| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,355,349 | 0 | T | A | 27.3% | 332.0 / 151.0 | 172 | intergenic (‑184/‑28) | puuA/puuD | glutamate‑‑putrescine ligase/gamma‑glutamyl‑gamma‑aminobutyrate hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (77/47); new base A (28/19); total (106/66) | |||||||||||
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Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
TCAAAGCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAGGCGGCTT > CP009273/1355200‑1355498 | cAAAGCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATa < 1:3950001/150‑1 (MQ=255) aaaGCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATaa < 1:3747475/150‑1 (MQ=255) aaGCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGAAAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATAATGAACATAAATGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAAt > 1:2133442/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |