Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 983,370 | T→A | 26.0% | N358Y (AAC→TAC) | asnS ← | asparaginyl tRNA synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 983,370 | 0 | T | A | 26.0% | 567.7 / 228.6 | 276 | N358Y (AAC→TAC) | asnS | asparaginyl tRNA synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (98/106); new base A (40/32); total (138/138) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.37e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
CATACGCTCGTCCAGCACGTCCAGACGTTCTTCACGCTGGGAGCCACCAATGATCTCACCGATGCCCGGAGCCAGAACGTCCATAGCCGCAACGGTTTTACCGTCTTCGTTAAGGCGCATATAGAACGCTTTAATATCTTTCGGATAGTTTTTAACCACTACCGGTGCTTTAAAGTGTTCTTCCGCCAGATAACGCTCATGCTCAGAAGAGAGATCGACTCCCCAGTAAACCGGGTTTTCAAACTTCCTGCCGCAGTTTTCGAGAATGGTCACTGCGTCGGTATAATCCACCTGCG > CP009273/983221‑983516 | cATACGCTCGTCCAGCACGTCCAGACGTTCTTCACGCTGGGAGCCACCAATGATCTCACCGATGCCCGGAGCCAGAACGTCCATAGCCGCAACGGTTTTACCGTCTTCGTTAAGGCGCATATAGAACGCTTTAATATCTTTCGGATAGtt < 2:747334/150‑1 (MQ=255) cATACGCTCGTCCAGCACGTCCAGACGTTCTTCACGCTGGGAGCCACCAAGGATCTCACCGATGCCCGGAGCCAGAACGTCCATAGCCGCAACGGTTTTACCGTCTTCGTTAAGGCGCATATAGAACGCTTTAATATCTTTCGGATAGtt < 2:4492085/150‑1 (MQ=255) aTACGCTCGTCCAGCACGTCCAGACGTTCTTCACGCTGGGAGCCACCAATGATCTCACCGATGCCCGGAGCCAGAACGTCCATAGCCGCAACGGTTTTACCGTCTTCGTTAAGGCGCATATAGAACGCTTTAATATCTTTCGGATAGttt > 1:181074/1‑150 (MQ=255) 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tatCTTTCGGATAGTATTTAACCACTACCGGTGCTTTAAAGTGTTCTTCCGCCAGATAACGCTCATGCTCAGAAGAGAGATCGACTCCCCAGTAAACCGGGTTTTCAAACTTCCTGCCGCAGTTTTCGAGACTGGTCACTGCGTCGGtat > 2:3473512/1‑150 (MQ=255) atCTTTCGGATAGTTTTTAACCACTACCGGTGCTTTAAAGTGTTCTTCCGCCAGATAACGCTCATGCTCAGAAGAGAGATCGACTCCCCAGTAAACCGGGTTTTCAAACTTCCTGCCGCAGTTTTCGAGAATGGTCACTGCGTCGGtata > 2:617477/1‑150 (MQ=255) atCTTTCGGATAGTTTCTAACCACTACCGGTGCTTTAAAGTGTTCTTCCGCCAGATAACGCTCATGCTCAGAAGAGAGATCGACTCCCCAGTAAACCGGGTTTTCAAACTTCCTGCCGCAGTTTTCGAGAATGGTCACTGCGTCGGtata > 2:232560/1‑150 (MQ=255) tCTTTCGGATATTTTTTAACCACTACCGGTGCTTTAAAGTGTTCTTCCGCCAGATAACGCTCATGCTCAGAAGAGAGATCGACTCCCCAGTAAACCGGGTTTTCAAACTTCCTGCCGCAGTTTTCGAGAATGGTCACTGCGTCGGTATaa < 1:935743/150‑1 (MQ=255) cTTTCGGATAGTTTTTAACCACTACCGGTGCTTTAAAGTGTTCTTCCGCCAGATAACGCTCATGCTCAGAAGAGATATCGACTCCCCAGTAAACCGGGTTTTCAAACTTCCTGCCGCAGTTTTCGAGAATGGTCACTGCGTCGGTATAAt < 2:151410/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |