| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,232,548 | C→A | 20.1% | V50V (GTG→GTT) | ycgB ← | SpoVR family stationary phase protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,232,548 | 0 | C | A | 20.1% | 760.7 / 157.2 | 290 | V50V (GTG→GTT) | ycgB | SpoVR family stationary phase protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (102/129); new base A (31/28); total (133/157) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.06e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.31e-01 | |||||||||||
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
GAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCA > CP009273/1232399‑1232696 | gagTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATc > 2:4053039/1‑150 (MQ=255)gagTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAAATTTTTAACGAATGACCAGTGCGGATATTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATc > 2:3361477/1‑150 (MQ=255) gTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCAc < 1:2092637/150‑1 (MQ=255) ttAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACt > 1:1859428/1‑150 (MQ=255) gACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAAt > 1:1051415/1‑150 (MQ=255) aCGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATc < 2:1967752/150‑1 (MQ=255) gATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATAACTTCAATCTg > 1:762384/1‑150 (MQ=255) aTTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTgg > 2:3752921/1‑150 (MQ=255) ttCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTg < 2:3073815/150‑1 (MQ=255) ttCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTg < 2:3679187/150‑1 (MQ=255) ttCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTg < 2:643772/150‑1 (MQ=255) tCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGc > 1:2283474/1‑150 (MQ=255) aGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATAACTTCAATCTGGTGCGggt > 1:561794/1‑150 (MQ=255) ggCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGggta < 1:648902/150‑1 (MQ=255) gCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATATTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGggtag > 1:4287441/1‑150 (MQ=255) gCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGggtag > 1:702113/1‑150 (MQ=255) ccAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGggtagg < 1:1101857/150‑1 (MQ=255) ccAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGggtagg < 2:2895971/150‑1 (MQ=255) gTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTAt > 1:3451711/1‑150 (MQ=255) gTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATAACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTAt < 1:1185733/150‑1 (MQ=255) cTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCa > 2:2130356/1‑150 (MQ=255) cTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATAACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCa > 1:4695660/1‑150 (MQ=255) ttGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATAACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAg < 2:1010895/150‑1 (MQ=255) gACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGt > 1:3871240/1‑150 (MQ=255) gACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTGATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGt > 1:3553770/1‑150 (MQ=255) cGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAAATTTTTACCGAATGAACAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATAACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTaga > 1:2139852/1‑150 (MQ=255) tGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGt > 2:2476221/1‑150 (MQ=255) tGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATAACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGt < 1:3652420/150‑1 (MQ=255) ttATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTc < 1:3227509/150‑1 (MQ=255) ttATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTc < 2:1566205/150‑1 (MQ=255) tataCAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCg < 2:3602917/150‑1 (MQ=255) tataCAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATAACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCCGCCGGTAGAGTTTCg > 2:174174/1‑150 (MQ=255) tataCAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATAACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCg < 2:2721451/150‑1 (MQ=255) aCAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCa < 1:4616546/150‑1 (MQ=255) cAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTa > 1:4774281/1‑150 (MQ=255) cAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTa < 2:49026/150‑1 (MQ=255) tcGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATctct > 1:3820218/1‑150 (MQ=255) cGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTg < 1:4643527/150‑1 (MQ=255) 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aCTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGAt > 1:3130930/1‑150 (MQ=255) aCTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGAt < 2:1247173/150‑1 (MQ=255) aCTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGAt < 2:1163285/150‑1 (MQ=255) tttttACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATaa > 1:1885544/1‑150 (MQ=255) ttACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACa < 2:421470/150‑1 (MQ=255) ttACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACa > 2:4129132/1‑150 (MQ=255) ttACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATAACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACa > 1:2720223/1‑150 (MQ=255) ccGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATcc > 1:1409625/1‑150 (MQ=255) ccGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATAACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATcc < 1:1329227/150‑1 (MQ=255) cGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCca < 1:894663/150‑1 (MQ=255) gAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCcag > 2:1206669/1‑150 (MQ=255) gAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCcag < 2:3267485/150‑1 (MQ=255) aaTGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCcagc > 2:4444377/1‑150 (MQ=255) aaTGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCcagc > 2:82026/1‑150 (MQ=255) tGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCcagcag > 1:4851699/1‑150 (MQ=255) 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ggATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTc > 2:2184793/1‑150 (MQ=255) gATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTcc < 2:4588537/150‑1 (MQ=255) aTAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCa < 1:669581/150‑1 (MQ=255) tAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAg > 2:1355023/1‑150 (MQ=255) tAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAg > 1:4808719/1‑150 (MQ=255) 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cGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAAc < 2:3336100/150‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAAc < 1:1010383/150‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAAc < 1:144190/150‑1 (MQ=255) cGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAAc < 2:1644768/150‑1 (MQ=255) cTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACgt > 2:4610642/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |