| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,152,062 | C→A | 19.0% | S282Y (TCT→TAT) | holB → | DNA polymerase III, delta prime subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,152,062 | 0 | C | A | 19.0% | 834.6 / 145.3 | 288 | S282Y (TCT→TAT) | holB | DNA polymerase III, delta prime subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (105/128); new base A (31/24); total (136/152) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.37e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 291 total aligned reads displayed.
CTAGCGGCCCTTAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAACCGGGCGTTGTGCTACCGG > CP009273/1151914‑1152208 | aGCGGCCCTTAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTcc > 1:4551901/1‑150 (MQ=255) aGCGGCCCTTAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTcc > 1:2725007/1‑150 (MQ=255) ggCCCTTAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTc < 1:4128651/150‑1 (MQ=255) ggCCCTTAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTc < 2:467442/150‑1 (MQ=255) ggCCCTTAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTc < 2:1369520/150‑1 (MQ=255) ggCCCTTAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTc < 2:1999830/150‑1 (MQ=255) gCCCTTAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTATCCCTcg > 2:1658818/1‑150 (MQ=255) tAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCt < 2:3873213/150‑1 (MQ=255) aaTCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTg > 2:2920275/1‑150 (MQ=255) aaTCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTg > 1:2148504/1‑150 (MQ=255) tCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGGTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTATCCCTCGCGCCTGCa < 2:4333259/150‑1 (MQ=255) aTGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAgg > 1:406214/1‑150 (MQ=255) gAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCt < 1:3623138/150‑1 (MQ=255) aaCAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCta < 2:2779289/150‑1 (MQ=255) cAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCtata > 2:3973000/1‑150 (MQ=255) aGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACt < 2:9199/150‑1 (MQ=255) cTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTATCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTgg > 2:2984554/1‑150 (MQ=255) cTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTATCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTgg < 2:3038316/150‑1 (MQ=255) tCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTggg > 1:4507683/1‑150 (MQ=255) cGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTggggg < 2:3207023/150‑1 (MQ=255) cgTTGACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCGATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTATCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGtt < 1:1005505/150‑1 (MQ=255) ttACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTATATCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGc > 1:1805540/1‑150 (MQ=255) tACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTATCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGcc < 1:2829950/150‑1 (MQ=255) tACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTATCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGcc < 2:3797215/150‑1 (MQ=255) acTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTATCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCcaca > 1:584118/1‑150 (MQ=255) tggctggcAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACAtt < 1:3740629/150‑1 (MQ=255) gctggcAACGTTTCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACAtacc < 1:995871/150‑4 (MQ=255) ctggcAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGt < 1:2788895/150‑1 (MQ=255) ggcAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGa > 2:1044502/1‑150 (MQ=255) ggcAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGa > 2:201784/1‑150 (MQ=255) ggcAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTATCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGa > 2:4751177/1‑150 (MQ=255) cAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAAc < 1:3807556/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGtt < 2:1529884/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGtt < 1:1605622/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTATCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGtt > 2:2111510/1‑150 (MQ=255) ttGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTa < 2:1256538/150‑1 (MQ=255) tGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTaa > 1:4221208/1‑150 (MQ=255) tGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTaa < 1:824490/150‑1 (MQ=255) gCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAAt > 1:3380165/1‑150 (MQ=255) tGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGt > 1:1898318/1‑150 (MQ=255) gatggatgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATATTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTc < 1:2270062/150‑1 (MQ=255) gatggatgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTc > 1:326856/1‑150 (MQ=255) atggatgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTATCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCt > 2:2384235/1‑150 (MQ=255) gatgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGtt < 2:2626128/150‑1 (MQ=255) atgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTa < 2:1133519/150‑1 (MQ=255) atgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTa < 1:1775139/150‑1 (MQ=255) gcTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAgg < 1:4809698/150‑1 (MQ=255) gcTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAgg < 2:2698772/150‑1 (MQ=255) cTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGc > 1:2978501/1‑150 (MQ=255) aaaaCGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTATCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCAt < 2:2867217/150‑1 (MQ=255) aaaaCGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTATCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCAt > 2:4433559/1‑150 (MQ=255) aaaCGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATc > 2:2973690/1‑150 (MQ=255) cGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAAc > 1:3185765/1‑150 (MQ=255) ccATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTATCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACcg > 1:4744075/1‑150 (MQ=255) catcatGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACcgc > 2:584996/1‑150 (MQ=255) atcatGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTATCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACcgcg > 1:1997070/1‑150 (MQ=255) atGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGc > 2:255953/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTtct > 1:2500793/1‑150 (MQ=255) gctgcGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTtctc < 2:1196896/150‑1 (MQ=255) tgcGCAGGTGACCACTGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCtcat < 1:1052560/150‑1 (MQ=255) cgcAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCtcatca > 2:3195468/1‑150 (MQ=255) aGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCg > 1:2365393/1‑150 (MQ=255) aGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCg > 1:2931265/1‑150 (MQ=255) gTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGAt < 2:4548645/150‑1 (MQ=255) gACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCt < 1:4780665/150‑1 (MQ=255) aCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCtt < 1:170971/150‑1 (MQ=255) ccAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCttt > 2:2305684/1‑150 (MQ=255) aTGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTAc > 2:3292830/1‑150 (MQ=255) aTGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTAc > 2:3235265/1‑150 (MQ=255) tGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACt > 1:1384350/1‑150 (MQ=255) tGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACt < 2:2955107/150‑1 (MQ=255) tGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGATATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACt < 1:2069871/150‑1 (MQ=255) aTGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTa > 2:2229172/1‑150 (MQ=255) aTGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTa > 2:144014/1‑150 (MQ=255) tgCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTg < 1:1187715/150‑1 (MQ=255) gggCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCa > 1:467327/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCAt < 2:191700/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGAATTGAGCAt > 2:3446477/1‑150 (MQ=255) ccTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTa > 2:3582512/1‑150 (MQ=255) tGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTATCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTAcc > 1:2870599/1‑150 (MQ=255) tCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGc > 1:4276041/1‑150 (MQ=255) ccGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAAc < 1:2074719/150‑1 (MQ=255) ccGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAAc > 2:4231078/1‑150 (MQ=255) ccGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAAc > 2:394263/1‑150 (MQ=255) ccGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTGTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAAc > 2:2824452/1‑150 (MQ=255) cGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAAcc > 1:2586641/1‑150 (MQ=255) cTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAACCGGGc > 2:2689461/1‑150 (MQ=255) cTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAACCGGGc > 2:3902943/1‑150 (MQ=255) cTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAACCGGGc < 1:1153788/150‑1 (MQ=255) tGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAACCGGGCg < 2:4594778/150‑1 (MQ=255) tGGCAAACCATCTTTATCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAACCGGGCg > 1:2336592/1‑150 (MQ=255) gCAAACCATCTTTATCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAACCGGGCGtt < 1:446100/150‑1 (MQ=255) cAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAACCGGGCGTtg < 1:1297062/150‑1 (MQ=255) aaCCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAACCGGGCGTtgtg < 2:1726805/150‑1 (MQ=255) aaCCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAACCGGGCGTtgtg < 2:502002/150‑1 (MQ=255) aaCCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAACCGGGCGTtgtg < 2:2934629/150‑1 (MQ=255) aaCCATCTTTATCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAACCGGGCGTtgtg > 2:4148034/1‑150 (MQ=255) cATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAACCGGGCGTTGTGCTa > 1:716278/1‑150 (MQ=255) cTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAACCGGGCGTTGTGCTACCg > 2:1856356/1‑150 (MQ=255) tttCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAACCGGGCGTTGTGCTACCgg > 2:3354222/1‑150 (MQ=255) | CTAGCGGCCCTTAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCACATTCGTGAACAGTTAATGTCTGTTACAGGCATCAACCGCGAGCTTCTCATCACCGATCTTTTACTGCGTATTGAGCATTACCTGCAACCGGGCGTTGTGCTACCGG > CP009273/1151914‑1152208 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |