (MQ=255) gCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTCCGGCGCTGCGTTTTGTAGc < 2:668669/150‑1 (MQ=255) tggtggCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTCCGGCGCTGCGTTTTGTAGccc < 2:1395319/150‑1 (MQ=255) tggCTATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTCCGGCGCTGCGTTTTGTAGCCCGct < 2:1055690/150‑1 (MQ=255) gCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTCCGGCGCTGCGTTTTGTAGCCCGctct < 1:1737046/150‑1 (MQ=255) cGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTCCGGCGCTGCGTTTTGTAGCCCGCTCTg > 2:1922773/1‑150 (MQ=255) cGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTCCGGCGCTGCGTGTTGTAGCCCGCTCTg > 2:2588385/1‑150 (MQ=255) | CGGAATTGATCGGCATGACGCTGGCGCTCTCCTCTACGGCGATTGCCATGCAGGCGATGAATGAACGCAATCTGATGGTGACGCAAATGGGTCGCAGTGCCTTTGCGGTGCTGCTGTTCCAGGATATCGCGGCGATCCCGCTGGTGGCGATGATTCCGCTACTGGCAACGAGCAGTGCCTCGACGACGATGGGCGCATTTGCTCTCTCGGCGTTAAAAGTGGCGGGTGCGCTGGTGCTGGTGGTATTGCTGGGGCGCTATGTCACGCGTCCGGCGCTGCGTTTTGTAGCCCGCTCTG > CP009273/48112‑48408 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |