Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,197,734 | 0 | C | T | 14.4% | 533.4 / 67.9 | 188 | R219K (AGA→AAA) | cohE | e14 prophage; repressor protein phage e14 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (67/94); new base T (11/16); total (78/110) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |