| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 579,565 | A→G | 23.6% | G143G (GGA→GGG) | appY → | global transcriptional activator; DLP12 prophage |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 579,565 | 0 | A | G | 23.6% | 249.8 / 78.7 | 123 | G143G (GGA→GGG) | appY | global transcriptional activator; DLP12 prophage |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/61); new base G (6/23); total (39/84) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
TGTTTGAAGGGATTAAAATAGCAGACTCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTGAGAGATACTAGGATGAGGTATGCAAA > CP009273/579417‑579714 | tGTTTGAAGGGATTAAAATAGCAGACTCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGaa > 2:2177681/1‑150 (MQ=255) gTTTGAAGGGATTAAAATAGCAGACTCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGaat < 1:1317736/150‑1 (MQ=255) tGAAGGGATTAAAATAGCAGACTCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGaataat < 1:4690405/150‑1 (MQ=255) aGGGATTAAAATAGCAGACTCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAg > 1:362968/1‑150 (MQ=255) gggATTAAAATAGCAGACTCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGt > 2:4206823/1‑150 (MQ=255) ggATTAAAATAGCAGACTCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGtt < 1:4233521/150‑1 (MQ=255) ggATTAAAATAGCAGACTCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGtt < 1:1776372/150‑1 (MQ=255) aaaaTAGCAGACTCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGGATAATCAGTTTTAat < 2:7491/150‑1 (MQ=255) aaaaTAGCAGACTCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAat < 2:34345/150‑1 (MQ=255) aaaTAGCAGACTCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAata < 2:2835101/150‑1 (MQ=255) aaTAGCAGACTCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAatat < 1:934703/150‑1 (MQ=255) aaTAGCAGACTCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAatat < 1:3378246/150‑1 (MQ=255) cAGACTCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGc > 1:1211007/1‑150 (MQ=255) cAGACTCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTCTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATAAATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTTAGc > 1:3702191/1‑150 (MQ=255) aCTCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGc > 2:534269/1‑150 (MQ=255) aCTCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGc > 2:180355/1‑150 (MQ=255) aCTCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGc > 2:180185/1‑150 (MQ=255) tCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCaa < 2:324376/150‑1 (MQ=255) acacTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATg < 2:1873800/150‑1 (MQ=255) cTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCa > 2:527473/1‑150 (MQ=255) cccTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCAtt < 2:1063261/150‑1 (MQ=255) ccTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCAttt < 1:4798579/150‑1 (MQ=255) cTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTa > 1:1042454/1‑150 (MQ=255) tttGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTaa > 1:3900710/1‑150 (MQ=255) tttGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTaa > 1:3900813/1‑150 (MQ=255) ttGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTaaa > 1:2473529/1‑150 (MQ=255) ttGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTaaa > 1:2473506/1‑150 (MQ=255) ttGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTaaa > 1:2473443/1‑150 (MQ=255) ttGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTaaa < 1:244317/150‑1 (MQ=255) ggTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAg > 2:4730319/1‑150 (MQ=255) ggTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAg < 1:4582272/150‑1 (MQ=255) ttAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGat < 1:4318505/150‑1 (MQ=255) aagaaagaCTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTg < 1:2006744/150‑1 (MQ=255) agaaagaCTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGc < 1:3849579/150‑1 (MQ=255) agaaagaCTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGc < 1:1390530/150‑1 (MQ=255) agaaagaCTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGc < 1:3579538/150‑1 (MQ=255) aaagaCTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCgg < 1:1064003/150‑1 (MQ=255) aaagaCTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCgg > 2:2696643/1‑150 (MQ=255) aaagaCTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCgg > 2:2697738/1‑150 (MQ=255) aaagaCTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCgg > 2:1212662/1‑150 (MQ=255) gaCTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAAt < 2:4451358/150‑1 (MQ=255) aCTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAAtt > 2:643012/1‑150 (MQ=255) cTATGTATATCCTTACTTGCCATTTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTg < 2:620298/150‑1 (MQ=255) atatCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTtat < 2:2196689/150‑1 (MQ=255) atatCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTtat < 2:2987250/150‑1 (MQ=255) atatCCTTACTTGCCATGTACAAAAAACGAGAAAGTGTAAATTAATTTATAATAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTtat < 2:4239104/150‑1 (MQ=255) atatCCTTACTTGCAATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTtat < 2:2987255/150‑1 (MQ=255) tCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACg > 2:2408393/1‑150 (MQ=255) tCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACg > 2:2407884/1‑150 (MQ=255) ttACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGt < 2:406030/150‑1 (MQ=255) ttACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGt < 2:782051/150‑1 (MQ=255) ttGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGaaa < 2:3021333/150‑1 (MQ=255) tGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAg < 1:1418839/150‑1 (MQ=255) tGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAg > 1:2489178/1‑150 (MQ=255) tGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTCATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAg < 1:293965/150‑1 (MQ=255) ccATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGtt > 2:1877636/1‑150 (MQ=255) cATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGttt < 2:14674/150‑1 (MQ=255) aTGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTta < 2:2770316/150‑1 (MQ=255) aTGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTta < 2:31729/150‑1 (MQ=255) ttCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTtaata < 2:3777081/150‑1 (MQ=255) tCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTtaataa < 2:1330166/150‑1 (MQ=255) cAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATaaa < 1:1874237/150‑1 (MQ=255) cAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATaaa < 1:4326864/150‑1 (MQ=255) aaaaaaCGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATaaaa < 1:1072316/150‑1 (MQ=255) aaaaCGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATaaaaaa > 1:1056424/1‑150 (MQ=255) cgcgAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGa > 2:1939733/1‑150 (MQ=255) cgcgAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGa < 2:1366203/150‑1 (MQ=255) aGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAgg < 2:4278868/150‑1 (MQ=255) tAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAAT‑AAAAAAAGATTAAGGGATGa > 1:1448349/1‑150 (MQ=255) aaaTTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGa < 1:582528/150‑1 (MQ=255) aaaTTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGa < 1:582338/150‑1 (MQ=255) tCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGa > 1:4137184/1‑150 (MQ=255) ttATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGt < 2:1230305/150‑1 (MQ=255) tataCTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTc < 2:504181/150‑1 (MQ=255) ataCTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCa < 2:4568018/150‑1 (MQ=255) ataCTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCa < 2:2115366/150‑1 (MQ=255) tAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTa < 1:4307432/150‑1 (MQ=255) atatAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGaaa < 1:4559380/150‑1 (MQ=255) taAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAatat < 2:3288864/150‑1 (MQ=255) taAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAatat < 2:3290803/150‑1 (MQ=255) aaaTACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATAtt < 2:3900813/150‑1 (MQ=255) aaaTACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATAtt < 2:3900710/150‑1 (MQ=255) aCATTTACCTGTAAAATTACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTgaga < 2:2354158/150‑1 (MQ=255) aTTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTgagaga < 1:1337898/150‑1 (MQ=255) ccTGTAAAATTACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTGAGAGATACTa < 1:2043000/150‑1 (MQ=255) aaaaTTACTGGAATAATCATTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTGAGAGATACTAGGATg < 1:4228760/150‑1 (MQ=255) aaTTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTGAGAGATACTAGGATGAg < 2:3811156/150‑1 (MQ=255) ttACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTGAGAGATACTAGGATGAGGt > 2:2352903/1‑150 (MQ=255) tACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTGAGAGATACTAGGATGAGGTa < 1:4279891/150‑1 (MQ=255) tACTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTGAGAGATACTAGGATGAGGTa < 1:1829048/150‑1 (MQ=255) aCTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTGAGAGATACTAGGATGAGGTAt > 2:373920/1‑150 (MQ=255) cttgAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCTGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTGAGAGATACTAGGATGAGGTATg < 2:246455/147‑1 (MQ=255) cttgAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTGAGAGATACTAGGATGAGGTATg < 2:3881760/147‑1 (MQ=255) cTGGGATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTGAGAGATACTAGGATGAGGTATg > 2:1972343/1‑150 (MQ=255) cTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTGAGAGATACTAGGATGAGGTATg > 1:3696849/1‑150 (MQ=255) tGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTGAGAGATACTAGGATGAGGTATGc > 1:1806500/1‑150 (MQ=255) gAATAATCATTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTGAGAGATACTAGGATGAGGTATGCaa < 1:1212662/150‑1 (MQ=255) gAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTGAGAGATACTAGGATGAGGTATGCaa < 1:2696643/150‑1 (MQ=255) gAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTGAGAGATACTAGGATGAGGTATGCaa < 1:2697738/150‑1 (MQ=255) aataatCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTGAGAGATACTAGGATGAGGTATGCaaa > 2:1403761/1‑150 (MQ=255) | TGTTTGAAGGGATTAAAATAGCAGACTCACACTCCCTTTGGTTAAAAGAAAGACTATGTATATCCTTACTTGCCATGTTCAAAAAACGCGAAAGTGTAAATTCATTTATACTAACAAATATAAATACATTTACCTGTAAAATTACTGGAATAATCAGTTTTAATATTGAGCGGCAATGGCATTTAAAAGATATTGCGGAATTGATTTATACGAGTGAAAGTTTAATAAAAAAAAGATTAAGGGATGAAGGAACGTCATTTACTGAAATATTGAGAGATACTAGGATGAGGTATGCAAA > CP009273/579417‑579714 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |