Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,210,957 | 0 | C | A | 25.5% | 341.0 / 107.1 | 149 | intergenic (‑26/‑288) | bluF/ycgZ | anti‑repressor for YcgE, blue light‑responsive; FAD‑binding; has c‑di‑GMP phosphodiesterase‑like EAL domain, but does not degrade c‑di‑GMP/RcsB connector protein for regulation of biofilm and acid‑resistance |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/70); new base A (17/21); total (58/91) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.43e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |