| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 955,662 | 0 | G | A | 30.9% | 167.3 / 101.1 | 121 | intergenic (+111/‑58) | aroA/ycaL | 5‑enolpyruvylshikimate‑3‑phosphate synthetase/putative peptidase‑related chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (19/60); new base A (8/29); total (32/89) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.19e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TATTTCGAGCAGCTGGCGCGGATTAGCCAGGCAGCCTGAATGAACAACGGGCAATAAATAGCCAAATCTTTCTTTATCAAAACGTCGGCACATTGTCGGCGTTTTTTTTCGGACCTTGTGAGTCATTTTGATTAATGGTAGCGTCGCTTGTCAATGTAAGTTGTTGATACATAATATTTATATATGATTAATCAACGGATGATTCACATGAAGAATACTAAATTACTGCTGGCGATTGCGACCTCTGCAGCATTACTGACAGGGTGTCAAAATACCCACGGTATTGATACCAATAT > CP009273/955513‑955808 | tttCGAGCAGCTGGCGCGGATTAGCCAGGCAGCCTGAATGAACAACGGGCAATAAATAGCCAAATCTTTCTTTATCAAAACGTCGGCACATTGTCGGCGTTTTTTTTAGGAACATGTGTGTGATTTTGATTTATTGTATCGTGGCgtgtg > 1:4687726/1‑149 (MQ=255) ttCGAGCAGCTGGCGCGGATTAGCCAGGCAGCCTGAATGAACAACGGGCAATAAATAGCCAAATCTTTCTTTATCAAAACGTCGGCACATTGTCGGCGTTTTTTTTCGGACCTTGTGAGTCATTTTGATTAATGGTAGCGTCGCTTGTCa < 2:4218199/150‑1 (MQ=255) tCGAGCAGCTGGCGCGGATTAGCCAGGCAGCCTGAATGAACAACGGGCAATAAATAGCCAAATCTTTCTTTATCAAAACGTCGGCACATTGTCGGCGTTTTTTTTCGGAACTTGTGAGTCATTTTTTTTAATGGTAGCGTCGCGTATCaa > 1:3220743/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |